------------------------------------------------------------ Pratt version 2.1, Sept. 1996 Written by Inge Jonassen, University of Bergen Norway email: inge@ii.uib.no For more information, see http://www.ii.uib.no/~inge/Pratt.html ------------------------------------------------------------ Please quote: I.Jonassen, J.F.Collins, D.G.Higgins. Protein Science 1995;4(8):1587-1595. ------------------------------------------------------------ Pratt version 2.1 Analysing 24 sequences from file GLYCOSYL_HYDROL_F17 PATTERN CONSERVATION: CM: min Nr of Seqs to Match 24 C%: min Percentage Seqs to Match 100.0 PATTERN RESTRICTIONS : PP: pos in seq [off,complete,start] off PL: max Pattern Length 50 PN: max Nr of Pattern Symbols 50 PX: max Nr of consecutive x's 5 FN: max Nr of flexible spacers 2 FL: max Flexibility 2 FP: max Flex.Product 10 BI: Input Pattern Symbol File off BN: Nr of Pattern Symbols Initial Search 20 PATTERN SCORING: S: Scoring [info,mdl,tree,dist,ppv] info SEARCH PARAMETERS: G: Pattern Graph from [seq,al,query] seq E: Search Greediness 3 R: Pattern Refinement on RG: Generalise ambiguous symbols off OUTPUT: OF: Output Filename GLYCOSYL_HYDROL_F17.pratt2 OP: PROSITE Pattern Format on ON: max number patterns 20 OA: max number Alignments 20 M: Print Patterns in sequences off Sequence lengths: BGL2_CANAL 308 BGL2_YEAST 313 E132_ARATH 305 E13A_HORVU 310 E13A_LYCES 336 E13B_HORVU 334 E13B_LYCES 360 E13B_NICPL 365 E13B_PEA 370 E13B_PHAVU 348 E13B_TOBAC 371 E13C_HORVU 330 E13C_TOBAC 351 E13D_HORVU 327 E13D_TOBAC 351 E13E_HORVU 312 E13E_TOBAC 370 E13F_HORVU 321 E13F_TOBAC 370 E13G_TOBAC 343 E13H_TOBAC 339 EA6_ARATH 478 GUB2_HORVU 312 GUB_NICPL 370 Pratt run started at Thu Feb 6 19:36:11 1997 Best Patterns before refinement: fitness hits(seqs) Pattern 1: 20.3503 24( 24) E-x-G-W-P-x(2,3)-G 2: 16.1802 24( 24) G-W-P-x(2,3)-G 3: 12.5102 26( 24) F-x-E-x(2)-K 4: 12.0102 26( 24) F-x-E-x(1,2)-K 5: 12.0102 27( 24) F-x(0,1)-E-x(2)-K 6: 12.0102 40( 24) G-x-P-x(2,3)-G 7: 12.0102 36( 24) A-x(1,2)-Y-x(3)-L 8: 12.0102 26( 24) N-A-x(1,2)-Y 9: 12.0102 24( 24) W-P-x(2,3)-G 10: 12.0102 43( 24) N-x(0,1)-L-x(2)-A 11: 12.0102 42( 24) S-x(1,2)-P-S 12: 12.0102 40( 24) L-x(5)-D-x(4,5)-A 13: 11.5102 47( 24) Y-x(1,2)-A-x(2,3)-E 14: 11.5102 44( 24) V-x(2,3)-G-x(1,2)-P 15: 11.5102 40( 24) V-x(1,2)-E-x(0,1)-G 16: 11.5102 41( 24) S-x(0,1)-G-x(2,3)-S 17: 11.5102 38( 24) S-x(0,1)-G-x(1,2)-S 18: 11.5102 43( 24) L-x(2,3)-A-x(3,4)-S 19: 11.5102 43( 24) L-x(2,3)-A-x(2,3)-S 20: 11.5102 48( 24) L-x(1,2)-A-x(3,4)-S Best Patterns (after refinement phase): fitness hits(seqs) Pattern A 1: 27.6509 24( 24) E-[ST]-G-W-P-x(2,3)-G-x(4)-[ADPST]-x(2)-[ADNP] B 2: 21.4312 40( 24) V-x(1,2)-E-x(0,1)-G-x-[NP]-[EST]-[ADEGT]-[EGQS] C 3: 20.3055 24( 24) G-W-P-x(2,3)-G-x(4)-[ADPST]-x(2)-[ADNP] D 4: 16.5740 24( 24) F-[DN]-E-x(1,2)-K-[DENPQST] E 5: 16.3578 25( 24) F-x-E-[ADEN]-x-K-[DENPST] F 6: 16.1354 24( 24) W-P-x(2,3)-G-x(4)-[ADPST]-x(2)-[ADNP] G 7: 15.8578 26( 24) F-x(0,1)-E-[ADEN]-x-K-[DENPST] H 8: 15.8180 34( 24) N-x(0,1)-L-x-[ADNPS]-A-x(2)-[ADNSV] I 9: 14.5727 33( 24) S-x(0,1)-G-x(1,2)-S-x-[AEGNQST]-x(3)-[AGNSTV] J 10: 13.7405 38( 24) V-x(2,3)-G-x(1,2)-P-x(2)-[ADGP] K 11: 13.4112 41( 24) Y-x(1,2)-A-x(2,3)-E-[ADNSV] L 12: 12.0102 40( 24) G-x-P-x(2,3)-G M 13: 12.0102 36( 24) A-x(1,2)-Y-x(3)-L N 14: 12.0102 26( 24) N-A-x(1,2)-Y O 15: 12.0102 42( 24) S-x(1,2)-P-S P 16: 12.0102 40( 24) L-x(5)-D-x(4,5)-A Q 17: 11.5102 41( 24) S-x(0,1)-G-x(2,3)-S R 18: 11.5102 38( 24) S-x(0,1)-G-x(1,2)-S S 19: 11.5102 43( 24) L-x(2,3)-A-x(3,4)-S T 20: 11.5102 43( 24) L-x(2,3)-A-x(2,3)-S Best patterns with alignements: fitness hits(seqs) Pattern A 1: 27.6509 24( 24) E-[ST]-G-W-P-x(2,3)-G-x(4)-[ADPST]-x(2)-[ADNP] Occurences: 24(24) BGL2_CANAL : 228- 243: efwvg ETGWPtd-GssygDsvP svena BGL2_YEAST : 233- 248: tfwvg ETGWPtd-GtnfeSsyP svdna E132_ARATH : 229- 244: eivvs ETGWPte-GavgtSveN aktyv E13A_HORVU : 234- 250: rvvvs ESGWPsasGfaatAdnA raynq E13A_LYCES : 257- 272: eiivs ESGWPse-GhpsaTleN amtyy E13B_HORVU : 259- 274: kvvvs ESGWPsa-GgfaaSagN artyn E13B_HORVU : 259- 275: kvvvs ESGWPsagGfaasAgnA rtynq E13B_LYCES : 265- 280: givvs ESGWPsa-GafgaTheN aqtyl E13B_NICPL : 273- 288: givvs ESGWPsa-GafgaTydN aatyl E13B_PEA : 272- 287: nvvvs ESGWPsd-GgsatSydN ariyl E13B_PHAVU : 240- 255: evvvs ESGWPsd-GgfgaTydN arvyl E13B_TOBAC : 274- 289: givvs ESGWPsa-GafgaTydN aatyl E13C_HORVU : 255- 271: kvvis ESGWPsdqGfgatAqnA raynq E13C_TOBAC : 268- 283: eiivs ESGWPse-GnsaaTieN aqtyy E13D_HORVU : 233- 248: rvvvs ESGWPsa-GgfaaTpeN arayn E13D_HORVU : 233- 249: rvvvs ESGWPsagGfaatPenA raynq E13D_TOBAC : 268- 283: eiivs ESGWPse-GnsaaTieN aqtyy E13E_HORVU : 235- 250: rvvvs ESGWPsa-GgfgaSveN arnyn E13E_TOBAC : 273- 288: givvs ESGWPsa-GafgaTydN aatyl E13F_HORVU : 241- 257: elvvs ETGWPsggGgygaSveN aaayi E13F_TOBAC : 273- 288: givvs ESGWPsa-GafgaTydN aatyl E13G_TOBAC : 264- 279: eiivs ESGWPse-GnsaaTieN aqtyy E13H_TOBAC : 262- 277: eivvs ESGWPsa-GagqlTsiD narty EA6_ARATH : 280- 295: rlais ETGWPnf-GdideTgaN ilnaa GUB2_HORVU : 238- 253: klvvs ESGWPsg-GgtaaTpaN arfyn GUB2_HORVU : 238- 254: klvvs ESGWPsggGtaatPanA rfynq GUB_NICPL : 271- 286: eivvs ESGWPsa-GafaaTtnN aatyy B 2: 21.4312 40( 24) V-x(1,2)-E-x(0,1)-G-x-[NP]-[EST]-[ADEGT]-[EGQS] Occurences: 40(24) BGL2_CANAL : 226- 235: diefw Vg-EtGwPTDG ssygd BGL2_YEAST : 231- 240: ditfw Vg-EtGwPTDG tnfes E132_ARATH : 226- 236: gslei VvsEtGwPTEG avgts E132_ARATH : 227- 236: sleiv Vs-EtGwPTEG avgts E13A_HORVU : 231- 241: pgvrv VvsEsGwPSAS gfaat E13A_HORVU : 232- 241: gvrvv Vs-EsGwPSAS gfaat E13A_LYCES : 255- 264: nieii Vs-EsGwPSEG hpsat E13B_HORVU : 256- 266: pavkv VvsEsGwPSAG gfaas E13B_HORVU : 257- 266: avkvv Vs-EsGwPSAG gfaas E13B_LYCES : 262- 272: gsvgi VvsEsGwPSAG afgat E13B_LYCES : 263- 272: svgiv Vs-EsGwPSAG afgat E13B_NICPL : 270- 280: asvgi VvsEsGwPSAG afgat E13B_NICPL : 271- 280: svgiv Vs-EsGwPSAG afgat E13B_PEA : 269- 279: gwvnv VvsEsGwPSDG gsats E13B_PEA : 270- 279: wvnvv Vs-EsGwPSDG gsats E13B_PHAVU : 237- 247: gyvev VvsEsGwPSDG gfgat E13B_PHAVU : 238- 247: yvevv Vs-EsGwPSDG gfgat E13B_TOBAC : 271- 281: asvgi VvsEsGwPSAG afgat E13B_TOBAC : 272- 281: svgiv Vs-EsGwPSAG afgat E13C_HORVU : 252- 262: pgvkv VisEsGwPSDQ gfgat E13C_TOBAC : 266- 275: nveii Vs-EsGwPSEG nsaat E13D_HORVU : 230- 240: psvrv VvsEsGwPSAG gfaat E13D_HORVU : 231- 240: svrvv Vs-EsGwPSAG gfaat E13D_TOBAC : 266- 275: nveii Vs-EsGwPSEG nsaat E13E_HORVU : 232- 242: pnvrv VvsEsGwPSAG gfgas E13E_HORVU : 233- 242: nvrvv Vs-EsGwPSAG gfgas E13E_TOBAC : 270- 280: asvgi VvsEsGwPSAG afgat E13E_TOBAC : 271- 280: svgiv Vs-EsGwPSAG afgat E13F_HORVU : 238- 248: eslel VvsEtGwPSGG ggyga E13F_HORVU : 239- 248: slelv Vs-EtGwPSGG ggyga E13F_TOBAC : 270- 280: asvgi VvsEsGwPSAG afgat E13F_TOBAC : 271- 280: svgiv Vs-EsGwPSAG afgat E13G_TOBAC : 262- 271: nveii Vs-EsGwPSEG nsaat E13H_TOBAC : 259- 269: sslei VvsEsGwPSAG agqlt E13H_TOBAC : 260- 269: sleiv Vs-EsGwPSAG agqlt EA6_ARATH : 391- 400: gqvwc VpvE-GaNETE leetl GUB2_HORVU : 235- 245: ssvkl VvsEsGwPSGG gtaat GUB2_HORVU : 236- 245: svklv Vs-EsGwPSGG gtaat GUB_NICPL : 268- 278: gsiei VvsEsGwPSAG afaat GUB_NICPL : 269- 278: sieiv Vs-EsGwPSAG afaat C 3: 20.3055 24( 24) G-W-P-x(2,3)-G-x(4)-[ADPST]-x(2)-[ADNP] Occurences: 24(24) BGL2_CANAL : 230- 243: wvget GWPtd-GssygDsvP svena BGL2_YEAST : 235- 248: wvget GWPtd-GtnfeSsyP svdna E132_ARATH : 231- 244: vvset GWPte-GavgtSveN aktyv E13A_HORVU : 236- 250: vvses GWPsasGfaatAdnA raynq E13A_LYCES : 259- 272: ivses GWPse-GhpsaTleN amtyy E13B_HORVU : 261- 274: vvses GWPsa-GgfaaSagN artyn E13B_HORVU : 261- 275: vvses GWPsagGfaasAgnA rtynq E13B_LYCES : 267- 280: vvses GWPsa-GafgaTheN aqtyl E13B_NICPL : 275- 288: vvses GWPsa-GafgaTydN aatyl E13B_PEA : 274- 287: vvses GWPsd-GgsatSydN ariyl E13B_PHAVU : 242- 255: vvses GWPsd-GgfgaTydN arvyl E13B_TOBAC : 276- 289: vvses GWPsa-GafgaTydN aatyl E13C_HORVU : 257- 271: vises GWPsdqGfgatAqnA raynq E13C_TOBAC : 270- 283: ivses GWPse-GnsaaTieN aqtyy E13D_HORVU : 235- 248: vvses GWPsa-GgfaaTpeN arayn E13D_HORVU : 235- 249: vvses GWPsagGfaatPenA raynq E13D_TOBAC : 270- 283: ivses GWPse-GnsaaTieN aqtyy E13E_HORVU : 237- 250: vvses GWPsa-GgfgaSveN arnyn E13E_TOBAC : 275- 288: vvses GWPsa-GafgaTydN aatyl E13F_HORVU : 243- 257: vvset GWPsggGgygaSveN aaayi E13F_TOBAC : 275- 288: vvses GWPsa-GafgaTydN aatyl E13G_TOBAC : 266- 279: ivses GWPse-GnsaaTieN aqtyy E13H_TOBAC : 264- 277: vvses GWPsa-GagqlTsiD narty EA6_ARATH : 282- 295: aiset GWPnf-GdideTgaN ilnaa GUB2_HORVU : 240- 253: vvses GWPsg-GgtaaTpaN arfyn GUB2_HORVU : 240- 254: vvses GWPsggGtaatPanA rfynq GUB_NICPL : 273- 286: vvses GWPsa-GafaaTtnN aatyy D 4: 16.5740 24( 24) F-[DN]-E-x(1,2)-K-[DENPQST] Occurences: 24(24) BGL2_CANAL : 272- 278: avyea FDEawKP dtsgt BGL2_YEAST : 277- 283: ivfea FDEdwKP ntsgt E132_ARATH : 276- 282: yifam FDEnkKE ptyek E13A_HORVU : 280- 286: yifam FNEnfKT gelte E13A_LYCES : 306- 312: ylfam FDEnrKD gkpse E13B_HORVU : 305- 311: yifam FNEnqKT gdate E13B_LYCES : 311- 317: yifam FDEnnKN pelek E13B_NICPL : 319- 325: yifam FDEnnKN pelek E13B_PEA : 318- 324: ylfam FDEnqKS pelek E13B_PHAVU : 287- 293: yifam FDEnqKS peiek E13B_TOBAC : 320- 326: yifam FDEnnKN pelek E13C_HORVU : 301- 307: yifam FNEnlKD gdele E13C_TOBAC : 317- 323: ylfam FDEneKN gevte E13D_HORVU : 279- 285: yvfam FNEnqKP glete E13D_TOBAC : 317- 323: ylfam FDEneKQ geite E13E_HORVU : 281- 287: yifam FNEnrKP gdeve E13E_TOBAC : 319- 325: yifam FDEnnKN