------------------------------------------------------------ Pratt version 2.1, Sept. 1996 Written by Inge Jonassen, University of Bergen Norway email: inge@ii.uib.no For more information, see http://www.ii.uib.no/~inge/Pratt.html ------------------------------------------------------------ Please quote: I.Jonassen, J.F.Collins, D.G.Higgins. Protein Science 1995;4(8):1587-1595. ------------------------------------------------------------ Pratt version 2.1 Analysing 15 sequences from file T2SP_F PATTERN CONSERVATION: CM: min Nr of Seqs to Match 15 C%: min Percentage Seqs to Match 100.0 PATTERN RESTRICTIONS : PP: pos in seq [off,complete,start] off PL: max Pattern Length 50 PN: max Nr of Pattern Symbols 50 PX: max Nr of consecutive x's 5 FN: max Nr of flexible spacers 2 FL: max Flexibility 2 FP: max Flex.Product 10 BI: Input Pattern Symbol File off BN: Nr of Pattern Symbols Initial Search 20 PATTERN SCORING: S: Scoring [info,mdl,tree,dist,ppv] info SEARCH PARAMETERS: G: Pattern Graph from [seq,al,query] seq E: Search Greediness 3 R: Pattern Refinement on RG: Generalise ambiguous symbols off OUTPUT: OF: Output Filename T2SP_F.pratt2 OP: PROSITE Pattern Format on ON: max number patterns 20 OA: max number Alignments 20 M: Print Patterns in sequences off Sequence lengths: CMG2_BACSU 323 GSPF_AERHY 388 GSPF_ECOLI 398 GSPF_ERWCA 408 GSPF_ERWCH 404 GSPF_KLEPN 381 GSPF_PSEAE 405 GSPF_VIBCH 406 GSPF_XANCP 390 HOFC_ECOLI 380 HOFC_HAEIN 406 PILC_PSEAE 406 PILC_PSEPU 401 TAPC_AERHY 413 TCPE_VIBCH 340 Pratt run started at Thu Feb 6 21:21:27 1997 Best Patterns before refinement: fitness hits(seqs) Pattern 1: 12.5102 31( 15) G-x(2)-L-x(3)-L 2: 12.0102 29( 15) L-x(2,3)-L-V 3: 12.0102 35( 15) L-x(2)-L-x(2,3)-L 4: 12.0102 22( 15) A-x(4)-G-x(1,2)-L 5: 12.0102 57( 15) G-x(1,2)-L-x(3)-L 6: 12.0102 43( 15) E-x(3,4)-L-x(3)-L 7: 12.0102 36( 15) L-x(2)-L-x(3,4)-L 8: 12.0102 44( 15) L-x(2,3)-L-L 9: 12.0102 35( 15) L-x(1,2)-L-L 10: 12.0102 34( 15) L-x(5)-L-x(3,4)-L 11: 12.0102 30( 15) L-L-x(3,4)-I 12: 12.0102 34( 15) G-x(2)-L-x(2,3)-L 13: 12.0102 37( 15) G-x(2,3)-L-x(3)-L 14: 12.0102 21( 15) G-x(4,5)-L-x(2)-L 15: 11.5102 38( 15) V-x(0,1)-L-x(2,3)-V 16: 11.5102 83( 15) L-x(3,4)-L-x(1,2)-L 17: 11.5102 86( 15) L-x(2,3)-L-x(2,3)-L 18: 11.5102 39( 15) I-x(0,1)-L-x(0,1)-L 19: 11.5102 28( 15) I-x-L-x(0,2)-L 20: 11.5102 33( 15) I-x(3,4)-L-x(1,2)-L Best Patterns (after refinement phase): fitness hits(seqs) Pattern A 1: 17.7008 22( 15) G-x-[PST]-L-x(2)-[AGS]-L B 2: 14.6074 25( 15) G-x-[PST]-L-x(2,3)-L C 3: 14.1936 29( 15) G-x(2,3)-L-x(2)-[AGSV]-L D 4: 13.8739 26( 15) E-x(3,4)-L-x(3)-L-x(4)-[DEPST] E 5: 13.7494 52( 15) L-x(2,3)-L-x(2,3)-L-[AILV] F 6: 13.6657 32( 15) G-x(1,2)-L-x-[ADEGQS]-x-L G 7: 13.4259 48( 15) L-x(3,4)-L-x(1,2)-L-[AILPV] H 8: 12.0102 29( 15) L-x(2,3)-L-V I 9: 12.0102 35( 15) L-x(2)-L-x(2,3)-L J 10: 12.0102 22( 15) A-x(4)-G-x(1,2)-L K 11: 12.0102 36( 15) L-x(2)-L-x(3,4)-L L 12: 12.0102 44( 15) L-x(2,3)-L-L M 13: 12.0102 35( 15) L-x(1,2)-L-L N 14: 12.0102 34( 15) L-x(5)-L-x(3,4)-L O 15: 12.0102 30( 15) L-L-x(3,4)-I P 16: 12.0102 21( 15) G-x(4,5)-L-x(2)-L Q 17: 11.5102 38( 15) V-x(0,1)-L-x(2,3)-V R 18: 11.5102 39( 15) I-x(0,1)-L-x(0,1)-L S 19: 11.5102 28( 15) I-x-L-x(0,2)-L T 20: 11.5102 33( 15) I-x(3,4)-L-x(1,2)-L Best patterns with alignements: fitness hits(seqs) Pattern A 1: 17.7008 22( 15) G-x-[PST]-L-x(2)-[AGS]-L Occurences: 22(15) CMG2_BACSU : 5- 12: mtag GyTLldGL rlmel GSPF_AERHY : 97- 104: skvve GySLadSL gafph GSPF_AERHY : 300- 307: ervre GtSLrkAL detki GSPF_ECOLI : 108- 115: saile GhPLsdAL qhfpt GSPF_ERWCA : 320- 327: davre GvSLhkAL eqtal GSPF_ERWCH : 318- 325: davre GvTLhkAL eqtal GSPF_KLEPN : 293- 300: davre GvSLhrAL emtql GSPF_PSEAE : 115- 122: akvle GhSLagSL refpt GSPF_PSEAE : 285- 292: iltrs GvPLveAL aiaae GSPF_PSEAE : 318- 325: qkvre GaSLtrSL eatgq GSPF_VIBCH : 115- 122: akvte GyTLsdSL gdyph GSPF_VIBCH : 225- 232: flqhw GiSLlvGL lmliy GSPF_VIBCH : 318- 325: envre GsSLrkAL eqtkl GSPF_XANCP : 68- 75: tliga GqPLdrAL silmd HOFC_ECOLI : 54- 61: tllka GlTLseGL allae HOFC_HAEIN : 277- 284: imlqa GvPLnqAL dsflp PILC_PSEAE : 115- 122: qevss GnSLanSL rkkpq PILC_PSEAE : 286- 293: ttfaa GvPLvdAL dsvsg PILC_PSEPU : 282- 289: tsyaa GvPLldAL gtvak TAPC_AERHY : 89- 96: tmlsa GvPLvqSL qiiar TAPC_AERHY : 293- 300: ttfsa GiPLvdAL isaag TCPE_VIBCH : 157- 164: alynl GfSLyeGL wikvl B 2: 14.6074 25( 15) G-x-[PST]-L-x(2,3)-L Occurences: 25(15) CMG2_BACSU : 5- 12: mtag GyTLldgL rlmel GSPF_AERHY : 97- 104: skvve GySLadsL gafph GSPF_AERHY : 300- 307: ervre GtSLrkaL detki GSPF_ECOLI : 108- 115: saile GhPLsdaL qhfpt GSPF_ERWCA : 320- 327: davre GvSLhkaL eqtal GSPF_ERWCH : 318- 325: davre GvTLhkaL eqtal GSPF_KLEPN : 293- 300: davre GvSLhraL emtql GSPF_PSEAE : 115- 122: akvle GhSLagsL refpt GSPF_PSEAE : 204- 210: vfids GqTLpl-L trvli GSPF_PSEAE : 285- 292: iltrs GvPLveaL aiaae GSPF_PSEAE : 318- 325: qkvre GaSLtrsL eatgq GSPF_VIBCH : 82- 89: tlvqs GmPLeecL ravae GSPF_VIBCH : 115- 122: akvte GyTLsdsL gdyph GSPF_VIBCH : 225- 232: flqhw GiSLlvgL lmliy GSPF_VIBCH : 318- 325: envre GsSLrkaL eqtkl GSPF_XANCP : 68- 75: tliga GqPLdraL silmd HOFC_ECOLI : 54- 61: tllka GlTLsegL allae HOFC_HAEIN : 170- 177: psmvl GiSLlltL alllf HOFC_HAEIN : 277- 284: imlqa GvPLnqaL dsflp PILC_PSEAE : 115- 122: qevss GnSLansL rkkpq PILC_PSEAE : 286- 293: ttfaa GvPLvdaL dsvsg PILC_PSEPU : 282- 289: tsyaa GvPLldaL gtvak TAPC_AERHY : 89- 96: tmlsa GvPLvqsL qiiar TAPC_AERHY : 293- 300: ttfsa GiPLvdaL isaag TCPE_VIBCH : 157- 164: alynl GfSLyegL wikvl C 3: 14.1936 29( 15) G-x(2,3)-L-x(2)-[AGSV]-L Occurences: 29(15) CMG2_BACSU : 4- 12: mta GgytLldGL rlmel CMG2_BACSU : 5- 12: mtag Gyt-LldGL rlmel GSPF_AERHY : 97- 104: skvve Gys-LadSL gafph GSPF_AERHY : 300- 307: ervre Gts-LrkAL detki GSPF_ECOLI : 108- 115: saile Ghp-LsdAL qhfpt GSPF_ERWCA : 320- 327: davre Gvs-LhkAL eqtal GSPF_ERWCH : 318- 325: davre Gvt-LhkAL eqtal GSPF_ERWCH : 382- 389: vvsma Giv-LfiVL ailqp GSPF_KLEPN : 293- 300: davre Gvs-LhrAL emtql GSPF_KLEPN : 359- 366: vvama Gmv-LfiVL ailqp GSPF_PSEAE : 115- 122: akvle Ghs-LagSL refpt GSPF_PSEAE : 285- 292: iltrs Gvp-LveAL aiaae GSPF_PSEAE : 318- 325: qkvre Gas-LtrSL eatgq GSPF_PSEAE : 383- 391: mlifm GavvLviVL aillp GSPF_VIBCH : 115- 122: akvte Gyt-LsdSL gdyph GSPF_VIBCH : 225- 232: flqhw Gis-LlvGL lmliy GSPF_VIBCH : 318- 325: envre Gss-LrkAL eqtkl GSPF_XANCP : 68- 75: tliga Gqp-LdrAL silmd GSPF_XANCP : 303- 310: ddvkn Ghg-LsmSL argkr HOFC_ECOLI : 54- 61: tllka Glt-LseGL allae HOFC_HAEIN : 217- 224: lkqni Gil-LffVL sfflf HOFC_HAEIN : 277- 284: imlqa Gvp-LnqAL dsflp PILC_PSEAE : 115- 122: qevss Gns-LanSL rkkpq PILC_PSEAE : 286- 293: ttfaa Gvp-LvdAL dsvsg PILC_PSEPU : 111- 118: qdvas Glg-LadAL qrhpg PILC_PSEPU : 282- 289: tsyaa Gvp-LldAL gtvak TAPC_AERHY : 89- 96: tmlsa Gvp-LvqSL qiiar TAPC_AERHY : 293- 300: ttfsa Gip-LvdAL isaag TCPE_VIBCH : 157- 164: alynl Gfs-LyeGL wikvl D 4: 13.8739 26( 15) E-x(3,4)-L-x(3)-L-x(4)-[DEPST] Occurences: 26(15) CMG2_BACSU : 226- 239: pfyrc Eaeq-LierLkageS iesai GSPF_AERHY : 123- 137: mvaag EksghLekvLnrlaD yteqr GSPF_AERHY : 325- 339: miasg EqsgeLdsmLeraaD nqdre GSPF_ECOLI : 107- 120: rsail Eghp-LsdaLqhfpT lfdsl GSPF_ECOLI : 134- 148: lvkag EksglLapvLeklaD ynenr GSPF_ERWCA : 143- 157: mvaag EtsghLdavLnrlaD yteqr GSPF_ERWCA : 345- 359: miasg ErsgeLdsmLeraaD nqdre GSPF_ERWCH : 141- 155: mvaag EasghLdavLnrlaD yteqr GSPF_KLEPN : 318- 332: mvasg ErsgeLnsmLeraaD nqdrd GSPF_PSEAE : 114- 127: rakvl Eghs-LagsLrefpT afpel GSPF_PSEAE : 141- 155: tvaag EhaghLgpvLeqlaD yteqr GSPF_VIBCH : 141- 155: mvaag EksghLdsvLerlaD yaenr GSPF_VIBCH : 343- 357: miasg EqsgeLegmLtraaD nqdns GSPF_XANCP : 328- 342: miqvg EesaaLdtmLlktaD tfele GSPF_XANCP : 329- 342: iqvge Esaa-LdtmLlktaD tfele HOFC_ECOLI : 42- 56: gdksa EvihqLatlLkaglT lsegl HOFC_ECOLI : 302- 315: lkntg Efsp-LclqLvrtgE asgsl HOFC_ECOLI : 333- 347: ahhhr EntmaLadnLaallE palli HOFC_HAEIN : 61- 75: nseis EllnqLatlLqsaiP lknsl HOFC_HAEIN : 344- 358: mlqig EqsgkLalmLehiaE nyqek PILC_PSEAE : 141- 155: lvdag EqsgaLenlLdrvaT ykekt PILC_PSEAE : 344- 358: mtaig EesgsLdemLskvaS yyeee PILC_PSEAE : 345- 358: taige Esgs-LdemLskvaS yyeee PILC_PSEPU : 340- 354: lvaig EssgtLdqmLekaaS hyeeq TAPC_AERHY : 370- 383: tifeq Evdd-LvdgLtsllE plimv TCPE_VIBCH : 11- 25: kkyrl ElysmLvdlLndniP lydal E 5: 13.7494 52( 15) L-x(2,3)-L-x(2,3)-L-[AILV] Occurences: 52(15) CMG2_BACSU : 306- 314: vaami LlvyLsm-LV pmyqm CMG2_BACSU : 307- 314: aamil Lvy-Lsm-LV pmyqm GSPF_AERHY : 128- 136: eksgh LekvLnr-LA dyteq GSPF_ECOLI : 121- 130: qhfpt LfdsLyrtLV kagek GSPF_ECOLI : 139- 147: eksgl LapvLek-LA dynen GSPF_ECOLI : 250- 259: fhaml LrvaLigpLI cains GSPF_ERWCA : 70- 78: lstsd Lal-LtrqLA tlvaa GSPF_ERWCA : 73- 81: sdlal LtrqLat-LV aasmp GSPF_ERWCA : 148- 156: etsgh LdavLnr-LA dyteq GSPF_ERWCA : 371- 380: ssqmt LalgLfepLL vvsma GSPF_ERWCH : 69- 77: riasd Lal-LtrqLA tlvaa GSPF_ERWCH : 72- 80: sdlal LtrqLat-LV aalpl GSPF_ERWCH : 146- 154: easgh LdavLnr-LA dyteq GSPF_ERWCH : 367- 376: saqmt