------------------------------------------------------------ Pratt version 2.1, Sept. 1996 Written by Inge Jonassen, University of Bergen Norway email: inge@ii.uib.no For more information, see http://www.ii.uib.no/~inge/Pratt.html ------------------------------------------------------------ Please quote: I.Jonassen, J.F.Collins, D.G.Higgins. Protein Science 1995;4(8):1587-1595. ------------------------------------------------------------ Pratt version 2.1 Analysing 21 sequences from file DNAA PATTERN CONSERVATION: CM: min Nr of Seqs to Match 21 C%: min Percentage Seqs to Match 100.0 PATTERN RESTRICTIONS : PP: pos in seq [off,complete,start] off PL: max Pattern Length 50 PN: max Nr of Pattern Symbols 50 PX: max Nr of consecutive x's 5 FN: max Nr of flexible spacers 2 FL: max Flexibility 2 FP: max Flex.Product 10 BI: Input Pattern Symbol File off BN: Nr of Pattern Symbols Initial Search 20 PATTERN SCORING: S: Scoring [info,mdl,tree,dist,ppv] info SEARCH PARAMETERS: G: Pattern Graph from [seq,al,query] seq E: Search Greediness 3 R: Pattern Refinement on RG: Generalise ambiguous symbols off OUTPUT: OF: Output Filename DNAA.pratt2 OP: PROSITE Pattern Format on ON: max number patterns 20 OA: max number Alignments 20 M: Print Patterns in sequences off Sequence lengths: DNAA_BACSU 446 DNAA_BORBU 486 DNAA_BUCAP 454 DNAA_CAUCR 490 DNAA_ECOLI 467 DNAA_HAEIN 454 DNAA_MICLU 515 DNAA_MYCCA 450 DNAA_MYCGE 117 DNAA_MYCLE 521 DNAA_MYCMY 263 DNAA_PROMI 466 DNAA_PSEPU 506 DNAA_RHIME 507 DNAA_SALTY 466 DNAA_SERMA 464 DNAA_SPIAP 263 DNAA_SPICI 450 DNAA_STRCO 656 DNAA_THEMA 440 DNAA_WOLSP 186 Pratt run started at Thu Feb 6 19:18:40 1997 Best Patterns before refinement: fitness hits(seqs) Pattern 1: 12.0102 39( 21) E-x-F-x(2,3)-F 2: 11.5102 45( 21) E-x(0,1)-F-x(2,3)-F 3: 11.5102 44( 21) E-x(1,2)-F-x(2,3)-F 4: 11.5102 30( 21) T-x(2,3)-L-x(1,2)-I 5: 11.5102 38( 21) K-x(1,2)-L-x(2,3)-A 6: 11.0102 33( 21) K-x(1,3)-E-x(0,1)-L 7: 11.0102 34( 21) D-x(1,2)-L-x(2,4)-R 8: 11.0102 34( 21) K-x(4,5)-S-x(1,3)-P 9: 11.0102 30( 21) L-x(2,3)-I-x(0,2)-E 10: 11.0102 44( 21) L-x(1,3)-I-x(3,4)-F 11: 11.0102 38( 21) L-x(2,4)-L-x(4,5)-E 12: 11.0102 61( 21) E-x(0,1)-L-x(3,5)-L 13: 11.0102 42( 21) I-x(0,2)-E-x(3,4)-E 14: 11.0102 43( 21) L-x(0,2)-L-x(1,2)-A 15: 11.0102 43( 21) K-x(0,2)-L-x(2,3)-A 16: 11.0102 39( 21) L-x(2,3)-I-x(2,4)-K 17: 11.0102 28( 21) V-x(1,3)-A-x(3,4)-I 18: 10.5102 28( 21) L-x(2,4)-K-x(1,3)-Q 19: 10.5102 41( 21) N-x(1,3)-L-x(3,5)-K 20: 10.5102 52( 21) E-x(2,4)-K-x(2,4)-L Best Patterns (after refinement phase): fitness hits(seqs) Pattern A 1: 12.0102 39( 21) E-x-F-x(2,3)-F B 2: 11.5102 45( 21) E-x(0,1)-F-x(2,3)-F C 3: 11.5102 44( 21) E-x(1,2)-F-x(2,3)-F D 4: 11.5102 30( 21) T-x(2,3)-L-x(1,2)-I E 5: 11.5102 38( 21) K-x(1,2)-L-x(2,3)-A F 6: 11.0102 33( 21) K-x(1,3)-E-x(0,1)-L G 7: 11.0102 34( 21) D-x(1,2)-L-x(2,4)-R H 8: 11.0102 34( 21) K-x(4,5)-S-x(1,3)-P I 9: 11.0102 30( 21) L-x(2,3)-I-x(0,2)-E J 10: 11.0102 44( 21) L-x(1,3)-I-x(3,4)-F K 11: 11.0102 38( 21) L-x(2,4)-L-x(4,5)-E L 12: 11.0102 61( 21) E-x(0,1)-L-x(3,5)-L M 13: 11.0102 42( 21) I-x(0,2)-E-x(3,4)-E N 14: 11.0102 43( 21) L-x(0,2)-L-x(1,2)-A O 15: 11.0102 43( 21) K-x(0,2)-L-x(2,3)-A P 16: 11.0102 39( 21) L-x(2,3)-I-x(2,4)-K Q 17: 11.0102 28( 21) V-x(1,3)-A-x(3,4)-I R 18: 