pelek E13F_HORVU : 288- 294: yifam FNEnqKP egveq E13F_TOBAC : 319- 325: yifam FDEnnKN pelek E13G_TOBAC : 313- 319: ylfam FDEnnKE gdite E13H_TOBAC : 310- 316: yvfal FDEdqKD peiek EA6_ARATH : 334- 340: fvfsl FNEnqKS gsgtq GUB2_HORVU : 284- 290: yifam FNEnqKD sgveq GUB_NICPL : 318- 324: ylfam FDEnnKN pelek E 5: 16.3578 25( 24) F-x-E-[ADEN]-x-K-[DENPST] Occurences: 25(24) BGL2_CANAL : 272- 278: avyea FdEAwKP dtsgt BGL2_YEAST : 277- 283: ivfea FdEDwKP ntsgt E132_ARATH : 276- 282: yifam FdENkKE ptyek E13A_HORVU : 280- 286: yifam FnENfKT gelte E13A_LYCES : 306- 312: ylfam FdENrKD gkpse E13B_HORVU : 305- 311: yifam FnENqKT gdate E13B_LYCES : 311- 317: yifam FdENnKN pelek E13B_NICPL : 319- 325: yifam FdENnKN pelek E13B_PEA : 318- 324: ylfam FdENqKS pelek E13B_PHAVU : 287- 293: yifam FdENqKS peiek E13B_TOBAC : 320- 326: yifam FdENnKN pelek E13C_HORVU : 301- 307: yifam FnENlKD gdele E13C_TOBAC : 183- 189: pkdsi FrEEfKS finpi E13C_TOBAC : 317- 323: ylfam FdENeKN gevte E13D_HORVU : 279- 285: yvfam FnENqKP glete E13D_TOBAC : 183- 189: pkdsi FrEElKS finpi E13E_HORVU : 281- 287: yifam FnENrKP gdeve E13E_TOBAC : 319- 325: yifam FdENnKN pelek E13F_HORVU : 288- 294: yifam FnENqKP egveq E13F_TOBAC : 319- 325: yifam FdENnKN pelek E13G_TOBAC : 313- 319: ylfam FdENnKE gdite E13H_TOBAC : 310- 316: yvfal FdEDqKD peiek EA6_ARATH : 334- 340: fvfsl FnENqKS gsgtq GUB2_HORVU : 284- 290: yifam FnENqKD sgveq GUB_NICPL : 318- 324: ylfam FdENnKN pelek F 6: 16.1354 24( 24) W-P-x(2,3)-G-x(4)-[ADPST]-x(2)-[ADNP] Occurences: 24(24) BGL2_CANAL : 231- 243: vgetg WPtd-GssygDsvP svena BGL2_YEAST : 236- 248: vgetg WPtd-GtnfeSsyP svdna E132_ARATH : 232- 244: vsetg WPte-GavgtSveN aktyv E13A_HORVU : 237- 250: vsesg WPsasGfaatAdnA raynq E13A_LYCES : 260- 272: vsesg WPse-GhpsaTleN amtyy E13B_HORVU : 262- 274: vsesg WPsa-GgfaaSagN artyn E13B_HORVU : 262- 275: vsesg WPsagGfaasAgnA rtynq E13B_LYCES : 268- 280: vsesg WPsa-GafgaTheN aqtyl E13B_NICPL : 276- 288: vsesg WPsa-GafgaTydN aatyl E13B_PEA : 275- 287: vsesg WPsd-GgsatSydN ariyl E13B_PHAVU : 243- 255: vsesg WPsd-GgfgaTydN arvyl E13B_TOBAC : 277- 289: vsesg WPsa-GafgaTydN aatyl E13C_HORVU : 258- 271: isesg WPsdqGfgatAqnA raynq E13C_TOBAC : 271- 283: vsesg WPse-GnsaaTieN aqtyy E13D_HORVU : 236- 248: vsesg WPsa-GgfaaTpeN arayn E13D_HORVU : 236- 249: vsesg WPsagGfaatPenA raynq E13D_TOBAC : 271- 283: vsesg WPse-GnsaaTieN aqtyy E13E_HORVU : 238- 250: vsesg WPsa-GgfgaSveN arnyn E13E_TOBAC : 276- 288: vsesg WPsa-GafgaTydN aatyl E13F_HORVU : 244- 257: vsetg WPsggGgygaSveN aaayi E13F_TOBAC : 276- 288: vsesg WPsa-GafgaTydN aatyl E13G_TOBAC : 267- 279: vsesg WPse-GnsaaTieN aqtyy E13H_TOBAC : 265- 277: vsesg WPsa-GagqlTsiD narty EA6_ARATH : 283- 295: isetg WPnf-GdideTgaN ilnaa GUB2_HORVU : 241- 253: vsesg WPsg-GgtaaTpaN arfyn GUB2_HORVU : 241- 254: vsesg WPsggGtaatPanA rfynq GUB_NICPL : 274- 286: vsesg WPsa-GafaaTtnN aatyy G 7: 15.8578 26( 24) F-x(0,1)-E-[ADEN]-x-K-[DENPST] Occurences: 26(24) BGL2_CANAL : 92- 97: nddah F-EAeKE alqny BGL2_CANAL : 272- 278: avyea FdEAwKP dtsgt BGL2_YEAST : 277- 283: ivfea FdEDwKP ntsgt E132_ARATH : 276- 282: yifam FdENkKE ptyek E13A_HORVU : 280- 286: yifam FnENfKT gelte E13A_LYCES : 306- 312: ylfam FdENrKD gkpse E13B_HORVU : 305- 311: yifam FnENqKT gdate E13B_LYCES : 311- 317: yifam FdENnKN pelek E13B_NICPL : 319- 325: yifam FdENnKN pelek E13B_PEA : 318- 324: ylfam FdENqKS pelek E13B_PHAVU : 287- 293: yifam FdENqKS peiek E13B_TOBAC : 320- 326: yifam FdENnKN pelek E13C_HORVU : 301- 307: yifam FnENlKD gdele E13C_TOBAC : 183- 189: pkdsi FrEEfKS finpi E13C_TOBAC : 317- 323: ylfam FdENeKN gevte E13D_HORVU : 279- 285: yvfam FnENqKP glete E13D_TOBAC : 183- 189: pkdsi FrEElKS finpi E13E_HORVU : 281- 287: yifam FnENrKP gdeve E13E_TOBAC : 319- 325: yifam FdENnKN pelek E13F_HORVU : 288- 294: yifam FnENqKP egveq E13F_TOBAC : 319- 325: yifam FdENnKN pelek E13G_TOBAC : 313- 319: ylfam FdENnKE gdite E13H_TOBAC : 310- 316: yvfal FdEDqKD peiek EA6_ARATH : 334- 340: fvfsl FnENqKS gsgtq GUB2_HORVU : 284- 290: yifam FnENqKD sgveq GUB_NICPL : 318- 324: ylfam FdENnKN pelek H 8: 15.8180 34( 24) N-x(0,1)-L-x-[ADNPS]-A-x(2)-[ADNSV] Occurences: 34(24) BGL2_CANAL : 68- 75: cntlq N-LgPAaeA egfqi BGL2_YEAST : 73- 80: cntlq N-LgPAaeA egfti E132_ARATH : 202- 209: gysyq N-LfDAnlD svyaa E13A_HORVU : 11- 19: ygvva NnLpPAneV vqlyr E13A_HORVU : 12- 19: gvvan N-LpPAneV vqlyr E13A_HORVU : 111- 118: vpamr N-LgAAlkA pglgt E13A_LYCES : 230- 237: dagyq N-LfDAlvD smyfa E13B_HORVU : 137- 144: lpamr N-LnAAlsA aglga E13B_LYCES : 238- 245: srqyr N-LfDAmlD svyaa E13B_NICPL : 246- 253: srqyr N-LfDAmlD svyaa E13B_PEA : 43- 51: ygmmg NnLpPAneV ialyk E13B_PEA : 44- 51: gmmgn N-LpPAneV ialyk E13B_PEA : 245- 252: pngyq N-LfDAmlD svhaa E13B_PHAVU : 11- 19: ygmmg NnLpSAneV inlyr E13B_PHAVU : 12- 19: gmmgn N-LpSAneV inlyr E13B_PHAVU : 213- 220: qygyq N-LfDAmlD svhaa E13B_TOBAC : 247- 254: srqyr N-LfDAmlD svyaa E13C_HORVU : 228- 235: gltyt N-LfDAmvD siyaa E13C_TOBAC : 241- 248: stgyq N-LfDAllD siyfa E13D_HORVU : 206- 213: gliyt N-LfNAmvD amyaa E13D_TOBAC : 241- 248: stgyq N-LfDAllD siyfa E13E_HORVU : 113- 121: mqnvh NaLaSAnlS ssikv E13E_TOBAC : 246- 253: srqyr N-LfDAmlD svyaa E13F_HORVU : 116- 123: lpamk N-LeAAlqA aglsv E13F_TOBAC : 246- 253: srqyr N-LfDAmlD svyaa E13G_TOBAC : 237- 244: pagyq N-LfDAllD smyfa E13H_TOBAC : 235- 242: grgyr N-LfDAilD atysa EA6_ARATH : 295- 303: detga NiLnAAtyN rnlik GUB2_HORVU : 16- 24: ygmsa NnLpAAstV vsmfk GUB2_HORVU : 17- 24: gmsan N-LpAAstV vsmfk GUB2_HORVU : 107- 114: ggatr N-LvPAmkN vhgal GUB_NICPL : 42- 50: ygmlg NnLpPAsqV vqlyk GUB_NICPL : 43- 50: gmlgn N-LpPAsqV vqlyk GUB_NICPL : 244- 251: slgyr N-LfDAmsD avyaa I 9: 14.5727 33( 24) S-x(0,1)-G-x(1,2)-S-x-[AEGNQST]-x(3)-[AGNSTV] Occurences: 33(24) BGL2_CANAL : 281- 291: wkpdt S-GtsSvEkhwG vwqsd BGL2_YEAST : 153- 163: adisd SdGk-SySgkqV gtvds E132_ARATH : 218- 228: aalek SgGg-SlEivvS etgwp E132_ARATH : 218- 228: aalek S-GggSlEivvS etgwp E13A_HORVU : 235- 245: vvvse S-GwpSaSgfaA tadna E13A_LYCES : 258- 268: iivse S-GwpSeGhpsA tlena E13A_LYCES : 262- 273: esgwp SeGhpSaTlenA mtyyt E13B_HORVU : 260- 270: vvvse S-GwpSaGgfaA sagna E13B_LYCES : 266- 276: ivvse S-GwpSaGafgA thena E13B_NICPL : 262- 272: aaler SgGa-SvGivvS esgwp E13B_NICPL : 262- 272: aaler S-GgaSvGivvS esgwp E13B_NICPL : 274- 284: ivvse S-GwpSaGafgA tydna E13B_PEA : 273- 283: vvvse S-GwpSdGgsaT sydna E13B_PEA : 277- 287: esgwp SdGg-SaTsydN ariyl E13B_PHAVU : 241- 251: vvvse S-GwpSdGgfgA tydna E13B_TOBAC : 263- 273: aaler SgGa-SvGivvS esgwp E13B_TOBAC : 263- 273: aaler S-GgaSvGivvS esgwp E13B_TOBAC : 275- 285: ivvse S-GwpSaGafgA tydna E13C_HORVU : 256- 266: vvise S-GwpSdQgfgA taqna E13C_TOBAC : 269- 279: iivse S-GwpSeGnsaA tiena E13C_TOBAC : 273- 283: esgwp SeGn-SaAtieN aqtyy E13D_HORVU : 234- 244: vvvse S-GwpSaGgfaA tpena E13D_TOBAC : 269- 279: iivse S-GwpSeGnsaA tiena E13D_TOBAC : 273- 283: esgwp SeGn-SaAtieN aqtyy E13E_HORVU : 236- 246: vvvse S-GwpSaGgfgA svena E13E_TOBAC : 262- 272: aaler SgGa-SvGivvS esgwp E13E_TOBAC : 262- 272: aaler S-GgaSvGivvS esgwp E13E_TOBAC : 274- 284: ivvse S-GwpSaGafgA tydna E13F_HORVU : 146- 157: tsypp SqGtfSeAalpT vgpiv E13F_TOBAC : 262- 272: aaler SgGa-SvGivvS esgwp E13F_TOBAC : 262- 272: aaler S-GgaSvGivvS esgwp E13F_TOBAC : 274- 284: ivvse S-GwpSaGafgA tydna E13G_TOBAC : 265- 275: iivse S-GwpSeGnsaA tiena E13G_TOBAC : 269- 279: esgwp SeGn-SaAtieN aqtyy E13H_TOBAC : 252- 261: aleka S-Gs-SlEivvS esgwp EA6_ARATH : 141- 151: ilsyn S-GnvSvNlvpA mrkiv GUB2_HORVU : 239- 249: lvvse S-GwpSgGgtaA tpana GUB_NICPL : 272- 282: ivvse S-GwpSaGafaA ttnna J 10: 13.7405 38( 24) V-x(2,3)-G-x(1,2)-P-x(2)-[ADGP] Occurences: 38(24) BGL2_CANAL : 226- 235: diefw VgetGw-PtdG ssygd BGL2_YEAST : 231- 240: ditfw VgetGw-PtdG tnfes E132_ARATH : 227- 236: sleiv VsetGw-PteG avgts E132_ARATH : 256- 264: nliqh Vkn-Gs-PrrP gkaie E13A_HORVU : 261- 269: glidh Vgg-Gt-PkrP galet E13A_LYCES : 255- 264: nieii VsesGw-PseG hpsat E13B_HORVU : 257- 266: avkvv VsesGw-PsaG gfaas E13B_LYCES : 76- 84: gsnie Vil-Gl-PnvD vkhis E13B_LYCES : 263- 272: svgiv VsesGw-PsaG afgat E13B_NICPL : 84- 92: gsnie Vml-Gl-PnsD vkhia E13B_NICPL : 271- 280: svgiv VsesGw-PsaG afgat E13B_PEA : 270- 279: wvnvv VsesGw-PsdG gsats E13B_PEA : 299- 307: nlirh Vgk-Gt-PrrP watea E13B_PHAVU : 238- 247: yvevv VsesGw-PsdG gfgat E13B_TOBAC : 85- 93: gsnie Vml-Gl-PnsD vkhia E13B_TOBAC : 272- 281: svgiv VsesGw-PsaG afgat E13C_HORVU : 282- 290: glinh Vgn-Gs-PkkA gales E13C_TOBAC : 266- 275: nveii VsesGw-PseG nsaat E13D_HORVU : 231- 240: svrvv VsesGw-PsaG gfaat E13D_HORVU : 260- 268: glidh Vah-Gt-PkkP ghmea E13D_TOBAC : 266- 275: nveii VsesGw-PseG nsaat E13E_HORVU : 60- 70: ggvde VrrlGrdPsyA agwvr E13E_HORVU : 233- 242: nvrvv VsesGw-PsaG gfgas E13E_TOBAC : 84- 92: gsnie Vml-Gl-PnsD vkhia E13E_TOBAC : 271- 280: svgiv VsesGw-PsaG afgat E13F_HORVU : 239- 248: slelv VsetGw-PsgG ggyga E13F_HORVU : 266- 276: yinnl VrhvGgtPrrP gkave E13F_TOBAC : 84- 92: gsnie Vml-Gl-PnsD vkhia E13F_TOBAC : 271- 280: svgiv VsesGw-PsaG afgat E13G_TOBAC : 262- 271: nveii VsesGw-PseG nsaat E13H_TOBAC : 260- 269: sleiv VsesGw-PsaG agqlt E13H_TOBAC : 290- 298: nlish Vkg-Gs-PkrP sgpie EA6_ARATH : 361- 371: spiyd VdftGqtPltG fnplp GUB2_HORVU : 236- 245: svklv VsesGw-PsgG gtaat GUB2_HORVU : 265- 273: hlinh Vgr-Gt-PrhP gaiet GUB_NICPL : 82- 90: gsnie Vml-Gv-PnsD lqnia GUB_NICPL : 269- 278: sieiv VsesGw-PsaG afaat GUB_NICPL : 298- 306: nliqh