LvlgLfepLL vvsma GSPF_KLEPN : 204- 213: agpwl LlaiLlliLL lryll GSPF_KLEPN : 205- 213: gpwll LailLli-LL lryll GSPF_KLEPN : 205- 213: gpwll Lai-LlliLL lryll GSPF_KLEPN : 205- 214: gpwll LailLlilLL ryllr GSPF_KLEPN : 209- 218: llail LlilLlryLL rqpak GSPF_KLEPN : 210- 218: laill LillLry-LL rqpak GSPF_KLEPN : 210- 218: laill Lil-LlryLL rqpak GSPF_KLEPN : 344- 353: saqiq LalsLfepLL vvama GSPF_PSEAE : 146- 154: ehagh LgpvLeq-LA dyteq GSPF_PSEAE : 207- 215: dsgqt Lpl-LtrvLI gvsdw GSPF_PSEAE : 257- 266: whgfl LrvpLvgrLV rstdt GSPF_PSEAE : 387- 395: mgavv LvivLai-LL pilsl GSPF_VIBCH : 146- 154: eksgh LdsvLer-LA dyaen GSPF_VIBCH : 228- 236: hwgis LlvgLlm-LI ylvrw GSPF_VIBCH : 229- 236: wgisl Lvg-Llm-LI ylvrw GSPF_VIBCH : 232- 239: sllvg Llm-Liy-LV rwllt GSPF_VIBCH : 235- 243: vgllm Liy-LvrwLL tkpdi GSPF_XANCP : 259- 267: letar LtrtLgt-LL rngvp GSPF_XANCP : 356- 363: aidra Laa-Lvp-LI tlvla GSPF_XANCP : 359- 366: ralaa Lvp-Lit-LV lasvv HOFC_ECOLI : 57- 65: kaglt LsegLal-LA eqhps HOFC_ECOLI : 199- 207: gewsw Llv-LfgfLL aiank HOFC_ECOLI : 320- 328: easgs LdlmLdn-LA hhhre HOFC_ECOLI : 338- 346: entma LadnLaa-LL epall HOFC_ECOLI : 342- 351: aladn LaalLepaLL iitgg HOFC_HAEIN : 62- 70: seise LlnqLat-LL qsaip HOFC_HAEIN : 63- 70: eisel Lnq-Lat-LL qsaip HOFC_HAEIN : 92- 100: ctqiv LnewLer-LL qsies HOFC_HAEIN : 169- 178: ypsmv LgisLlltLA lllfi HOFC_HAEIN : 173- 181: vlgis LlltLal-LL fivpq HOFC_HAEIN : 174- 181: lgisl Llt-Lal-LL fivpq PILC_PSEAE : 383- 391: mimav Lgv-LvggLI vamyl PILC_PSEPU : 142- 150: eqsgt LdrqLeq-LA gmleq PILC_PSEPU : 149- 158: rqleq LagmLeqrLA lhkkl PILC_PSEPU : 327- 336: maaep LfppLlvqLV aiges PILC_PSEPU : 364- 371: qvsqa Ldq-Lts-LL epaiv PILC_PSEPU : 379- 387: aivlv Lgl-LvggLV vamyl TAPC_AERHY : 374- 382: qevdd LvdgLts-LL eplim TAPC_AERHY : 378- 386: dlvdg LtslLep-LI mvvlg TAPC_AERHY : 378- 386: dlvdg Lts-LlepLI mvvlg TCPE_VIBCH : 12- 20: kyrle LysmLvd-LL ndnip TCPE_VIBCH : 62- 70: ksnss LtdaLtg-LI pdkev F 6: 13.6657 32( 15) G-x(1,2)-L-x-[ADEGQS]-x-L Occurences: 32(15) CMG2_BACSU : 5- 12: mtag GytLlDgL rlmel CMG2_BACSU : 261- 267: kvish Gq-LsGrL drelf GSPF_AERHY : 97- 104: skvve GysLaDsL gafph GSPF_AERHY : 328- 334: sgeqs Ge-LdSmL eraad GSPF_ECOLI : 108- 115: saile GhpLsDaL qhfpt GSPF_ERWCA : 146- 152: agets Gh-LdAvL nrlad GSPF_ERWCA : 348- 354: sgers Ge-LdSmL eraad GSPF_ERWCH : 144- 150: ageas Gh-LdAvL nrlad GSPF_KLEPN : 321- 327: sgers Ge-LnSmL eraad GSPF_PSEAE : 115- 122: akvle GhsLaGsL refpt GSPF_PSEAE : 285- 292: iltrs GvpLvEaL aiaae GSPF_PSEAE : 346- 352: sgers Ge-LdQmL artar GSPF_VIBCH : 82- 89: tlvqs GmpLeEcL ravae GSPF_VIBCH : 115- 122: akvte GytLsDsL gdyph GSPF_VIBCH : 144- 150: ageks Gh-LdSvL erlad GSPF_VIBCH : 346- 352: sgeqs Ge-LeGmL traad GSPF_XANCP : 248- 254: rqkvi Gs-LiArL etarl HOFC_ECOLI : 54- 61: tllka GltLsEgL allae HOFC_ECOLI : 112- 118: amirt Ge-LtGkL deccf HOFC_HAEIN : 277- 284: imlqa GvpLnQaL dsflp PILC_PSEAE : 286- 293: ttfaa GvpLvDaL dsvsg PILC_PSEAE : 347- 353: igees Gs-LdEmL skvas PILC_PSEAE : 384- 390: imavl Gv-LvGgL ivamy PILC_PSEPU : 40- 46: gllrq Gi-LvArL rpagr PILC_PSEPU : 111- 118: qdvas GlgLaDaL qrhpg PILC_PSEPU : 151- 157: leqla Gm-LeQrL alhkk PILC_PSEPU : 282- 289: tsyaa GvpLlDaL gtvak PILC_PSEPU : 343- 349: igess Gt-LdQmL ekaas PILC_PSEPU : 380- 386: ivlvl Gl-LvGgL vvamy TAPC_AERHY : 89- 96: tmlsa GvpLvQsL qiiar TAPC_AERHY : 293- 300: ttfsa GipLvDaL isaag TCPE_VIBCH : 157- 164: alynl GfsLyEgL wikvl G 7: 13.4259 48( 15) L-x(3,4)-L-x(1,2)-L-[AILPV] Occurences: 48(15) CMG2_BACSU : 91- 98: qlkrv Lryp-Lf-LI ftvav CMG2_BACSU : 306- 314: vaami Llvy-LsmLV pmyqm GSPF_AERHY : 52- 61: tsela LitrqLatLV gaglt GSPF_AERHY : 128- 136: eksgh Lekv-LnrLA dyteq GSPF_ECOLI : 31- 39: qarlr LreegLf-LL dirpq GSPF_ECOLI : 138- 147: geksg LlapvLekLA dynen GSPF_ECOLI : 139- 147: eksgl Lapv-LekLA dynen GSPF_ERWCA : 65- 73: rrkir LstsdLa-LL trqla GSPF_ERWCA : 72- 81: tsdla LltrqLatLV aasmp GSPF_ERWCA : 73- 81: sdlal Ltrq-LatLV aasmp GSPF_ERWCA : 148- 156: etsgh Ldav-LnrLA dyteq GSPF_ERWCH : 71- 80: asdla LltrqLatLV aalpl GSPF_ERWCH : 72- 80: sdlal Ltrq-LatLV aalpl GSPF_ERWCH : 146- 154: easgh Ldav-LnrLA dyteq GSPF_KLEPN : 65- 74: ardla LvtrqLatLV aaaip GSPF_KLEPN : 203- 211: aagpw LllaiLl-LI lllry GSPF_KLEPN : 204- 211: agpwl Llai-Ll-LI lllry GSPF_KLEPN : 204- 213: agpwl LlailLliLL lryll GSPF_KLEPN : 205- 213: gpwll LaillLi-LL lryll GSPF_KLEPN : 205- 213: gpwll Lail-LliLL lryll GSPF_KLEPN : 205- 214: gpwll LaillLilLL ryllr GSPF_KLEPN : 209- 218: llail LlillLryLL