10.5102 28( 21) L-x(2,4)-K-x(1,3)-Q S 19: 10.5102 41( 21) N-x(1,3)-L-x(3,5)-K T 20: 10.5102 52( 21) E-x(2,4)-K-x(2,4)-L Best patterns with alignements: fitness hits(seqs) Pattern A 1: 12.0102 39( 21) E-x-F-x(2,3)-F Occurences: 39(21) DNAA_BACSU : 183- 189: vylss EkFtneF insir DNAA_BACSU : 227- 233: keqtq EeFfhtF ntlhe DNAA_BACSU : 228- 233: eqtqe EfFht-F ntlhe DNAA_BORBU : 22- 28: kelse EeFyvwF enlcf DNAA_BORBU : 99- 104: npaln EtFsk-F dklke DNAA_BORBU : 215- 221: lyvta EnFlneF vesik DNAA_BORBU : 260- 265: egiqe ElFht-F nalye DNAA_BUCAP : 235- 241: kersq EeFfhtF nalle DNAA_BUCAP : 236- 241: ersqe EfFht-F nalle DNAA_CAUCR : 221- 227: vylta ErFlstF vravm DNAA_ECOLI : 248- 254: kersq EeFfhtF nalle DNAA_ECOLI : 249- 254: ersqe EfFht-F nalle DNAA_HAEIN : 236- 242: kektq EeFfhiF nslfe DNAA_HAEIN : 237- 242: ektqe EfFhi-F nslfe DNAA_MICLU : 246- 252: ryvns EeFtndF insir DNAA_MICLU : 290- 296: keatv EeFfhtF ntlyn DNAA_MICLU : 291- 296: eatve EfFht-F ntlyn DNAA_MYCCA : 226- 232: kektn EiFftiF nnfie DNAA_MYCGE : 54- 59: keilf EeFek-F hkksf DNAA_MYCLE : 254- 260: kyvst EeFtndF inslr DNAA_MYCLE : 298- 304: kegiq EeFfhtF ntlhn DNAA_MYCLE : 299- 304: egiqe EfFht-F ntlhn DNAA_MYCMY : 78- 84: kektn EiFftiF nnfie DNAA_PROMI : 247- 253: kersq EeFfhtF nalle DNAA_PROMI : 248- 253: ersqe EfFht-F nalle DNAA_PSEPU : 287- 293: kersq EeFfhtF nalle DNAA_PSEPU : 288- 293: ersqe EfFht-F nalle DNAA_RHIME : 240- 246: vylta EyFmwrF atair DNAA_SALTY : 247- 253: kersq EeFfhtF nalle DNAA_SALTY : 248- 253: ersqe EfFht-F nalle DNAA_SERMA : 245- 251: kersq EeFfhtF nalle DNAA_SERMA : 246- 251: ersqe EfFht-F nalle DNAA_SPIAP : 78- 84: sgktn EiFfnlF nffie DNAA_SPICI : 225- 231: rnktn ElFfhiF nsyie DNAA_STRCO : 389- 395: ryvss EeFtneF insir DNAA_STRCO : 433- 439: kestq EeFfhtF ntlhn DNAA_STRCO : 434- 439: estqe EfFht-F ntlhn DNAA_THEMA : 215- 220: tgvqt ElFht-F nelhd DNAA_WOLSP : 1- 6: EfFkt-F nalid B 2: 11.5102 45( 21) E-x(0,1)-F-x(2,3)-F Occurences: 45(21) DNAA_BACSU : 183- 189: vylss EkFtneF insir DNAA_BACSU : 227- 233: keqtq EeFfhtF ntlhe DNAA_BACSU : 228- 233: eqtqe EfFht-F ntlhe DNAA_BACSU : 228- 233: eqtqe E-FfhtF ntlhe DNAA_BORBU : 22- 28: kelse EeFyvwF enlcf DNAA_BORBU : 23- 28: elsee E-FyvwF enlcf DNAA_BORBU : 99- 104: npaln EtFsk-F dklke DNAA_BORBU : 215- 221: lyvta EnFlneF vesik DNAA_BORBU : 260- 265: egiqe ElFht-F nalye DNAA_BUCAP : 235- 241: kersq EeFfhtF nalle DNAA_BUCAP : 236- 241: ersqe EfFht-F nalle DNAA_BUCAP : 236- 241: ersqe E-FfhtF nalle DNAA_CAUCR : 221- 227: vylta ErFlstF vravm DNAA_ECOLI : 248- 254: kersq EeFfhtF nalle DNAA_ECOLI : 249- 254: ersqe EfFht-F nalle DNAA_ECOLI : 249- 254: ersqe E-FfhtF nalle DNAA_HAEIN : 236- 242: kektq EeFfhiF nslfe DNAA_HAEIN : 237- 242: ektqe EfFhi-F nslfe DNAA_HAEIN : 237- 242: ektqe E-FfhiF nslfe DNAA_MICLU : 246- 252: ryvns EeFtndF insir DNAA_MICLU : 247- 252: yvnse E-FtndF insir DNAA_MICLU : 290- 296: keatv EeFfhtF ntlyn DNAA_MICLU : 291- 296: eatve EfFht-F ntlyn DNAA_MICLU : 291- 296: eatve E-FfhtF ntlyn DNAA_MYCCA : 226- 232: kektn EiFftiF nnfie DNAA_MYCGE : 54- 59: keilf EeFek-F hkksf DNAA_MYCGE : 55- 59: eilfe E-Fek-F hkksf DNAA_MYCLE : 254- 260: kyvst EeFtndF inslr DNAA_MYCLE : 255- 260: yvste E-FtndF inslr DNAA_MYCLE : 298- 304: kegiq EeFfhtF ntlhn DNAA_MYCLE : 299- 304: egiqe EfFht-F ntlhn DNAA_MYCLE : 299- 304: egiqe E-FfhtF ntlhn DNAA_MYCMY : 78- 84: kektn EiFftiF nnfie DNAA_PROMI : 247- 253: kersq EeFfhtF nalle DNAA_PROMI : 248- 253: ersqe EfFht-F nalle DNAA_PROMI : 248- 253: ersqe E-FfhtF nalle DNAA_PSEPU : 260- 264: lnain E-Fkr-F yrsvd DNAA_PSEPU : 287- 293: kersq EeFfhtF nalle DNAA_PSEPU : 288- 293: ersqe EfFht-F nalle DNAA_PSEPU : 288- 293: ersqe E-FfhtF nalle DNAA_RHIME : 240- 246: vylta EyFmwrF atair DNAA_SALTY : 247- 253: kersq EeFfhtF nalle DNAA_SALTY : 248- 253: ersqe EfFht-F nalle DNAA_SALTY : 248- 253: ersqe E-FfhtF nalle DNAA_SERMA : 245- 251: kersq EeFfhtF nalle DNAA_SERMA : 246- 251: ersqe EfFht-F nalle DNAA_SERMA : 246- 251: ersqe E-FfhtF nalle DNAA_SPIAP : 78- 84: sgktn EiFfnlF nffie DNAA_SPICI : 225- 231: rnktn ElFfhiF nsyie DNAA_STRCO : 389- 395: ryvss EeFtneF insir DNAA_STRCO : 390- 395: yvsse E-FtneF insir DNAA_STRCO : 433- 439: kestq EeFfhtF ntlhn DNAA_STRCO : 434- 439: estqe EfFht-F ntlhn DNAA_STRCO : 434- 439: estqe E-FfhtF ntlhn DNAA_THEMA : 215- 220: tgvqt ElFht-F nelhd DNAA_WOLSP : 1- 6: EfFkt-F nalid DNAA_WOLSP : 1- 6: E-FfktF nalid C 3: 11.5102 44( 21) E-x(1,2)-F-x(2,3)-F Occurences: 44(21) DNAA_BACSU : 183- 189: vylss Ek-FtneF insir DNAA_BACSU : 227- 233: keqtq EefFht-F ntlhe DNAA_BACSU : 227- 233: keqtq Ee-FfhtF ntlhe DNAA_BACSU : 228- 233: eqtqe Ef-Fht-F ntlhe DNAA_BORBU : 21- 28: kkels EeeFyvwF enlcf DNAA_BORBU : 22- 28: kelse Ee-FyvwF enlcf DNAA_BORBU : 99- 104: npaln Et-Fsk-F dklke DNAA_BORBU : 215- 221: lyvta En-FlneF vesik DNAA_BORBU : 259- 265: kegiq EelFht-F nalye DNAA_BORBU : 260- 265: egiqe El-Fht-F nalye DNAA_BUCAP : 235- 241: kersq EefFht-F nalle DNAA_BUCAP : 235- 241: kersq Ee-FfhtF nalle DNAA_BUCAP : 236- 241: ersqe Ef-Fht-F nalle DNAA_CAUCR : 221- 227: vylta Er-FlstF vravm DNAA_ECOLI : 248- 254: kersq EefFht-F nalle DNAA_ECOLI : 248- 254: kersq Ee-FfhtF nalle DNAA_ECOLI : 249- 254: ersqe Ef-Fht-F nalle DNAA_HAEIN : 236- 242: kektq EefFhi-F nslfe DNAA_HAEIN : 236- 242: kektq Ee-FfhiF nslfe DNAA_HAEIN : 237- 242: ektqe Ef-Fhi-F nslfe DNAA_MICLU : 246- 252: ryvns Ee-FtndF insir DNAA_MICLU : 290- 296: keatv EefFht-F ntlyn DNAA_MICLU : 290- 296: keatv Ee-FfhtF ntlyn DNAA_MICLU : 291- 296: eatve Ef-Fht-F ntlyn DNAA_MYCCA : 111- 117: nkkvn EntFen-F vigss DNAA_MYCCA : 226- 232: kektn EifFti-F nnfie DNAA_MYCCA : 226- 232: kektn Ei-FftiF nnfie DNAA_MYCGE : 50- 56: tenlk EilFee-F ekfhk DNAA_MYCGE : 54- 59: keilf Ee-Fek-F hkksf DNAA_MYCLE : 254- 260: kyvst Ee-FtndF inslr DNAA_MYCLE : 298- 304: kegiq EefFht-F ntlhn DNAA_MYCLE : 298- 304: kegiq Ee-FfhtF ntlhn DNAA_MYCLE : 299- 304: egiqe Ef-Fht-F ntlhn DNAA_MYCMY : 78- 84: kektn EifFti-F nnfie DNAA_MYCMY : 78- 84: kektn Ei-FftiF nnfie DNAA_PROMI : 247- 253: kersq EefFht-F nalle DNAA_PROMI : 247- 253: kersq Ee-FfhtF nalle DNAA_PROMI : 248- 253: ersqe Ef-Fht-F nalle DNAA_PSEPU : 287- 293: kersq EefFht-F nalle DNAA_PSEPU : 287- 293: kersq Ee-FfhtF nalle DNAA_PSEPU : 288- 293: ersqe Ef-Fht-F nalle DNAA_RHIME : 240- 246: vylta Ey-FmwrF atair DNAA_SALTY : 247- 253: kersq EefFht-F nalle DNAA_SALTY : 247- 253: kersq Ee-FfhtF nalle DNAA_SALTY : 248- 253: ersqe Ef-Fht-F nalle DNAA_SERMA : 245- 251: kersq EefFht-F nalle DNAA_SERMA : 245- 251: kersq Ee-FfhtF nalle DNAA_SERMA : 246- 251: ersqe Ef-Fht-F