Vkr-Gs-PrrP nkvie K 11: 13.4112 41( 24) Y-x(1,2)-A-x(2,3)-E-[ADNSV] Occurences: 41(24) BGL2_CANAL : 269- 275: invav Ye-Afd-EA wkpdt BGL2_YEAST : 176- 183: vlvag YnsAvi-EA sdfvm E132_ARATH : 271- 279: kaiet YifAmfdEN kkept E13A_HORVU : 90- 97: avnik YiaAgn-EV wggdt E13A_HORVU : 90- 97: avnik Yi-AagnEV wggdt E13A_HORVU : 275- 283: galet YifAmfnEN fktge E13A_LYCES : 112- 119: dvkfk Yi-AvgnEV dpgrd E13A_LYCES : 301- 309: rtiet YlfAmfdEN rkdgk E13B_HORVU : 116- 123: avnik YiaAgn-EV qggat E13B_HORVU : 116- 123: avnik Yi-AagnEV qggat E13B_HORVU : 300- 308: ealet YifAmfnEN qktgd E13B_LYCES : 142- 148: alvni Yk-Aig-EA glgnd E13B_LYCES : 306- 314: gpiet YifAmfdEN nknpe E13B_NICPL : 150- 156: amvni Yk-Aig-EA glgnn E13B_NICPL : 314- 322: rpiet YifAmfdEN nknpe E13B_PEA : 121- 128: svkik Yi-AvgnEV spvgg E13B_PEA : 313- 321: watea YlfAmfdEN qkspe E13B_PHAVU : 89- 96: svkik Yi-AvgnEV spvgg E13B_PHAVU : 282- 290: kptet YifAmfdEN qkspe E13B_TOBAC : 151- 157: amvni Yk-Aig-EA glgnn E13B_TOBAC : 315- 323: gpiet YifAmfdEN nknpe E13C_HORVU : 111- 118: gvsfr Yi-AvrnEV mdsag E13C_HORVU : 296- 304: gales YifAmfnEN lkdgd E13C_TOBAC : 312- 320: rivet YlfAmfdEN eknge E13D_HORVU : 274- 282: ghmea YvfAmfnEN qkpgl E13D_TOBAC : 312- 320: riiet YlfAmfdEN ekqge E13E_HORVU : 89- 96: dvlir Yi-AvgnEV pagdt E13E_HORVU : 276- 284: gaiet YifAmfnEN rkpgd E13E_TOBAC : 150- 156: amvni Yk-Aig-EA glgnn E13E_TOBAC : 314- 322: gpiet YifAmfdEN nknpe E13F_HORVU : 94- 101: avsfr YinAgn-EV ipges E13F_HORVU : 251- 257: sgggg Yg-Asv-EN aaayi E13F_HORVU : 283- 291: kavet YifAmfnEN qkpeg E13F_TOBAC : 150- 156: amvni Yk-Aig-EA glgnn E13F_TOBAC : 314- 322: gpiet YifAmfdEN nknpe E13G_TOBAC : 118- 125: dvkfk Yi-AvgnEV spgnn E13G_TOBAC : 308- 316: kaiet YlfAmfdEN nkegd E13H_TOBAC : 112- 119: nvkfr Yi-AvgnEV splne E13H_TOBAC : 305- 313: gpiet YvfAlfdED qkdpe EA6_ARATH : 74- 80: ghvkl Yd-Adp-ES ltlls GUB2_HORVU : 279- 287: gaiet YifAmfnEN qkdsg GUB_NICPL : 120- 127: avkfr Yi-AvgnEV spvtg GUB_NICPL : 313- 321: kviet YlfAmfdEN nknpe L 12: 12.0102 40( 24) G-x-P-x(2,3)-G Occurences: 40(24) BGL2_CANAL : 230- 235: wvget GwPtd-G ssygd BGL2_YEAST : 235- 240: wvget GwPtd-G tnfes E132_ARATH : 231- 236: vvset GwPte-G avgts E132_ARATH : 259- 265: qhvkn GsPrrpG kaiet E13A_HORVU : 236- 242: vvses GwPsasG faata E13A_HORVU : 264- 270: dhvgg GtPkrpG alety E13A_LYCES : 259- 264: ivses GwPse-G hpsat E13A_LYCES : 289- 295: vkgga GtPkkpG rtiet E13B_HORVU : 261- 266: vvses GwPsa-G gfaas E13B_HORVU : 261- 267: vvses GwPsagG faasa E13B_LYCES : 267- 272: vvses GwPsa-G afgat E13B_LYCES : 295- 301: qhake GsPrkpG piety E13B_NICPL : 275- 280: vvses GwPsa-G afgat E13B_PEA : 274- 279: vvses GwPsd-G gsats E13B_PEA : 274- 280: vvses GwPsdgG satsy E13B_PHAVU : 242- 247: vvses GwPsd-G gfgat E13B_PHAVU : 242- 248: vvses GwPsdgG fgaty E13B_TOBAC : 276- 281: vvses GwPsa-G afgat E13B_TOBAC : 304- 310: qhake GsPrkpG piety E13C_HORVU : 257- 263: vises GwPsdqG fgata E13C_HORVU : 285- 291: nhvgn GsPkkaG alesy E13C_TOBAC : 270- 275: ivses GwPse-G nsaat E13C_TOBAC : 300- 306: vkgga GtPkkpG rivet E13D_HORVU : 235- 240: vvses GwPsa-G gfaat E13D_HORVU : 235- 241: vvses GwPsagG faatp E13D_HORVU : 263- 269: dhvah GtPkkpG hmeay E13D_TOBAC : 270- 275: ivses GwPse-G nsaat E13D_TOBAC : 300- 306: vkgga GtPkkpG riiet E13E_HORVU : 237- 242: vvses GwPsa-G gfgas E13E_HORVU : 237- 243: vvses GwPsagG fgasv E13E_HORVU : 265- 271: dhirs GtPkrpG aiety E13E_TOBAC : 275- 280: vvses GwPsa-G afgat E13E_TOBAC : 303- 309: qhake GsPrkpG piety E13F_HORVU : 243- 248: vvset GwPsg-G ggyga E13F_HORVU : 243- 249: vvset GwPsggG gygas E13F_HORVU : 271- 277: vrhvg GtPrrpG kavet E13F_TOBAC : 275- 280: vvses GwPsa-G afgat E13F_TOBAC : 303- 309: qhake GsPrkpG piety E13G_TOBAC : 266- 271: ivses GwPse-G nsaat E13G_TOBAC : 296- 302: vksga GtPkkpG kaiet E13H_TOBAC : 264- 269: vvses GwPsa-G agqlt EA6_ARATH : 282- 287: aiset GwPnf-G didet EA6_ARATH : 317- 323: asppi GtPsrpG lpipt GUB2_HORVU : 240- 245: vvses GwPsg-G gtaat GUB2_HORVU : 240- 246: vvses GwPsggG taatp GUB2_HORVU : 268- 274: nhvgr GtPrhpG aiety GUB_NICPL : 273- 278: vvses GwPsa-G afaat M 13: 12.0102 36( 24) A-x(1,2)-Y-x(3)-L Occurences: 36(24) BGL2_CANAL : 120- 126: lvgse Al-YredL tasel BGL2_YEAST : 125- 131: lvgse Al-YrndL tasql E132_ARATH : 245- 252: tsven AktYvnnL iqhvk E13A_HORVU : 250- 257: atadn AraYnqgL idhvg E13A_LYCES : 157- 163: ikvst At-YlglL tntyp E13A_LYCES : 273- 280: atlen AmtYytnL inhvk E13B_HORVU : 275- 282: asagn ArtYnqgL inhvg E13B_LYCES : 281- 288: athen AqtYlrnL iqhak E13B_NICPL : 289- 296: atydn AatYlknL iqhak E13B_NICPL : 290- 296: tydna At-YlknL iqhak E13B_PEA : 288- 295: tsydn AriYldnL irhvg E13B_PHAVU : 256- 263: atydn ArvYldnL vrrag E13B_TOBAC : 