rqpak GSPF_KLEPN : 210- 218: laill Lill-LryLL rqpak GSPF_KLEPN : 230- 237: lawhr Lllr-Lp-LI grvar GSPF_PSEAE : 63- 71: tfarg LsardLa-LV trqla GSPF_PSEAE : 70- 79: ardla LvtrqLatLV qaalp GSPF_PSEAE : 146- 154: ehagh Lgpv-LeqLA dyteq GSPF_PSEAE : 387- 395: mgavv Lviv-LaiLL pilsl GSPF_PSEAE : 395- 404: vlail LpilsLnqLV g GSPF_VIBCH : 70- 79: tpdla LitrqLatLV qsgmp GSPF_VIBCH : 146- 154: eksgh Ldsv-LerLA dyaen GSPF_VIBCH : 228- 236: hwgis LlvglLm-LI ylvrw GSPF_VIBCH : 228- 236: hwgis Llvg-LlmLI ylvrw GSPF_VIBCH : 229- 236: wgisl Lvgl-Lm-LI ylvrw GSPF_XANCP : 259- 267: letar Ltrt-LgtLL rngvp HOFC_ECOLI : 57- 64: kaglt Lseg-La-LL aeqhp HOFC_ECOLI : 57- 65: kaglt Lseg-LalLA eqhps HOFC_ECOLI : 320- 328: easgs Ldlm-LdnLA hhhre HOFC_ECOLI : 338- 346: entma Ladn-LaaLL epall HOFC_HAEIN : 62- 70: seise Llnq-LatLL qsaip HOFC_HAEIN : 92- 100: ctqiv Lnew-LerLL qsies HOFC_HAEIN : 169- 178: ypsmv LgislLltLA lllfi HOFC_HAEIN : 173- 180: vlgis Lllt-La-LL lfivp HOFC_HAEIN : 173- 181: vlgis Lllt-LalLL fivpq PILC_PSEAE : 253- 261: kfrdt LdrtiLk-LP ifggi PILC_PSEPU : 142- 150: eqsgt Ldrq-LeqLA gmleq PILC_PSEPU : 327- 336: maaep LfpplLvqLV aiges PILC_PSEPU : 392- 401: vvamy LpifqLgsLI TAPC_AERHY : 374- 382: qevdd Lvdg-LtsLL eplim TAPC_AERHY : 378- 386: dlvdg Ltsl-LepLI mvvlg TAPC_AERHY : 385- 394: sllep LimvvLgvLV ggmvv TAPC_AERHY : 403- 412: vvamy LpifkLgdLV g TCPE_VIBCH : 12- 20: kyrle Lysm-LvdLL ndnip TCPE_VIBCH : 62- 70: ksnss Ltda-LtgLI pdkev H 8: 12.0102 29( 15) L-x(2,3)-L-V Occurences: 29(15) CMG2_BACSU : 180- 185: cirip LvgkLV klfns CMG2_BACSU : 310- 314: illvy Lsm-LV pmyqm GSPF_AERHY : 57- 61: litrq Lat-LV gaglt GSPF_AERHY : 83- 87: cekah Lrs-LV atvrs GSPF_ECOLI : 125- 130: tlfds LyrtLV kagek GSPF_ERWCA : 77- 81: lltrq Lat-LV aasmp GSPF_ERWCH : 76- 80: lltrq Lat-LV aalpl GSPF_KLEPN : 70- 74: lvtrq Lat-LV aaaip GSPF_PSEAE : 75- 79: lvtrq Lat-LV qaalp GSPF_PSEAE : 257- 262: whgfl LrvpLV grlvr GSPF_PSEAE : 261- 266: llrvp LvgrLV rstdt GSPF_PSEAE : 400- 404: lpils Lnq-LV g GSPF_VIBCH : 75- 79: litrq Lat-LV qsgmp GSPF_VIBCH : 235- 239: vgllm Liy-LV rwllt GSPF_XANCP : 356- 360: aidra Laa-LV plitl GSPF_XANCP : 362- 366: aalvp Lit-LV lasvv HOFC_ECOLI : 306- 311: gefsp LclqLV rtgea HOFC_HAEIN : 260- 264: gtiqk Lsr-LV nfsqs PILC_PSEAE : 132- 137: qyfde LycnLV dageq PILC_PSEAE : 383- 387: mimav Lgv-LV ggliv PILC_PSEPU : 128- 133: gwfdt LycnLV rvgeq PILC_PSEPU : 331- 336: plfpp LlvqLV aiges PILC_PSEPU : 332- 336: lfppl Lvq-LV aiges PILC_PSEPU : 379- 383: aivlv Lgl-LV gglvv PILC_PSEPU : 382- 387: lvlgl LvggLV vamyl TAPC_AERHY : 139- 144: rhfda LycdLV eageq TAPC_AERHY : 390- 394: limvv Lgv-LV ggmvv TAPC_AERHY : 408- 412: lpifk Lgd-LV g TCPE_VIBCH : 12- 17: kyrle LysmLV dllnd I 9: 12.0102 35( 15) L-x(2)-L-x(2,3)-L Occurences: 35(15) CMG2_BACSU : 307- 313: aamil LvyLsm-L vpmyq GSPF_AERHY : 208- 214: mqhyg LwfLll-L figgf GSPF_ECOLI : 207- 214: lstri LlgLsdtL qrtgp GSPF_ECOLI : 268- 274: nsary LrtLsi-L qssgv GSPF_ECOLI : 387- 393: ivvsv LqpLlq-L nsmin GSPF_ERWCA : 70- 77: lstsd LalLtrqL atlva GSPF_ERWCA : 393- 400: vlfiv LaiLqpiL qlntl GSPF_ERWCH : 69- 76: riasd LalLtrqL atlva GSPF_ERWCH : 76- 83: lltrq LatLvaaL pleea GSPF_ERWCH : 389- 396: vlfiv LaiLqpiL qlntl GSPF_KLEPN : 205- 212: gpwll LaiLlliL llryl GSPF_KLEPN : 210- 217: laill LilLlryL lrqpa GSPF_KLEPN : 366- 373: vlfiv LaiLqpiL qlntl GSPF_PSEAE : 207- 214: dsgqt LplLtrvL igvsd GSPF_PSEAE : 391- 398: vlviv LaiLlpiL slnql GSPF_VIBCH : 229- 235: wgisl LvgLlm-L iylvr GSPF_VIBCH : 232- 238: sllvg LlmLiy-L vrwll GSPF_VIBCH : 235- 242: vgllm LiyLvrwL ltkpd GSPF_XANCP : 75- 81: pldra LsiLmd-L peddk GSPF_XANCP : 135- 142: smqdt LqrLadyL ersra GSPF_XANCP : 356- 362: aidra LaaLvp-L itlvl GSPF_XANCP : 359- 365: ralaa LvpLit-L vlasv GSPF_XANCP : 379- 385: viisv LvpLyd-L tnaig HOFC_ECOLI : 77- 84: qwqal LqsLahdL eqgia HOFC_ECOLI : 199- 206: gewsw LlvLfgfL laian HOFC_HAEIN : 63- 69: eisel LnqLat-L lqsai HOFC_HAEIN : 63- 70: eisel LnqLatlL qsaip HOFC_HAEIN : 174- 180: lgisl LltLal-L lfivp HOFC_HAEIN : 174- 181: lgisl LltLallL fivpq PILC_PSEAE : 383- 390: mimav LgvLvggL ivamy PILC_PSEPU : 146- 153: tldrq LeqLagmL eqrla PILC_PSEPU : 171- 178: amiyp LllLltgL gvsav PILC_PSEPU : 172- 178: miypl LllLtg-L gvsav PILC_PSEPU : 364- 370: qvsqa LdqLts-L lepai PILC_PSEPU : 364- 371: qvsqa LdqLtslL epaiv PILC_PSEPU : 379- 386: aivlv LglLvggL vvamy TAPC_AERHY : 378- 385: dlvdg LtsLlepL imvvl TCPE_VIBCH : 153- 160: gvtqa LynLgfsL yeglw J 10: 12.0102 22( 15) A-x(4)-G-x(1,2)-L Occurences: 