nalle DNAA_SPIAP : 78- 84: sgktn EifFnl-F nffie DNAA_SPIAP : 78- 84: sgktn Ei-FfnlF nffie DNAA_SPICI : 225- 231: rnktn ElfFhi-F nsyie DNAA_SPICI : 225- 231: rnktn El-FfhiF nsyie DNAA_STRCO : 389- 395: ryvss Ee-FtneF insir DNAA_STRCO : 433- 439: kestq EefFht-F ntlhn DNAA_STRCO : 433- 439: kestq Ee-FfhtF ntlhn DNAA_STRCO : 434- 439: estqe Ef-Fht-F ntlhn DNAA_THEMA : 19- 25: nrksw ElwFss-F dvksi DNAA_THEMA : 215- 220: tgvqt El-Fht-F nelhd DNAA_WOLSP : 1- 6: Ef-Fkt-F nalid D 4: 11.5102 30( 21) T-x(2,3)-L-x(1,2)-I Occurences: 30(21) DNAA_BACSU : 70- 76: tiyel TgeeLs-I kfvip DNAA_BACSU : 398- 405: lsrem TdssLpkI geefg DNAA_BORBU : 190- 196: vglgk Thl-LqsI gnkte DNAA_BUCAP : 166- 172: tglgk Thl-LhaI gngil DNAA_BUCAP : 405- 412: makel TnhsLpeI gdafs DNAA_CAUCR : 441- 448: lakql TtrsLpdI grrfg DNAA_CAUCR : 442- 448: akqlt Trs-LpdI grrfg DNAA_ECOLI : 418- 425: lakel TnhsLpeI gdafg DNAA_HAEIN : 55- 61: kgwve Thy-LaqI qqicq DNAA_HAEIN : 167- 173: tglgk Thl-LhaI gngil DNAA_HAEIN : 406- 413: lakel TnrsLpeI grafd DNAA_MICLU : 221- 227: sglgk Thl-LhaI ghyar DNAA_MICLU : 461- 468: llrel TemsLpkI gqvlg DNAA_MYCCA : 350- 355: frdip Tsk-Lg-I lnvkk DNAA_MYCGE : 45- 51: qnlin Ten-LkeI lfeef DNAA_MYCLE : 469- 476: lcrel TdlsLpkI gqafg DNAA_MYCMY : 202- 207: frdip Tsk-Lg-I lnvkk DNAA_PROMI : 417- 424: lakel TnhsLpeI gdafg DNAA_PSEPU : 457- 464: lskel TnhsLpeI gdmfg DNAA_RHIME : 215- 221: vglgk Thl-LqaI alaal DNAA_SALTY : 417- 424: lakel TnhsLpeI gdafg DNAA_SERMA : 415- 422: lakel TnhsLpeI gdafg DNAA_SPIAP : 7- 13: sglgk Thl-LkaI aheig DNAA_SPIAP : 52- 59: keies TkekLskI dvlli DNAA_SPICI : 3- 8: mn Tke-Lw-I evkei DNAA_SPICI : 153- 159: sglgk Thl-LhaI enkvn DNAA_STRCO : 364- 370: sglgk Thl-LhaI ghyar DNAA_STRCO : 606- 613: lcrel TdlsLpkI galfg DNAA_THEMA : 144- 150: vglgk Thl-LqsI gnyvv DNAA_WOLSP : 169- 176: fakkf TqksLpdI grnfg E 5: 11.5102 38( 21) K-x(1,2)-L-x(2,3)-A Occurences: 38(21) DNAA_BACSU : 157- 163: gvglg KthLmh-A ighyv DNAA_BORBU : 208- 214: lhhnl Ki-LyvtA enfln DNAA_BORBU : 330- 337: ginvp KniLnlvA qkvtt DNAA_BUCAP : 165- 171: gtglg KthLlh-A igngi DNAA_BUCAP : 199- 205: vqdmv Ka-LqnnA iekfk DNAA_CAUCR : 35- 41: vcval KreLgd-A afgsw DNAA_CAUCR : 35- 42: vcval KreLgdaA fgswi DNAA_CAUCR : 98- 105: rridl KsrLefeA aagay DNAA_CAUCR : 195- 201: pygfg KthLln-A lawea DNAA_CAUCR : 240- 246: qtaaf KeeLra-A dllii DNAA_ECOLI : 178- 184: gtglg KthLlh-A vgngi DNAA_ECOLI : 212- 218: vqdmv Ka-LqnnA ieefk DNAA_HAEIN : 166- 172: gtglg KthLlh-A igngi DNAA_MICLU : 220- 226: esglg KthLlh-A ighya DNAA_MYCCA : 154- 160: esgmg KthLlk-A aknyi DNAA_MYCCA : 154- 161: esgmg KthLlkaA knyie DNAA_MYCGE : 30- 35: ngiat Kl-Lff-A ktskq DNAA_MYCLE : 228- 234: esglg KthLlh-A agnya DNAA_MYCLE : 228- 235: esglg KthLlhaA gnyaq DNAA_MYCLE : 493- 499: myaqr Ki-LsemA errev DNAA_MYCMY : 6- 12: esgmg KthLlk-A aknyi DNAA_MYCMY : 6- 13: esgmg KthLlkaA knyie DNAA_PROMI : 177- 183: gtglg KthLlh-A vgnsi DNAA_PROMI : 211- 217: vqdmv Ka-LqnnA iedfk DNAA_PSEPU : 217- 223: gvglg KthLmh-A vgnhl DNAA_PSEPU : 251- 257: vadmv Ka-LqlnA inefk DNAA_PSEPU : 353- 360: kadqa KveLphdA affia DNAA_RHIME : 214- 220: svglg KthLlq-A ialaa DNAA_RHIME : 342- 348: rleml KrrLea-A rqdda DNAA_SALTY : 177- 183: gtglg KthLlh-A vgngi DNAA_SALTY : 211- 217: vqdmv Ka-LqnnA ieefk DNAA_SERMA : 175- 181: gtglg KthLlh-A vgngi DNAA_SERMA : 209- 215: vqdmv Ka-LqnnA ieefk DNAA_SPIAP : 6- 12: dsglg KthLlk-A iahei DNAA_SPICI : 152- 158: dsglg KthLlh-A ienkv DNAA_SPICI : 320- 326: legai KrlLfl-A vmnkk DNAA_SPICI : 320- 326: legai Kr-LlflA vmnkk DNAA_SPICI : 437- 442: tnkef Kh-Lvn-A irrki DNAA_STRCO : 363- 369: esglg KthLlh-A ighya DNAA_THEMA : 61- 68: lskav KvvLgndA tfeit DNAA_THEMA : 387- 394: aknyl KssLrtiA ekfnr DNAA_WOLSP : 14- 20: lidqn Kq-LvisA drsps DNAA_WOLSP : 71- 78: nmyvp KdvLeflA rniks F 6: 11.0102 33( 21) K-x(1,3)-E-x(0,1)-L Occurences: 33(21) DNAA_BACSU : 288- 294: ailrk KakaEgL dipne DNAA_BACSU : 290- 294: lrkka Ka--EgL dipne DNAA_BACSU : 439- 445: lqqhv KeikEqL k DNAA_BORBU : 16- 19: iltei Kk--E-L seeef DNAA_BORBU : 60- 66: ekrft KkikEiL ikngy DNAA_BORBU : 61- 66: krftk Kik-EiL ikngy DNAA_BORBU : 199- 203: qsign Kte-E-L hhnlk DNAA_BORBU : 199- 203: qsign Kt--EeL hhnlk DNAA_BORBU : 307- 312: nvdis KpnfE-L raaiv DNAA_BUCAP : 430- 434: lhacr Ki--EqL rkenh DNAA_CAUCR : 35- 38: vcval Kr--E-L gdaaf DNAA_CAUCR : 240- 243: qtaaf Ke--E-L raadl DNAA_ECOLI : 443- 447: lhacr Ki--EqL reesh DNAA_HAEIN : 265- 270: pkeie Kie-ErL ksrfg DNAA_MICLU : 351- 357: ailrk KaeaEgL vappe DNAA_MICLU : 486- 490: ihadr Kir-E-L maerr DNAA_MYCCA : 248- 252: ffssd Ksp-E-L lngfd DNAA_MYCCA : 248- 253: ffssd Ksp-ElL ngfdn DNAA_MYCGE : 90- 93: lsenr Ka--E-L vrvrd DNAA_MYCLE : 359- 365: ailrk KaqmErL avpgd DNAA_MYCMY : 100- 104: ffssd Ksp-E-L lngfd DNAA_MYCMY : 100- 105: ffssd Ksp-ElL ngfdn DNAA_PROMI : 442- 446: lhacr Ki--EqL reesh DNAA_PSEPU : 312- 317: sdryp Kei-EgL eerlk DNAA_PSEPU : 353- 356: kadqa Kv--E-L phdaa DNAA_PSEPU : 482- 486: lhacr Kin-E-L kesda DNAA_RHIME : 101- 105: dseil Kv--EiL vrtat DNAA_RHIME : 483- 487: lhavr Kie-E-L isadt DNAA_RHIME : 483- 487: lhavr Ki--EeL isadt DNAA_SALTY : 442- 446: lhacr Ki--EqL reesh DNAA_SERMA : 440- 444: lhacr Ki--EqL reesh DNAA_SPIAP : 100- 105: vltsd Kfp-EqL ngfdk DNAA_SPIAP : 186- 190: nsaap Kii-E-L edink DNAA_SPICI : 222- 226: lakrn Ktn-E-L ffhif DNAA_STRCO : 494- 500: ailrk KavqEqL nappe DNAA_THEMA : 16- 20: trvnr Ksw-E-L wfssf DNAA_WOLSP : 71- 77: nmyvp KdvlEfL arnik G 7: 11.0102 34( 21) D-x(1,2)-L-x(2,4)-R Occurences: 34(21) DNAA_BACSU : 52- 57: nefar Dw-Les--R ylhli DNAA_BACSU : 259- 264: iptle Dr-Lrs--R fewgl DNAA_BORBU : 291- 296: ltnft Dr-Lks--R ftrgl DNAA_BUCAP : 267- 272: ingve Dr-Lks--R fgwgl DNAA_BUCAP : 380- 385: kikva Dl-Lsr--R rsrsv DNAA_BUCAP : 380- 386: kikva Dl-Lsrr-R srsva DNAA_CAUCR : 416- 421: gmkqa Dl-Lse--R rnrav DNAA_CAUCR : 416- 422: gmkqa Dl-Lser-R nrava DNAA_ECOLI : 280- 285: ingve Dr-Lks--R fgwgl DNAA_ECOLI : 393- 398: kikva Dl-Lsk--R rsrsv DNAA_ECOLI : 393- 399: kikva Dl-Lskr-R srsva DNAA_HAEIN : 353- 360: rdtlk Di-LalqeR lvtie DNAA_MICLU : 69- 76: adalt Da-LtqefR eeill DNAA_MICLU : 86- 93: laisi DanLqpp-R tpsse DNAA_MICLU : 322- 327: lsgfe Dr-Lrs--R fewgl DNAA_MYCCA : 257- 263: llngf DnrLit--R fnmgl DNAA_MYCGE : 82- 89: fnvpm DsvLsen-R kaelv DNAA_MYCLE : 103- 108: rtpit Da-Lsr--R lgqqi DNAA_MYCLE : 330- 335: latle Dr-Lrt--R fewgl DNAA_MYCMY : 109- 115: llngf DnrLit--R fnmgl DNAA_PROMI : 279- 284: ingve Dr-Lks--R fgwgl DNAA_PROMI : 392- 397: kikva Dl-Lsk--R rsrsv DNAA_PROMI : 392- 398: kikva Dl-Lskr-R srsva DNAA_PSEPU : 432- 437: kikis