290- 297: atydn AatYlrnL iqhak E13B_TOBAC : 291- 297: tydna At-YlrnL iqhak E13C_HORVU : 271- 278: ataqn AraYnqgL inhvg E13C_TOBAC : 166- 172: ikvtt At-YsglL antyp E13C_TOBAC : 284- 291: atien AqtYyrnL vnhvk E13D_HORVU : 249- 256: atpen AraYnqgL idhva E13D_TOBAC : 166- 172: ikvst At-YsglL antyp E13D_TOBAC : 284- 291: atien AqtYyrnL vnhvk E13E_HORVU : 80- 86: rsnvq Ay-YpdvL iryia E13E_HORVU : 251- 258: asven ArnYnqgL idhir E13E_TOBAC : 289- 296: atydn AatYlrnL iqhak E13E_TOBAC : 290- 296: tydna At-YlrnL iqhak E13F_HORVU : 258- 265: asven AaaYinnL vrhvg E13F_HORVU : 259- 265: svena Aa-YinnL vrhvg E13F_TOBAC : 289- 296: atydn AatYlrnL iqhak E13F_TOBAC : 290- 296: tydna At-YlrnL iqhak E13G_TOBAC : 162- 168: ikvst At-YsgiL antyp E13G_TOBAC : 280- 287: atien AqtYyenL inhvk E13H_TOBAC : 279- 286: tsidn ArtYnnnL ishvk EA6_ARATH : 299- 306: aniln AatYnrnL ikkms EA6_ARATH : 300- 306: nilna At-YnrnL ikkms GUB2_HORVU : 254- 261: atpan ArfYnqhL inhvg GUB_NICPL : 287- 294: attnn AatYyknL iqhvk GUB_NICPL : 288- 294: ttnna At-YyknL iqhvk N 14: 12.0102 26( 24) N-A-x(1,2)-Y Occurences: 26(24) BGL2_CANAL : 197- 200: knsqa NAs-Y slfdd BGL2_YEAST : 190- 194: dfvma NAfsY wqgqt BGL2_YEAST : 202- 205: gqtmq NAs-Y sffdd E132_ARATH : 27- 30: tkhpa NAl-Y gpdpg E132_ARATH : 244- 248: gtsve NAktY vnnli E13A_HORVU : 249- 253: aatad NAraY nqgli E13A_LYCES : 272- 276: satle NAmtY ytnli E13B_HORVU : 274- 278: aasag NArtY nqgli E13B_LYCES : 280- 284: gathe NAqtY lrnli E13B_NICPL : 288- 292: gatyd NAatY lknli E13B_PEA : 287- 291: atsyd NAriY ldnli E13B_PHAVU : 255- 259: gatyd NArvY ldnlv E13B_TOBAC : 289- 293: gatyd NAatY lrnli E13C_HORVU : 270- 274: gataq NAraY nqgli E13C_TOBAC : 283- 287: aatie NAqtY yrnlv E13D_HORVU : 248- 252: aatpe NAraY nqgli E13D_TOBAC : 283- 287: aatie NAqtY yrnlv E13E_HORVU : 250- 254: gasve NArnY nqgli E13E_TOBAC : 288- 292: gatyd NAatY lrnli E13F_HORVU : 257- 261: gasve NAaaY innlv E13F_TOBAC : 288- 292: gatyd NAatY lrnli E13G_TOBAC : 279- 283: aatie NAqtY yenli E13H_TOBAC : 278- 282: ltsid NArtY nnnli EA6_ARATH : 298- 302: ganil NAatY nrnli GUB2_HORVU : 253- 257: aatpa NArfY nqhli GUB_NICPL : 286- 290: aattn NAatY yknli O 15: 12.0102 42( 24) S-x(1,2)-P-S Occurences: 42(24) BGL2_CANAL : 241- 244: ssygd Sv-PS venaa BGL2_YEAST : 245- 249: gtnfe SsyPS vdnak BGL2_YEAST : 246- 249: tnfes Sy-PS vdnak E132_ARATH : 133- 136: tttdt Sp-PS qgrfr E13A_HORVU : 235- 239: vvvse SgwPS asgfa E13A_LYCES : 258- 262: iivse SgwPS eghps E13B_HORVU : 164- 168: devan SfpPS agvfk E13B_HORVU : 260- 264: vvvse SgwPS aggfa E13B_LYCES : 168- 172: tlign SypPS qgsfr E13B_LYCES : 266- 270: ivvse SgwPS agafg E13B_NICPL : 176- 180: tlign SypPS qgsfr E13B_NICPL : 274- 278: ivvse SgwPS agafg E13B_PEA : 175- 179: tlign SfpPS kgsfr E13B_PEA : 273- 277: vvvse SgwPS dggsa E13B_PHAVU : 143- 147: tlign SypPS qgsfr E13B_PHAVU : 241- 245: vvvse SgwPS dggfg E13B_TOBAC : 177- 181: tlign SypPS qgsfr E13B_TOBAC : 275- 279: ivvse SgwPS agafg E13C_HORVU : 88- 91: lpsla Ss-PS aaaaw E13C_HORVU : 160- 163: vfnnt Sp-PS ngvla E13C_HORVU : 256- 260: vvise SgwPS dqgfg E13C_TOBAC : 269- 273: iivse SgwPS egnsa E13D_HORVU : 137- 141: dvitn SfpPS savfa E13D_HORVU : 234- 238: vvvse SgwPS aggfa E13D_TOBAC : 269- 273: iivse SgwPS egnsa E13E_HORVU : 138- 142: dvitn SfpPS sgvfr E13E_HORVU : 236- 240: vvvse SgwPS aggfg E13E_TOBAC : 176- 180: tlign SypPS qgsfr E13E_TOBAC : 274- 278: ivvse SgwPS agafg E13F_HORVU : 16- 20: ygmmg SdlPS pdkvv E13F_HORVU : 142- 146: svlgt SypPS qgtfs E13F_HORVU : 183- 187: pyfay SadPS svrld E13F_TOBAC : 176- 180: tlign SypPS qgsfr E13F_TOBAC : 274- 278: ivvse SgwPS agafg E13G_TOBAC : 265- 269: iivse SgwPS egnsa E13H_TOBAC : 167- 170: lttdt Sp-PS ngrfk E13H_TOBAC : 263- 267: ivvse SgwPS agagq EA6_ARATH : 181- 185: dslrs SfpPS ngtfr GUB2_HORVU : 142- 145: ilgvf Sp-PS agsft GUB2_HORVU : 239- 243: lvvse SgwPS gggta GUB_NICPL : 174- 178: tlign SfpPS qgsfr GUB_NICPL : 272- 276: ivvse SgwPS agafa P 16: 12.0102 40( 24) L-x(5)-D-x(4,5)-A Occurences: 40(24) BGL2_CANAL : 82- 94: gfqiq LgiwpnDdahfeA ekeal BGL2_YEAST : 136- 148: ltasq LsdkinDvrsvvA disds E132_ARATH : 49- 60: dieli LdvpssDlerl-A ssqte E132_ARATH : 203- 214: ysyqn LfdanlDsvya-A leksg E13A_HORVU : 53- 65: gigli LdvggnDvlaslA anasn E13A_HORVU : 208- 219: ltsqc LfdamvDavva-A lersg E13A_LYCES : 77- 88: nieii LdvpnqDleal-A npskr E13A_LYCES : 231- 242: agyqn LfdalvDsmyf-A teklg E13B_HORVU : 233- 244: ltyts LfdamvDavya-A lekag E13B_LYCES : 239- 250: rqyrn LfdamlDsvya-A mdrtg E13B_NICPL : 86- 97: nievm LglpnsDvkhi-A sgmeh E13B_NICPL : 247- 258: rqyrn LfdamlDsvya-A lersg E13B_PEA : 85- 96: gieli LgipnsDlqtl-A tnqds E13B_PEA : 246- 257: ngyqn LfdamlDsvha-A ldntg E13B_PHAVU : 53- 64: gieli