22(15) CMG2_BACSU : 286- 293: rlehk AqkwtGi-L qpmiy GSPF_AERHY : 121- 128: rsmva AgeksGh-L ekvln GSPF_ECOLI : 7- 15: nyryr AmtqdGqkL qgiid GSPF_ECOLI : 132- 139: rtlvk AgeksGl-L apvle GSPF_ERWCA : 141- 148: camva AgetsGh-L davln GSPF_ERWCH : 49- 57: eqrge AaprsGfsL sfgrs GSPF_ERWCH : 110- 118: maavr AkvveGhsL aeamg GSPF_ERWCH : 139- 146: camva AgeasGh-L davln GSPF_ERWCH : 291- 299: vpllq AmrisGdvL tndya GSPF_KLEPN : 134- 142: camva AgeasGhrL lqami GSPF_PSEAE : 110- 118: llavr AkvleGhsL agslr GSPF_PSEAE : 139- 146: ratva AgehaGh-L gpvle GSPF_VIBCH : 110- 118: lvavr AkvteGytL sdslg GSPF_VIBCH : 139- 146: rsmva AgeksGh-L dsvle GSPF_XANCP : 198- 205: pwftq AvlsvGl-L vrdww HOFC_ECOLI : 107- 114: pplyq AmirtGe-L tgkld HOFC_HAEIN : 112- 120: lafsq AieqqGkyL tqqei PILC_PSEAE : 139- 146: cnlvd AgeqsGa-L enlld PILC_PSEPU : 30- 37: agrsp AyvraGl-L rqgil PILC_PSEPU : 293- 300: algtv AkasgGe-L hqqai TAPC_AERHY : 146- 153: cdlve AgeqsGa-L etiyd TCPE_VIBCH : 152- 160: pgvtq AlynlGfsL yeglw K 11: 12.0102 36( 15) L-x(2)-L-x(3,4)-L Occurences: 36(15) CMG2_BACSU : 9- 17: ggytl LdgLrlmeL qmnkr CMG2_BACSU : 197- 205: ffslq LssLlksgL siyds GSPF_AERHY : 57- 65: litrq LatLvgagL tieea GSPF_ECOLI : 68- 76: lftrq LatLsaaaL plees GSPF_ECOLI : 207- 214: lstri LlgLsdt-L qrtgp GSPF_ERWCA : 70- 77: lstsd LalLtrq-L atlva GSPF_ERWCA : 393- 400: vlfiv LaiLqpi-L qlntl GSPF_ERWCH : 69- 76: riasd LalLtrq-L atlva GSPF_ERWCH : 76- 83: lltrq LatLvaa-L pleea GSPF_ERWCH : 389- 396: vlfiv LaiLqpi-L qlntl GSPF_KLEPN : 205- 212: gpwll LaiLlli-L llryl GSPF_KLEPN : 205- 213: gpwll LaiLllilL lryll GSPF_KLEPN : 209- 217: llail LliLllryL lrqpa GSPF_KLEPN : 210- 217: laill LilLlry-L lrqpa GSPF_KLEPN : 210- 218: laill LilLlrylL rqpak GSPF_KLEPN : 366- 373: vlfiv LaiLqpi-L qlntl GSPF_PSEAE : 75- 83: lvtrq LatLvqaaL pieea GSPF_PSEAE : 169- 177: rqkiq LalLypviL mvasl GSPF_PSEAE : 207- 214: dsgqt LplLtrv-L igvsd GSPF_PSEAE : 391- 398: vlviv LaiLlpi-L slnql GSPF_PSEAE : 395- 403: vlail LpiLslnqL vg GSPF_VIBCH : 235- 242: vgllm LiyLvrw-L ltkpd GSPF_VIBCH : 235- 243: vgllm LiyLvrwlL tkpdi GSPF_XANCP : 135- 142: smqdt LqrLady-L ersra GSPF_XANCP : 359- 367: ralaa LvpLitlvL asvvg HOFC_ECOLI : 47- 55: evihq LatLlkagL tlseg HOFC_ECOLI : 77- 84: qwqal LqsLahd-L eqgia HOFC_ECOLI : 199- 206: gewsw LlvLfgf-L laian HOFC_ECOLI : 199- 207: gewsw LlvLfgflL aiank HOFC_ECOLI : 342- 350: aladn LaaLlepaL liitg HOFC_HAEIN : 63- 70: eisel LnqLatl-L qsaip HOFC_HAEIN : 174- 181: lgisl LltLall-L fivpq PILC_PSEAE : 383- 390: mimav LgvLvgg-L ivamy PILC_PSEPU : 146- 153: tldrq LeqLagm-L eqrla PILC_PSEPU : 171- 178: amiyp LllLltg-L gvsav PILC_PSEPU : 364- 371: qvsqa LdqLtsl-L epaiv PILC_PSEPU : 379- 386: aivlv LglLvgg-L vvamy TAPC_AERHY : 378- 385: dlvdg LtsLlep-L imvvl TAPC_AERHY : 382- 390: gltsl LepLimvvL gvlvg TCPE_VIBCH : 153- 160: gvtqa LynLgfs-L yeglw L 12: 12.0102 44( 15) L-x(2,3)-L-L Occurences: 44(15) CMG2_BACSU : 143- 148: fqhid LviiLL vlfta CMG2_BACSU : 197- 201: ffslq Lss-LL ksgls GSPF_AERHY : 208- 212: mqhyg Lwf-LL llfig GSPF_AERHY : 208- 213: mqhyg LwflLL lfigg GSPF_ECOLI : 387- 391: ivvsv Lqp-LL qlnsm GSPF_ERWCA : 231- 235: fgpwm Lla-LL agfma GSPF_ERWCA : 375- 380: tlalg LfepLL vvsma GSPF_ERWCH : 209- 214: kqalp LstrLL msasd GSPF_ERWCH : 371- 376: tlvlg LfepLL vvsma GSPF_KLEPN : 204- 209: agpwl LlaiLL lilll GSPF_KLEPN : 205- 209: gpwll Lai-LL lilll GSPF_KLEPN : 205- 210: gpwll LailLL illlr GSPF_KLEPN : 208- 213: lllai LlliLL lryll GSPF_KLEPN : 209- 213: llail Lli-LL lryll GSPF_KLEPN : 209- 214: llail LlilLL ryllr GSPF_KLEPN : 210- 214: laill Lil-LL ryllr GSPF_KLEPN : 213- 218: lllil LlryLL rqpak GSPF_KLEPN : 214- 218: llill Lry-LL rqpak GSPF_KLEPN : 348- 353: qlals LfepLL vvama GSPF_PSEAE : 391- 395: vlviv Lai-LL pilsl GSPF_VIBCH : 228- 233: hwgis LlvgLL mliyl GSPF_VIBCH : 229- 233: wgisl Lvg-LL mliyl GSPF_VIBCH : 238- 243: lmliy LvrwLL tkpdi GSPF_XANCP : 40- 44: ngsps Lrm-LL rkkpf GSPF_XANCP : 170- 174: vvgca Llf-LL gyvvp GSPF_XANCP : 200- 205: ftqav LsvgLL vrdww GSPF_XANCP : 237- 242: afraa LdawLL rqkvi GSPF_XANCP : 263- 267: rltrt Lgt-LL rngvp GSPF_XANCP : 333- 338: eesaa LdtmLL ktadt HOFC_ECOLI : 47- 51: evihq Lat-LL kaglt HOFC_ECOLI : 202- 207: swllv LfgfLL aiank HOFC_ECOLI : 342- 346: aladn Laa-LL epall HOFC_ECOLI : 346- 351: nlaal LepaLL iitgg HOFC_HAEIN : 66- 70: ellnq Lat-LL qsaip HOFC_HAEIN : 96- 100: vlnew Ler-LL qsies HOFC_HAEIN : 169- 174: ypsmv LgisLL ltlal HOFC_HAEIN : 175- 180: gisll LtlaLL lfivp HOFC_HAEIN : 177- 181: slllt