LgvpnsDlqgl-A tnadt E13B_PHAVU : 214- 225: ygyqn LfdamlDsvha-A idntr E13B_TOBAC : 87- 98: nievm LglpnsDvkhi-A sgmeh E13B_TOBAC : 248- 259: rqyrn LfdamlDsvya-A lersg E13C_HORVU : 229- 240: ltytn LfdamvDsiya-A lekag E13C_TOBAC : 87- 98: nieii LdvpnqDleal-A nssia E13C_TOBAC : 242- 253: tgyqn LfdallDsiyf-A vekag E13D_HORVU : 52- 63: girlm LgttnnDvavl-A gslsa E13D_HORVU : 207- 218: liytn LfnamvDamya-A lekag E13D_TOBAC : 87- 98: nieii LevpnqDleal-A nssia E13D_TOBAC : 242- 253: tgyqn LfdallDsiyf-A vekag E13E_HORVU : 209- 220: ltyts LfdamvDsiya-A lekag E13E_TOBAC : 86- 97: nievm LglpnsDvkhi-A sgmeh E13E_TOBAC : 247- 258: rqyrn LfdamlDsvya-A lersg E13F_HORVU : 58- 69: glgvv LgtlnsDlapl-A sdasy E13F_HORVU : 65- 76: tlnsd LaplasDasya-A swvhs E13F_TOBAC : 86- 97: nievm LglpnsDvkhi-A sgmeh E13F_TOBAC : 247- 258: rqyrn LfdamlDsvya-A lersg E13G_TOBAC : 238- 249: agyqn LfdallDsmyf-A vekag E13H_TOBAC : 14- 26: lllsv LtlatlDftgaqA gvcyg E13H_TOBAC : 77- 88: nielm LgvpnpDlenv-A asqan E13H_TOBAC : 77- 89: nielm LgvpnpDlenvaA sqana E13H_TOBAC : 236- 247: rgyrn LfdailDatys-A lekas EA6_ARATH : 254- 265: lvyrn LldqmlDsvlf-A mtklg GUB2_HORVU : 212- 223: ygyqn LfdttvDafyt-A mgkhg GUB_NICPL : 84- 95: nievm LgvpnsDlqni-A anpsn GUB_NICPL : 84- 96: nievm LgvpnsDlqniaA npsna GUB_NICPL : 245- 256: lgyrn LfdamsDavya-A lsrag Q 17: 11.5102 41( 24) S-x(0,1)-G-x(2,3)-S Occurences: 41(24) BGL2_CANAL : 281- 285: wkpdt S-Gts-S vekhw BGL2_YEAST : 153- 159: adisd SdGksyS gkqvg E132_ARATH : 12- 18: rylak SiGrcgS lqttk E132_ARATH : 218- 222: aalek S-Ggg-S leivv E13A_HORVU : 235- 239: vvvse S-Gwp-S asgfa E13A_LYCES : 258- 262: iivse S-Gwp-S eghps E13A_LYCES : 262- 267: esgwp SeGhp-S atlen E13B_HORVU : 260- 264: vvvse S-Gwp-S aggfa E13B_LYCES : 258- 264: rtggg SvGivvS esgwp E13B_LYCES : 266- 270: ivvse S-Gwp-S agafg E13B_NICPL : 262- 266: aaler S-Gga-S vgivv E13B_NICPL : 266- 272: rsgga SvGivvS esgwp E13B_NICPL : 274- 278: ivvse S-Gwp-S agafg E13B_PEA : 179- 185: nsfpp SkGsfrS dvrsy E13B_PEA : 273- 277: vvvse S-Gwp-S dggsa E13B_PHAVU : 241- 245: vvvse S-Gwp-S dggfg E13B_TOBAC : 263- 267: aaler S-Gga-S vgivv E13B_TOBAC : 267- 273: rsgga SvGivvS esgwp E13B_TOBAC : 275- 279: ivvse S-Gwp-S agafg E13B_TOBAC : 351- 357: infgv SgGvwdS svetn E13C_HORVU : 256- 260: vvise S-Gwp-S dqgfg E13C_TOBAC : 124- 130: kfkyi SiGnevS psnng E13C_TOBAC : 269- 273: iivse S-Gwp-S egnsa E13D_HORVU : 234- 238: vvvse S-Gwp-S aggfa E13D_TOBAC : 124- 130: kfkyi SiGnevS ptnng E13D_TOBAC : 269- 273: iivse S-Gwp-S egnsa E13E_HORVU : 236- 240: vvvse S-Gwp-S aggfg E13E_TOBAC : 262- 266: aaler S-Gga-S vgivv E13E_TOBAC : 266- 272: rsgga SvGivvS esgwp E13E_TOBAC : 274- 278: ivvse S-Gwp-S agafg E13E_TOBAC : 350- 356: infgv SgGvwdS svetn E13F_HORVU : 146- 151: tsypp SqGtf-S eaalp E13F_TOBAC : 262- 266: aaler S-Gga-S vgivv E13F_TOBAC : 266- 272: rsgga SvGivvS esgwp E13F_TOBAC : 274- 278: ivvse S-Gwp-S agafg E13F_TOBAC : 350- 356: lnfgv SgGvwdS svetn E13G_TOBAC : 265- 269: iivse S-Gwp-S egnsa E13H_TOBAC : 263- 267: ivvse S-Gwp-S agagq EA6_ARATH : 141- 145: ilsyn S-Gnv-S vnlvp GUB2_HORVU : 239- 243: lvvse S-Gwp-S gggta GUB_NICPL : 272- 276: ivvse S-Gwp-S agafa R 18: 11.5102 38( 24) S-x(0,1)-G-x(1,2)-S Occurences: 38(24) BGL2_CANAL : 237- 241: ptdgs SyGd-S vpsve BGL2_CANAL : 281- 284: wkpdt S-Gt-S svekh BGL2_CANAL : 281- 285: wkpdt S-GtsS vekhw BGL2_YEAST : 153- 157: adisd SdGk-S ysgkq BGL2_YEAST : 286- 289: wkpnt S-Gt-S dvekh E132_ARATH : 218- 222: aalek SgGg-S leivv E132_ARATH : 218- 222: aalek S-GggS leivv E13A_HORVU : 235- 239: vvvse S-GwpS asgfa E13A_LYCES : 258- 262: iivse S-GwpS eghps E13A_LYCES : 262- 267: esgwp SeGhpS atlen E13B_HORVU : 260- 264: vvvse S-GwpS aggfa E13B_LYCES : 266- 270: ivvse S-GwpS agafg E13B_NICPL : 262- 266: aaler SgGa-S vgivv E13B_NICPL : 262- 266: aaler S-GgaS vgivv E13B_NICPL : 274- 278: ivvse S-GwpS agafg E13B_PEA : 273- 277: vvvse S-GwpS dggsa E13B_PEA : 277- 281: esgwp SdGg-S atsyd E13B_PHAVU : 241- 245: vvvse S-GwpS dggfg E13B_TOBAC : 263- 267: aaler SgGa-S vgivv E13B_TOBAC : 263- 267: aaler S-GgaS vgivv E13B_TOBAC : 275- 279: ivvse S-GwpS agafg E13C_HORVU : 121- 125: nevmd SaGq-S tilpa E13C_HORVU : 256- 260: vvise S-GwpS dqgfg E13C_TOBAC : 269- 273: iivse S-GwpS egnsa E13C_TOBAC : 273- 277: esgwp SeGn-S aatie E13D_HORVU : 234- 238: vvvse S-GwpS aggfa E13D_TOBAC : 269- 273: iivse S-GwpS egnsa E13D_TOBAC : 273- 277: esgwp SeGn-S aatie E13E_HORVU : 236- 240: vvvse S-GwpS aggfg E13E_TOBAC : 262- 266: aaler SgGa-S vgivv E13E_TOBAC : 262- 266: aaler S-GgaS vgivv E13E_TOBAC : 274- 278: ivvse S-GwpS agafg E13F_HORVU : 146- 151: tsypp SqGtfS eaalp E13F_TOBAC : 262- 266: aaler SgGa-S vgivv E13F_TOBAC : 262- 266: aaler S-GgaS vgivv E13F_TOBAC : 274- 