Lal-LL fivpq PILC_PSEAE : 146- 150: eqsga Len-LL drvat PILC_PSEPU : 71- 75: gfsrq Lat-LL kagvp PILC_PSEPU : 171- 175: amiyp Lll-LL tglgv PILC_PSEPU : 327- 332: maaep LfppLL vqlva PILC_PSEPU : 367- 371: qaldq Lts-LL epaiv PILC_PSEPU : 377- 382: epaiv LvlgLL vgglv TAPC_AERHY : 378- 382: dlvdg Lts-LL eplim TCPE_VIBCH : 16- 20: elysm Lvd-LL ndnip TCPE_VIBCH : 262- 267: dykqa LdtnLL dkkml M 13: 12.0102 35( 15) L-x(1,2)-L-L Occurences: 35(15) CMG2_BACSU : 197- 201: ffslq LssLL ksgls GSPF_AERHY : 208- 212: mqhyg LwfLL llfig GSPF_AERHY : 211- 214: yglwf Ll-LL figgf GSPF_ECOLI : 36- 39: lreeg Lf-LL dirpq GSPF_ECOLI : 387- 391: ivvsv LqpLL qlnsm GSPF_ERWCA : 70- 73: lstsd La-LL trqla GSPF_ERWCA : 231- 235: fgpwm LlaLL agfma GSPF_ERWCA : 232- 235: gpwml La-LL agfma GSPF_ERWCH : 69- 72: riasd La-LL trqla GSPF_KLEPN : 205- 209: gpwll LaiLL lilll GSPF_KLEPN : 209- 213: llail LliLL lryll GSPF_KLEPN : 210- 213: laill Li-LL lryll GSPF_KLEPN : 210- 214: laill LilLL ryllr GSPF_KLEPN : 214- 218: llill LryLL rqpak GSPF_PSEAE : 169- 172: rqkiq La-LL ypvil GSPF_PSEAE : 207- 210: dsgqt Lp-LL trvli GSPF_PSEAE : 391- 395: vlviv LaiLL pilsl GSPF_VIBCH : 229- 233: wgisl LvgLL mliyl GSPF_XANCP : 40- 44: ngsps LrmLL rkkpf GSPF_XANCP : 170- 174: vvgca LlfLL gyvvp GSPF_XANCP : 171- 174: vgcal Lf-LL gyvvp GSPF_XANCP : 263- 267: rltrt LgtLL rngvp HOFC_ECOLI : 47- 51: evihq LatLL kaglt HOFC_ECOLI : 61- 64: tlseg La-LL aeqhp HOFC_ECOLI : 342- 346: aladn LaaLL epall HOFC_HAEIN : 66- 70: ellnq LatLL qsaip HOFC_HAEIN : 96- 100: vlnew LerLL qsies HOFC_HAEIN : 177- 180: slllt La-LL lfivp HOFC_HAEIN : 177- 181: slllt LalLL fivpq PILC_PSEAE : 146- 150: eqsga LenLL drvat PILC_PSEPU : 71- 75: gfsrq LatLL kagvp PILC_PSEPU : 171- 174: amiyp Ll-LL ltglg PILC_PSEPU : 171- 175: amiyp LllLL tglgv PILC_PSEPU : 172- 175: miypl Ll-LL tglgv PILC_PSEPU : 367- 371: qaldq LtsLL epaiv PILC_PSEPU : 379- 382: aivlv Lg-LL vgglv TAPC_AERHY : 378- 382: dlvdg LtsLL eplim TCPE_VIBCH : 16- 20: elysm LvdLL ndnip N 14: 12.0102 34( 15) L-x(5)-L-x(3,4)-L Occurences: 34(15) CMG2_BACSU : 195- 205: syffs LqlsslLksg-L siyds GSPF_AERHY : 202- 212: igtse LmqhygLwfl-L llfig GSPF_AERHY : 202- 213: igtse LmqhygLwfllL lfigg GSPF_ECOLI : 115- 125: plsda LqhfptLfds-L yrtlv GSPF_ECOLI : 281- 292: ssgvp LldgmnLstesL nnlei GSPF_ERWCA : 59- 70: stgls LrrkirLstsdL alltr GSPF_ERWCH : 79- 89: rqlat LvaalpLeea-L davak GSPF_KLEPN : 203- 213: aagpw LllailLlil-L lryll GSPF_KLEPN : 203- 214: aagpw LllailLlillL ryllr GSPF_KLEPN : 204- 214: agpwl LlaillLill-L ryllr GSPF_KLEPN : 208- 218: lllai LllillLryl-L rqpak GSPF_KLEPN : 225- 236: qpakr LawhrlLlrlpL igrva GSPF_KLEPN : 338- 348: nqdrd LsaqiqLals-L fepll GSPF_PSEAE : 57- 68: gqggr LtfargLsardL alvtr GSPF_PSEAE : 171- 182: kiqla LlypviLmvasL aivgf GSPF_PSEAE : 363- 373: nqend LaaqigLmvg-L fepfm GSPF_VIBCH : 232- 242: sllvg LlmliyLvrw-L ltkpd GSPF_VIBCH : 232- 243: sllvg LlmliyLvrwlL tkpdi GSPF_XANCP : 107- 117: plsva LerqhgLfsk-L yinmv GSPF_XANCP : 356- 367: aidra LaalvpLitlvL asvvg HOFC_ECOLI : 51- 61: qlatl LkagltLseg-L allae HOFC_ECOLI : 361- 372: giigt LvvamyLpifhL gdams HOFC_HAEIN : 70- 80: qlatl LqsaipLkns-L qilqq HOFC_HAEIN : 152- 163: hrsqs LalqrkLqkimL ypsmv HOFC_HAEIN : 163- 173: lqkim LypsmvLgis-L lltla HOFC_HAEIN : 163- 174: lqkim LypsmvLgislL ltlal HOFC_HAEIN : 169- 179: ypsmv LgisllLtla-L llfiv HOFC_HAEIN : 169- 180: ypsmv LgisllLtlalL lfivp HOFC_HAEIN : 274- 284: slqim LqagvpLnqa-L dsflp HOFC_HAEIN : 364- 375: nyqek LnhqidLlsqmL eplmm PILC_PSEAE : 390- 401: vlvgg LivamyLpifqL gnvvg PILC_PSEPU : 36- 46: yvrag LlrqgiLvar-L rpagr PILC_PSEPU : 153- 163: qlagm LeqrlaLhkk-L rkami PILC_PSEPU : 371- 381: qltsl LepaivLvlg-L lvggl PILC_PSEPU : 371- 382: qltsl LepaivLvlglL vgglv PILC_PSEPU : 386- 397: llvgg LvvamyLpifqL gsli TAPC_AERHY : 86- 96: qittm LsagvpLvqs-L qiiar TCPE_VIBCH : 10- 20: skkyr LelysmLvdl-L ndnip TCPE_VIBCH : 20- 30: mlvdl LndnipLyda-L nkiqn TCPE_VIBCH : 256- 266: nmqeg LdykqaLdtn-L ldkkm TCPE_VIBCH : 256- 267: nmqeg LdykqaLdtnlL dkkml O 15: 12.0102 30( 15) L-L-x(3,4)-I Occurences: 30(15) CMG2_BACSU : 76- 81: iqsge LLerk-I aqadq GSPF_AERHY : 149- 154: hmrtk LLqam-I ypivl GSPF_AERHY : 211- 216: yglwf LLllf-I ggfvw GSPF_AERHY : 270- 276: asavp LLegmkI agevl GSPF_ECOLI : 221- 227: rtgpt LLatvfI vavgf GSPF_ECOLI : 249- 255: rfham LLrvalI gplic GSPF_ERWCA : 258- 264: sfhrr LLhlplI griar GSPF_ERWCA : 290- 296: asavp LLqamrI sgdvm GSPF_ERWCH : 230- 236: gpwvv LLlvlaI mgfrv GSPF_ERWCH : 231- 236: pwvvl LLvla-I mgfrv GSPF_ERWCH : 288- 294: ssavp LLqamrI sgdvl GSPF_KLEPN : 142- 147: asghr LLqam-I ypivl GSPF_KLEPN : 231- 237: awhrl LLrlplI grvar GSPF_KLEPN : 263- 269: asavp LLlamrI sadvl GSPF_KLEPN : 264- 269: savpl LLamr-I sadvl GSPF_PSEAE : 171- 176: kiqla LLypv-I lmvas GSPF_PSEAE : 209- 215: gqtlp LLtrvlI gvsdw GSPF_VIBCH : 242- 248: ylvrw LLtkpdI rlrwd GSPF_XANCP : 241- 247: aldaw LLrqkvI gslia GSPF_XANCP : 273- 279: rngvp LLaaigI arnvm HOFC_ECOLI : 227- 233: ivrqk LLlripI mgslm HOFC_ECOLI : 228- 233: vrqkl LLrip-I mgslm HOFC_HAEIN : 69- 74: nqlat LLqsa-I plkns PILC_PSEAE : 85- 91: gagvp LLqsfdI igegf PILC_PSEPU : 36- 41: yvrag LLrqg-I lvarl PILC_PSEPU : 184- 189: gvsav LLlev-I pqfqs PILC_PSEPU : 370- 375: dqlts LLepa-I vlvlg TAPC_AERHY : 195- 200: vvtsi LLlfv-I pqfed TAPC_AERHY : 381- 386: dglts LLepl-I mvvlg TCPE_VIBCH : 19- 24: smlvd LLndn-I plyda P 16: 12.0102 21( 15) G-x(4,5)-L-x(2)-L Occurences: 21(15) CMG2_BACSU : 4- 12: mta Ggytl-LdgL rlmel GSPF_AERHY : 126- 135: ageks GhlekvLnrL adyte GSPF_ECOLI : 137- 146: ageks GllapvLekL adyne GSPF_ECOLI : 335- 344: ymvas GeksgqLgtL mvraa GSPF_ERWCA : 146- 155: agets GhldavLnrL adyte GSPF_ERWCA : 227- 235: avrtf Gpwml-LalL agfma GSPF_ERWCH : 144- 153: ageas GhldavLnrL adyte GSPF_ERWCH : 225- 234: avrty GpwvvlLlvL aimgf GSPF_KLEPN : 200- 208: mlraa Gpwll-LaiL llill GSPF_PSEAE : 144- 153: ageha GhlgpvLeqL adyte GSPF_VIBCH : 144- 153: ageks GhldsvLerL adyae GSPF_VIBCH : 372- 381: vnial GiftpaLiaL magmv GSPF_XANCP : 129- 138: ageag GsmqdtLqrL adyle HOFC_ECOLI : 194- 202: ladfs Gewsw-LlvL fgfll HOFC_ECOLI : 318- 327: tgeas GsldlmLdnL ahhhr HOFC_HAEIN : 255- 263: itpif Gtiqk-LsrL vnfsq PILC_PSEAE : 140- 149: nlvda GeqsgaLenL ldrva PILC_PSEPU : 66- 74: ktdpa Gfsrq-LatL lkagv PILC_PSEPU : 140- 149: vgeqs GtldrqLeqL agmle TAPC_AERHY : 377- 385: ddlvd Gltsl-LepL imvvl TCPE_VIBCH : 148- 156: vsrwp Gvtqa-LynL gfsly Q 17: 11.5102 38( 15) V-x(0,1)-L-x(2,3)-V Occurences: 38(15) CMG2_BACSU : 308- 314: amill VyLsmlV pmyqm GSPF_AERHY : 158- 162: miypi V-Ltl-V avgvi GSPF_AERHY : 237- 243: rhwhq VvLrlpV igrvs GSPF_AERHY : 238- 243: hwhqv V-LrlpV igrvs GSPF_AERHY : 367- 372: vsmag VvLfi-V msilq GSPF_AERHY : 368- 372: smagv V-Lfi-V msilq GSPF_ECOLI : 97- 101: krlgd V-Lnq-V rsail GSPF_ECOLI : 379- 383: tmali V-Lfi-V vsvlq GSPF_ECOLI : 379- 384: tmali V-LfivV svlqp GSPF_ERWCA : 178- 182: miypc V-Ltv-V aiavv GSPF_ERWCA : 387- 392: vsmaa VvLfi-V lailq GSPF_ERWCA : 388- 392: smaav V-Lfi-V lailq GSPF_ERWCH : 176- 180: miypc V-Ltl-V aisvv GSPF_ERWCH : 228- 233: tygpw VvLll-V laimg GSPF_ERWCH : 229- 233: ygpwv V-Lll-V laimg GSPF_ERWCH : 384- 388: smagi V-Lfi-V lailq GSPF_KLEPN : 151- 155: miypi V-Ltl-V avsvi GSPF_KLEPN : 161- 167: avsvi ViLlstV vpkvv GSPF_KLEPN : 361- 365: amagm V-Lfi-V lailq GSPF_PSEAE : 213- 217: plltr V-Lig-V sdwvk GSPF_PSEAE : 385- 390: ifmga VvLvi-V laill GSPF_PSEAE : 386- 390: fmgav V-Lvi-V laill GSPF_VIBCH : 386- 390: lmagm V-Lfi-V matlm GSPF_XANCP : 360- 366: alaal VpLitlV lasvv GSPF_XANCP : 366- 370: plitl V-Las-V vglvi GSPF_XANCP : 366- 371: plitl V-LasvV glvii HOFC_ECOLI : 15- 20: mayaq VvLtt-V tplsl HOFC_ECOLI : 16- 20: ayaqv V-Ltt-V tplsl HOFC_HAEIN : 305- 310: lvndi V-LdkeV rsilq PILC_PSEAE : 382- 387: pmima V-LgvlV ggliv PILC_PSEPU : 183- 188: lgvsa VlLle-V ipqfq PILC_PSEPU : 183- 188: lgvsa V-LlleV ipqfq PILC_PSEPU : 223- 229: grhap VlLvsaV llava PILC_PSEPU : 229- 233: llvsa V-Lla-V aarel PILC_PSEPU : 253- 258: witqr V-LglpV fgkll PILC_PSEPU : 378- 383: paivl V-LgllV gglvv TAPC_AERHY : 184- 190: fypam ViLvaiV vtsil TAPC_AERHY : 388- 394: eplim VvLgvlV ggmvv TAPC_AERHY : 389- 394: plimv V-LgvlV ggmvv TCPE_VIBCH : 75- 80: ipdke V-LminV aensg TCPE_VIBCH : 168- 172: glwik V-Lif-V aifit R 18: 11.5102 39( 15) I-x(0,1)-L-x(0,1)-L Occurences: 39(15) CMG2_BACSU : 145- 148: hidlv IiL-L vlfta CMG2_BACSU : 146- 148: idlvi I-L-L vlfta CMG2_BACSU : 146- 150: idlvi IlLvL ftagi CMG2_BACSU : 305- 307: fvaam I-L-L vylsm GSPF_AERHY : 157- 161: amiyp IvLtL vavgv GSPF_AERHY : 169- 171: vgvis I-L-L tavvp GSPF_AERHY : 379- 382: silqp I-LeL nnmvn GSPF_ECOLI : 179- 182: aigvv IiL-L tavvp GSPF_ECOLI : 180- 182: igvvi I-L-L tavvp GSPF_ECOLI : 206- 208: plstr I-L-L glsdt GSPF_ECOLI : 206- 210: plstr IlLgL sdtlq GSPF_ECOLI : 314- 318: rqgns IhLsL eqtai GSPF_ECOLI : 360- 364: lqqnr IaLtL sifep GSPF_ERWCA : 189- 191: iavvs I-L-L svvvp GSPF_ERWCA : 399- 402: ailqp I-LqL ntlms GSPF_ERWCH : 187- 189: isvvs I-L-L savvp GSPF_ERWCH : 395- 398: ailqp I-LqL