278: ivvse S-GwpS agafg E13G_TOBAC : 265- 269: iivse S-GwpS egnsa E13G_TOBAC : 269- 273: esgwp SeGn-S aatie E13H_TOBAC : 252- 255: aleka S-Gs-S leivv E13H_TOBAC : 263- 267: ivvse S-GwpS agagq EA6_ARATH : 141- 145: ilsyn S-GnvS vnlvp GUB2_HORVU : 239- 243: lvvse S-GwpS gggta GUB_NICPL : 272- 276: ivvse S-GwpS agafa GUB_NICPL : 345- 349: pkypl SfGf-S drywd S 19: 11.5102 43( 24) L-x(2,3)-A-x(3,4)-S Occurences: 43(24) BGL2_CANAL : 6- 15: mqikf LttlAtvltS vaamg BGL2_YEAST : 14- 22: taata LfftAsqv-S aigel E132_ARATH : 203- 210: ysyqn Lfd-Anld-S vyaal E13A_HORVU : 61- 69: ggndv LaslAana-S naanw E13A_LYCES : 231- 238: agyqn Lfd-Alvd-S myfat E13B_HORVU : 87- 95: igndq LaniAast-S naasw E13B_LYCES : 239- 246: rqyrn Lfd-Amld-S vyaam E13B_LYCES : 288- 296: tylrn LiqhAkeg-S prkpg E13B_NICPL : 247- 254: rqyrn Lfd-Amld-S vyaal E13B_NICPL : 296- 304: tylkn LiqhAkeg-S prkpr E13B_PEA : 92- 101: ipnsd LqtlAtnqdS arqwv E13B_PEA : 224- 231: prdis Lpy-Alft-S pgvmv E13B_PEA : 246- 253: ngyqn Lfd-Amld-S vhaal E13B_PHAVU : 192- 199: prdis Lpy-Alft-S pnvvv E13B_PHAVU : 214- 221: ygyqn Lfd-Amld-S vhaai E13B_PHAVU : 263- 271: vyldn LvrrAgrg-S prrps E13B_TOBAC : 248- 255: rqyrn Lfd-Amld-S vyaal E13B_TOBAC : 297- 305: tylrn LiqhAkeg-S prkpg E13C_HORVU : 83- 91: dvgpa LpslAssp-S aaaaw E13C_HORVU : 229- 236: ltytn Lfd-Amvd-S iyaal E13C_TOBAC : 242- 249: tgyqn Lfd-Alld-S iyfav E13D_HORVU : 219- 226: amyaa Lek-Agap-S vrvvv E13D_TOBAC : 242- 249: tgyqn Lfd-Alld-S iyfav E13E_HORVU : 115- 122: nvhna Las-Anls-S sikvs E13E_HORVU : 115- 123: nvhna Las-AnlssS ikvst E13E_HORVU : 152- 161: rdpsg LvpiArfldS tgapf E13E_HORVU : 209- 216: ltyts Lfd-Amvd-S iyaal E13E_TOBAC : 247- 254: rqyrn Lfd-Amld-S vyaal E13E_TOBAC : 296- 304: tylrn LiqhAkeg-S prkpg E13F_HORVU : 65- 73: tlnsd LaplAsda-S yaasw E13F_HORVU : 68- 77: sdlap LasdAsyaaS wvhsy E13F_HORVU : 191- 198: pssvr Ldy-Alls-S saava E13F_HORVU : 191- 199: pssvr Ldy-AllssS aavav E13F_TOBAC : 247- 254: rqyrn Lfd-Amld-S vyaal E13F_TOBAC : 296- 304: tylrn LiqhAkeg-S prkpg E13G_TOBAC : 238- 245: agyqn Lfd-Alld-S myfav E13H_TOBAC : 37- 45: rqgng LpspAdvv-S lcnrn E13H_TOBAC : 214- 221: nadik Ley-Alft-S sevvv E13H_TOBAC : 214- 222: nadik Ley-AlftsS evvvn E13H_TOBAC : 248- 255: atysa Lek-Asgs-S leivv EA6_ARATH : 73- 80: aghvk Lyd-Adpe-S ltlls EA6_ARATH : 405- 412: eleet Lrm-Acaq-S nttca GUB2_HORVU : 18- 26: msann Lpa-AstvvS mfkfn GUB2_HORVU : 179- 186: niypy Law-Aynp-S amdmg GUB_NICPL : 91- 99: vpnsd LqniAanp-S nannw GUB_NICPL : 257- 264: avyaa Lsr-Aggg-S ieivv T 20: 11.5102 43( 24) L-x(2,3)-A-x(2,3)-S Occurences: 43(24) BGL2_CANAL : 213- 219: qalqt Lqt-Akg-S tdief BGL2_YEAST : 14- 22: taata LfftAsqvS aigel E132_ARATH : 203- 210: ysyqn Lfd-AnldS vyaal E13A_HORVU : 61- 69: ggndv LaslAanaS naanw E13A_LYCES : 84- 91: vpnqd LealAnp-S krqgw E13A_LYCES : 231- 238: agyqn Lfd-AlvdS myfat E13B_HORVU : 87- 95: igndq LaniAastS naasw E13B_LYCES : 239- 246: rqyrn Lfd-AmldS vyaam E13B_LYCES : 288- 296: tylrn LiqhAkegS prkpg E13B_NICPL : 247- 254: rqyrn Lfd-AmldS vyaal E13B_NICPL : 296- 304: tylkn LiqhAkegS prkpr E13B_PEA : 224- 231: prdis Lpy-AlftS pgvmv E13B_PEA : 246- 253: ngyqn Lfd-AmldS vhaal E13B_PHAVU : 192- 199: prdis Lpy-AlftS pnvvv E13B_PHAVU : 214- 221: ygyqn Lfd-AmldS vhaai E13B_PHAVU : 263- 271: vyldn LvrrAgrgS prrps E13B_TOBAC : 248- 255: rqyrn Lfd-AmldS vyaal E13B_TOBAC : 297- 305: tylrn LiqhAkegS prkpg E13C_HORVU : 83- 91: dvgpa LpslAsspS aaaaw E13C_HORVU : 229- 236: ltytn Lfd-AmvdS iyaal E13C_TOBAC : 94- 101: vpnqd LealAns-S iangw E13C_TOBAC : 242- 249: tgyqn Lfd-AlldS iyfav E13D_HORVU : 219- 226: amyaa Lek-AgapS vrvvv E13D_TOBAC : 94- 101: vpnqd LealAns-S iangw E13D_TOBAC : 242- 249: tgyqn Lfd-AlldS iyfav E13E_HORVU : 115- 121: nvhna Las-Anl-S ssikv E13E_HORVU : 115- 122: nvhna Las-AnlsS sikvs E13E_HORVU : 209- 216: ltyts Lfd-AmvdS iyaal E13E_TOBAC : 247- 254: rqyrn Lfd-AmldS vyaal E13E_TOBAC : 296- 304: tylrn LiqhAkegS prkpg E13F_HORVU : 65- 73: tlnsd LaplAsdaS yaasw E13F_HORVU : 121- 127: nleaa Lqa-Agl-S vpvtt E13F_HORVU : 191- 197: pssvr Ldy-All-S ssaav E13F_HORVU : 191- 198: pssvr Ldy-AllsS saava E13F_TOBAC : 247- 254: rqyrn Lfd-AmldS vyaal E13F_TOBAC : 296- 304: tylrn LiqhAkegS prkpg E13G_TOBAC : 238- 245: agyqn Lfd-AlldS myfav E13H_TOBAC : 37- 45: rqgng LpspAdvvS lcnrn E13H_TOBAC : 214- 221: nadik Ley-AlftS sevvv E13H_TOBAC : 248- 254: atysa Lek-Asg-S sleiv E13H_TOBAC : 248- 255: atysa Lek-AsgsS leivv EA6_ARATH : 73- 80: aghvk Lyd-AdpeS ltlls EA6_ARATH : 405- 412: eleet Lrm-AcaqS nttca GUB2_HORVU : 179- 186: niypy Law-AynpS amdmg GUB_NICPL : 91- 99: vpnsd LqniAanpS nannw GUB_NICPL : 257- 264: avyaa Lsr-AgggS ieivv Number of patterns evaluated by Pratt:2859 Total running time: 6 seconds