ntlms GSPF_KLEPN : 150- 154: amiyp IvLtL vavsv GSPF_KLEPN : 162- 164: vsviv I-L-L stvvp GSPF_KLEPN : 207- 209: wllla I-L-L lilll GSPF_KLEPN : 207- 210: wllla IlL-L illlr GSPF_KLEPN : 207- 210: wllla I-LlL illlr GSPF_KLEPN : 211- 213: ailll I-L-L lryll GSPF_KLEPN : 211- 214: ailll IlL-L ryllr GSPF_KLEPN : 211- 214: ailll I-LlL ryllr GSPF_KLEPN : 342- 346: dlsaq IqLaL slfep GSPF_KLEPN : 372- 375: ailqp I-LqL ntlms GSPF_PSEAE : 167- 171: qsrqk IqLaL lypvi GSPF_PSEAE : 393- 395: vivla I-L-L pilsl GSPF_PSEAE : 397- 400: aillp I-LsL nqlvg GSPF_VIBCH : 226- 229: lqhwg IsL-L vgllm GSPF_XANCP : 161- 163: liypa I-L-L avvgc GSPF_XANCP : 363- 367: alvpl ItLvL asvvg HOFC_ECOLI : 249- 252: tqift I-LaL tqsag HOFC_ECOLI : 293- 297: sngqp IwLaL kntge HOFC_HAEIN : 171- 174: smvlg IsL-L ltlal HOFC_HAEIN : 171- 175: smvlg IsLlL tlall HOFC_HAEIN : 204- 206: ptita I-L-L sisnf HOFC_HAEIN : 218- 220: kqnig I-L-L ffvls HOFC_HAEIN : 368- 371: klnhq IdL-L sqmle PILC_PSEAE : 54- 57: vrkkg IsL-L gagkk PILC_PSEAE : 187- 189: livsa I-L-L ikvvp PILC_PSEAE : 257- 260: tldrt I-LkL pifgg PILC_PSEPU : 375- 379: llepa IvLvL gllvg TAPC_AERHY : 194- 196: ivvts I-L-L lfvip TAPC_AERHY : 194- 197: ivvts IlL-L fvipq TAPC_AERHY : 194- 197: ivvts I-LlL fvipq TCPE_VIBCH : 316- 320: knisl ItLaL sviwi S 19: 11.5102 28( 15) I-x-L-x(0,2)-L Occurences: 28(15) CMG2_BACSU : 145- 148: hidlv IiL--L vlfta CMG2_BACSU : 145- 150: hidlv IiLlvL ftagi CMG2_BACSU : 146- 150: idlvi IlLv-L ftagi CMG2_BACSU : 305- 310: fvaam IlLvyL smlvp GSPF_AERHY : 157- 161: amiyp IvLt-L vavgv GSPF_ECOLI : 179- 182: aigvv IiL--L tavvp GSPF_ECOLI : 206- 210: plstr IlLg-L sdtlq GSPF_ECOLI : 314- 318: rqgns IhLs-L eqtai GSPF_ECOLI : 360- 364: lqqnr IaLt-L sifep GSPF_ERWCA : 391- 396: avvlf IvLaiL qpilq GSPF_ERWCH : 387- 392: givlf IvLaiL qpilq GSPF_KLEPN : 150- 154: amiyp IvLt-L vavsv GSPF_KLEPN : 207- 210: wllla IlL--L illlr GSPF_KLEPN : 207- 212: wllla IlLliL llryl GSPF_KLEPN : 211- 214: ailll IlL--L ryllr GSPF_KLEPN : 342- 346: dlsaq IqLa-L slfep GSPF_KLEPN : 364- 369: gmvlf IvLaiL qpilq GSPF_PSEAE : 167- 171: qsrqk IqLa-L lypvi GSPF_PSEAE : 167- 172: qsrqk IqLalL ypvil GSPF_PSEAE : 389- 394: avvlv IvLaiL lpils GSPF_PSEAE : 393- 398: vivla IlLpiL slnql GSPF_VIBCH : 226- 229: lqhwg IsL--L vgllm GSPF_XANCP : 363- 367: alvpl ItLv-L asvvg HOFC_ECOLI : 293- 297: sngqp IwLa-L kntge HOFC_HAEIN : 171- 174: smvlg IsL--L ltlal HOFC_HAEIN : 171- 175: smvlg IsLl-L tlall HOFC_HAEIN : 368- 371: klnhq IdL--L sqmle PILC_PSEAE : 54- 57: vrkkg IsL--L gagkk PILC_PSEPU : 375- 379: llepa IvLv-L gllvg TAPC_AERHY : 194- 197: ivvts IlL--L fvipq TCPE_VIBCH : 313- 318: gvmkn IsLitL alsvi TCPE_VIBCH : 316- 320: knisl ItLa-L sviwi T 20: 11.5102 33( 15) I-x(3,4)-L-x(1,2)-L Occurences: 33(15) CMG2_BACSU : 305- 313: fvaam IllvyLsmL vpmyq GSPF_AERHY : 53- 60: selal Itrq-LatL vgagl GSPF_AERHY : 154- 161: llqam IypivLt-L vavgv GSPF_AERHY : 375- 382: fivms IlqpiLe-L nnmvn GSPF_ECOLI : 56- 63: trrpr IshseLt-L ftrql GSPF_ECOLI : 372- 380: fepal IitmaLivL fivvs GSPF_ECOLI : 373- 380: epali Itma-LivL fivvs GSPF_ECOLI : 382- 390: livlf IvvsvLqpL lqlns GSPF_ERWCA : 395- 402: fivla IlqpiLq-L ntlms GSPF_ERWCH : 65- 71: grshr Iasd-La-L ltrql GSPF_ERWCH : 65- 72: grshr Iasd-LalL trqla GSPF_ERWCH : 172- 179: iqqam IypcvLt-L vaisv GSPF_ERWCH : 391- 398: fivla IlqpiLq-L ntlms GSPF_KLEPN : 147- 154: llqam IypivLt-L vavsv GSPF_KLEPN : 207- 214: wllla IllliLl-L ryllr GSPF_KLEPN : 342- 348: dlsaq Iqla-Ls-L fepll GSPF_KLEPN : 368- 375: fivla IlqpiLq-L ntlms GSPF_PSEAE : 393- 400: vivla IllpiLs-L nqlvg GSPF_VIBCH : 63- 70: afkrg IstpdLa-L itrql GSPF_VIBCH : 71- 78: pdlal Itrq-LatL vqsgm GSPF_VIBCH : 373- 381: nialg IftpaLiaL magmv GSPF_XANCP : 216- 222: lvlvv Ipgv-Lg-L wldrk GSPF_XANCP : 352- 359: etaqa Idra-LaaL vplit GSPF_XANCP : 375- 382: vvglv Iisv-LvpL ydltn HOFC_ECOLI : 222- 229: rptwl IvrqkLl-L ripim HOFC_ECOLI : 246- 252: qkltq Ifti-La-L tqsag HOFC_HAEIN : 59- 66: pknse Isel-LnqL atllq HOFC_HAEIN : 171- 177: smvlg Isll-Lt-L alllf PILC_PSEAE : 379- 386: lmepm Imav-LgvL vggli PILC_PSEPU : 168- 174: lrkam Iypl-Ll-L ltglg PILC_PSEPU : 168- 175: lrkam IypllLl-L tglgv PILC_PSEPU : 168- 175: lrkam Iypl-LllL tglgv PILC_PSEPU : 249- 256: parlw ItqrvLg-L pvfgk PILC_PSEPU : 375- 381: llepa Ivlv-Lg-L lvggl PILC_PSEPU : 375- 382: llepa Ivlv-LglL vgglv TAPC_AERHY : 386- 393: llepl Imvv-LgvL vggmv TCPE_VIBCH : 313- 320: gvmkn IslitLa-L sviwi Number of patterns evaluated by Pratt:3266 Total running time: 4 seconds