Dl-Lsk--R rsrsv DNAA_PSEPU : 432- 438: kikis Dl-Lskr-R srsva DNAA_RHIME : 31- 36: hdmrh Da-Lfe--R vsarl DNAA_SALTY : 279- 284: ingve Dr-Lks--R fgwgl DNAA_SALTY : 392- 397: kikia Dl-Lsk--R rsrsv DNAA_SALTY : 392- 398: kikia Dl-Lskr-R srsva DNAA_SERMA : 277- 282: ingve Dr-Lks--R fgwgl DNAA_SERMA : 390- 395: kikva Dl-Lsk--R rsrsv DNAA_SERMA : 390- 396: kikva Dl-Lskr-R srsva DNAA_SPIAP : 109- 115: qlngf DkrLvs--R fsqgl DNAA_SPICI : 213- 220: cllid DiqLlak-R nktne DNAA_STRCO : 145- 151: grnra Dq-Lpta-R paypq DNAA_STRCO : 465- 470: lvtle Dr-Lrn--R fewgl DNAA_THEMA : 246- 251: lsefq Dr-Lvs--R fqmgl DNAA_THEMA : 296- 303: vaenv DdnLrrl-R gaiik DNAA_THEMA : 297- 303: aenvd Dn-Lrrl-R gaiik DNAA_WOLSP : 72- 79: myvpk Dv-LeflaR niksn DNAA_WOLSP : 116- 123: setli Dl-LrsnhR svtie H 8: 11.0102 34( 21) K-x(4,5)-S-x(1,3)-P Occurences: 34(21) DNAA_BACSU : 241- 250: lhees KqivisSdr-P pkeip DNAA_BACSU : 241- 250: lhees Kqivi-SsdrP pkeip DNAA_BACSU : 241- 251: lhees KqivisSdrpP keipt DNAA_BACSU : 343- 351: aaeal KdiipsSk--P kviti DNAA_BACSU : 343- 351: aaeal Kdiip-Ssk-P kviti DNAA_BACSU : 377- 386: edfka Kkrtk-SvafP rqiam DNAA_BORBU : 410- 419: lkith KdieghSkk-P eitka DNAA_BUCAP : 146- 154: asqva Knpgn-Syn-P lflyg DNAA_BUCAP : 402- 410: amama KeltnhSl--P eigda DNAA_CAUCR : 438- 446: amwla KqlttrSl--P digrr DNAA_ECOLI : 397- 406: adlls Krrsr-SvarP rqmam DNAA_ECOLI : 415- 423: amala KeltnhSl--P eigda DNAA_HAEIN : 385- 394: sdlks Ksrar-SvtrP rqiam DNAA_HAEIN : 403- 411: amala KeltnrSl--P eigra DNAA_MICLU : 304- 313: lynnn KqvvitSdl-P pkqls DNAA_MICLU : 304- 314: lynnn KqvvitSdlpP kqlsg DNAA_MYCCA : 135- 143: vqtvs Knpgi-Syn-P lfiyg DNAA_MYCCA : 240- 250: fiend KqlffsSdksP ellng DNAA_MYCGE : 58- 66: feefe Kfhkk-Sfd-P yllie DNAA_MYCLE : 312- 321: lhnan KqivisSdr-P pkqla DNAA_MYCLE : 312- 321: lhnan Kqivi-SsdrP pkqla DNAA_MYCLE : 312- 322: lhnan KqivisSdrpP kqlat DNAA_MYCMY : 92- 102: fiend KqlffsSdksP ellng DNAA_PROMI : 396- 405: adlls Krrsr-SvarP rqmam DNAA_PROMI : 414- 422: amala KeltnhSl--P eigda DNAA_PSEPU : 436- 445: sdlls Krrsr-SvarP rqvam DNAA_PSEPU : 454- 462: amals KeltnhSl--P eigdm DNAA_RHIME : 64- 72: lhsvs KsvvrlSv--P ttflk DNAA_RHIME : 455- 463: amyls KtltprSf--P eigrr DNAA_SALTY : 396- 405: adlls Krrsr-SvarP rqmam DNAA_SALTY : 414- 422: amala KeltnhSl--P eigda DNAA_SERMA : 394- 403: adlls Krrsr-SvarP rqmam DNAA_SERMA : 412- 420: amala KeltnhSl--P eigda DNAA_SPIAP : 92- 102: fienn KqivltSdkfP eqlng DNAA_SPIAP : 195- 204: ledin KfledySfa-P ggeit DNAA_SPICI : 239- 249: yiekn KqivitSdkyP ddlgg DNAA_STRCO : 447- 456: lhnan KqivlsSdr-P pkqlv DNAA_STRCO : 447- 456: lhnan Kqivl-SsdrP pkqlv DNAA_STRCO : 447- 457: lhnan KqivlsSdrpP kqlvt DNAA_THEMA : 228- 238: lhdsg KqivicSdreP qklse DNAA_WOLSP : 166- 174: amyfa KkftqkSl--P digrn DNAA_WOLSP : 167- 174: myfak Kftqk-Sl--P digrn I 9: 11.0102 30( 21) L-x(2,3)-I-x(0,2)-E Occurences: 30(21) DNAA_BACSU : 12- 16: lwnqa Laq-I--E kklsk DNAA_BACSU : 402- 407: mtdss Lpk-Ig-E efggr DNAA_BACSU : 402- 408: mtdss Lpk-IgeE fggrd DNAA_BORBU : 12- 18: iwsli Lte-IkkE lseee DNAA_BORBU : 312- 318: kpnfe LraaIv-E kkaee DNAA_BORBU : 360- 364: kayid Ldn-I--E idiei DNAA_BUCAP : 33- 39: slkak LnnnIl-E iyapn DNAA_CAUCR : 318- 324: padrn LrlgIl-E rkiqt DNAA_ECOLI : 290- 295: rfgwg LtvaI--E ppele DNAA_HAEIN : 278- 283: rfgwg LttaI--E ppdle DNAA_HAEIN : 361- 365: alqer Lvt-I--E niqkv DNAA_MICLU : 405- 412: laehv LkdlItdE tahei DNAA_MYCCA : 3- 9: mn Lnd-IlkE lklsl DNAA_MYCCA : 404- 409: ilnht Laq-Ig-E efggr DNAA_MYCCA : 404- 410: ilnht Laq-IgeE fggrd DNAA_MYCGE : 48- 54: inten Lke-IlfE efekf DNAA_MYCLE : 73- 77: nlvqp Lti-I--E gfall DNAA_MYCMY : 256- 261: ilnht Laq-Ig-E ef DNAA_MYCMY : 256- 262: ilnht Laq-IgeE f DNAA_PROMI : 289- 294: rfgwg LtvaI--E ppele DNAA_PSEPU : 255- 260: vkalq Lna-In-E fkrfy DNAA_RHIME : 494- 499: sadtk LsheI--E llkrl DNAA_RHIME : 501- 507: heiel LkrlIn-E DNAA_SALTY : 289- 294: rfgwg LtvaI--E ppele DNAA_SERMA : 287- 292: rfgwg LtvaI--E ppele DNAA_SPIAP : 9- 16: lgkth LlkaIahE igntk DNAA_SPIAP : 10- 16: gkthl Lka-IahE igntk DNAA_SPICI : 155- 160: lgkth LlhaI--E nkvne DNAA_SPICI : 156- 160: gkthl Lha-I--E nkvne DNAA_STRCO : 66- 72: vlegr Lap-IvsE tlsre DNAA_THEMA : 390- 395: ylkss Lrt-Ia-E kfnrs DNAA_THEMA : 422- 428: kgnkq LkalId-E vigei DNAA_WOLSP : 42- 48: rlgwg LvadIn-E ttfel J 10: 11.0102 44( 21) L-x(1,3)-I-x(3,4)-F Occurences: 44(21) DNAA_BACSU : 211- 218: rnvdv Ll--IddiqF lagke DNAA_BACSU : 402- 409: mtdss Lpk-Igee-F ggrdh DNAA_BORBU : 301- 310: rftrg LnvdIskpnF elraa DNAA_BUCAP : 219- 226: rsvda Ll--IddiqF fahke DNAA_BUCAP : 327- 336: elega LnrvIvnanF thrsi DNAA_BUCAP : 409- 416: ltnhs Lpe-Igda-F sgrdh DNAA_CAUCR : 248- 256: lraad Lli-IddvhF iagkq DNAA_CAUCR : 249- 256: raadl Li--IddvhF iagkq DNAA_CAUCR : 445- 452: lttrs Lpd-Igrr-F ggrdh DNAA_ECOLI : 232- 239: rsvda Ll--IddiqF fanke DNAA_ECOLI : 340- 349: elega LnrvIananF tgrai DNAA_ECOLI : 422- 429: ltnhs Lpe-Igda-F ggrdh DNAA_HAEIN : 187- 194: pnarv Ly--IhannF mqhmv DNAA_HAEIN : 410- 417: ltnrs Lpe-Igra-F drdht DNAA_MICLU : 274- 281: rnvdi Ll--IddiqF ladke DNAA_MYCCA : 210- 217: cqndv Li--IddvqF lsyke DNAA_MYCCA : 404- 411: ilnht Laq-Igee-F ggrdh DNAA_MYCGE : 48- 56: inten Lke-IlfeeF ekfhk DNAA_MYCLE : 73- 79: nlvqp Lt--Iieg-F allsv DNAA_MYCLE : 473- 480: ltdls Lpk-Igqa-F grdht DNAA_MYCMY : 62- 69: cqndv Li--IddvqF lsyke DNAA_MYCMY : 256- 263: ilnht Laq-Igee-F DNAA_PROMI : 231- 238: rsvda Ll--IddiqF fanke DNAA_PROMI : 339- 348: elega LnrvIananF tgrai DNAA_PROMI : 421- 428: ltnhs Lpe-Igda-F ggrdh DNAA_PSEPU : 271- 278: rsvda Ll--IddiqF farke DNAA_PSEPU : 379- 388: elega LkrvIahshF mgrdi DNAA_PSEPU : 461- 468: ltnhs Lpe-Igdm-F ggrdh DNAA_RHIME : 267- 275: lrnid Lli-IddmqF lqgks DNAA_RHIME : 268- 275: rnidl Li--IddmqF lqgks DNAA_SALTY : 231- 238: rsvda Ll--IddiqF fanke DNAA_SALTY : 339- 348: elega LnrvIananF tgrai DNAA_SALTY : 421- 428: ltnhs Lpe-Igda-F ggrdh DNAA_SERMA : 229- 236: rsvda Ll--IddiqF fanke DNAA_SERMA : 337- 346: elega LnrvIananF tgrai DNAA_SERMA : 419- 426: ltnhs Lpe-Igda-F ggrdh DNAA_SPIAP : 62- 69: skidv Ll--IddiqF lansg DNAA_SPICI : 301- 308: fsees Lef-Ialn-F nsdvr DNAA_SPICI : 315- 324: sdvrk LegaIkrllF lavmn DNAA_STRCO : 610- 617: ltdls Lpk-Igal-F ggrdh DNAA_THEMA : 198- 205: kkvdi Ll--IddvqF ligkt DNAA_THEMA : 390- 397: ylkss Lrt-Iaek-F nrshp DNAA_WOLSP : 42- 51: rlgwg LvadInettF elrlg DNAA_WOLSP : 173- 180: ftqks Lpd-Igrn-F ggrdh K 11: 11.0102 38( 21) L-x(2,4)-L-x(4,5)-E Occurences: 38(21) DNAA_BACSU : 257- 266: keipt Ledr-Lrsrf-E wglit DNAA_BORBU : 207- 215: elhhn Lki--Lyvta-E nflne DNAA_BUCAP : 5- 16: mslc LwkqcLdrlqsE lpste DNAA_BUCAP : 29- 39: mwirs Lkak-LnnnilE iyapn DNAA_CAUCR : 267- 277: stqee Lfht-LtalvgE ggrvv DNAA_CAUCR : 303- 312: hlrsh Lsag-Lvcgl-E padrn DNAA_CAUCR : 363- 372: elega Lnt--LsaragE glsrm DNAA_ECOLI : 5- 16: msls LwqqcLarlqdE lpate DNAA_ECOLI : 363- 371: fvrea Lrd--Llalq-E klvti DNAA_HAEIN : 119- 130: kfesh LntkhLfdnfvE gksnq DNAA_MICLU : 67- 77: qvada Ltda-LtqefrE eilla DNAA_MYCCA : 400- 409: ltkei Lnht-Laqig-E efggr DNAA_MYCCA : 400- 410: ltkei Lnht-LaqigeE fggrd DNAA_MYCGE : 48- 57: inten Lkei-Lfeef-E kfhkk DNAA_MYCLE : 328- 337: kqlat Ledr-Lrtrf-E wglit DNAA_MYCMY : 252- 261: ltkei Lnht-Laqig-E ef DNAA_MYCMY : 252- 262: ltkei Lnht-LaqigeE f DNAA_PROMI : 5- 16: msls LwqhcLarlqdE lpate DNAA_PROMI : 362- 370: fvrea Lrd--Llalq-E klvti DNAA_PSEPU : 56- 65: vneky Lgrl-Lellg-E ngsgi DNAA_PSEPU : 56- 65: vneky Lgr--LlellgE ngsgi DNAA_RHIME : 338- 346: dyemr Lem--Lkrrl-E aarqd DNAA_RHIME : 401- 410: ervde Llgh-Lvnag-E prrvr DNAA_RHIME : 402- 410: rvdel Lgh--Lvnag-E prrvr DNAA_SALTY : 5- 16: msls LwqqcLarlqdE lpate DNAA_SALTY : 362- 370: fvrea Lrd--Llalq-E klvti DNAA_SERMA : 5- 16: msls LwqqcLarlqdE lpate DNAA_SERMA : 360- 368: fvrea Lrd--Llalq-E klvti DNAA_SPIAP : 247- 258: hvamf LtgeiLkknysE igvaf DNAA_SPICI : 150- 160: ygdsg LgkthLlhai-E nkvne DNAA_SPICI : 267- 277: rfsyg Lsig-LdspdfE talki DNAA_STRCO : 62- 72: fakgv Legr-LapivsE tlsre DNAA_STRCO : 463- 472: kqlvt Ledr-Lrnrf-E wglit DNAA_STRCO : 548- 556: lteiv Lkd--Lipgg-E dsape DNAA_THEMA : 172- 181: tsekf Lnd--LvdsmkE gklne DNAA_THEMA : 256- 265: rfqmg Lvak-Leppd-E etrks DNAA_THEMA : 256- 266: rfqmg Lvak-LeppdeE trksi DNAA_THEMA : 283- 293: iehge LpeevLnfva-E nvddn DNAA_THEMA : 386- 395: vakny Lkss-Lrtia-E kfnrs DNAA_WOLSP : 38- 48: riksr Lgwg-LvadinE ttfel DNAA_WOLSP : 53- 63: ettfe LrlgiLqakv-E qmnmy DNAA_WOLSP : 55- 63: tfelr Lgi--Lqakv-E qmnmy L 12: 11.0102 61( 21) E-x(0,1)-L-x(3,5)-L Occurences: 61(21) DNAA_BACSU : 68- 74: adtiy E-Ltgee-L sikfv DNAA_BACSU : 314- 319: dsnir E-Lega--L irvva DNAA_BORBU : 201- 207: ignkt EeLhhn--L kilyv DNAA_BORBU : 202- 207: gnkte E-Lhhn--L kilyv DNAA_BUCAP : 322- 327: rsnvr E-Lega--L nrviv DNAA_BUCAP : 348- 354: vefvr EaLrdi--L alqek DNAA_BUCAP : 348- 356: vefvr EaLrdilaL qeklv DNAA_BUCAP : 403- 409: mamak E-Ltnhs-L peigd DNAA_CAUCR : 241- 248: taafk EeLraad-L liidd DNAA_CAUCR : 241- 249: taafk EeLraadlL iiddv DNAA_CAUCR : 242- 248: aafke E-Lraad-L liidd DNAA_CAUCR : 242- 249: aafke E-LraadlL iiddv DNAA_CAUCR : 265- 271: kqstq EeLfht--L talvg DNAA_CAUCR : 266- 271: qstqe E-Lfht--L talvg DNAA_CAUCR : 358- 363: tdsvr E-Lega--L ntlsa DNAA_CAUCR : 372- 379: sarag EgLsrmt-L devqa DNAA_CAUCR : 482- 488: lshdl EtLtrk--L rg DNAA_ECOLI : 32- 38: rplqa E-Lsdnt-L alyap DNAA_ECOLI : 335- 340: rsnvr E-Lega--L nrvia DNAA_ECOLI : 361- 367: idfvr EaLrdl--L alqek DNAA_ECOLI : 361- 369: idfvr EaLrdllaL qeklv DNAA_ECOLI : 416- 422: malak E-Ltnhs-L peigd DNAA_HAEIN : 73- 78: laqnp E-Lris--L kegvk DNAA_HAEIN : 323- 328: rtnvr E-Lega--L nrvka DNAA_HAEIN : 404- 410: malak E-Ltnrs-L peigr DNAA_MICLU : 377- 382: stnir E-Lega--L irvta DNAA_MICLU : 399- 405: qtvdi E-Laehv-L kdlit DNAA_MICLU : 459- 465: myllr E-Ltems-L pkigq DNAA_MYCCA : 9- 14: ndilk E-Lkls--L iankn DNAA_MYCCA : 398- 404: myltk EiLnht--L aqige DNAA_MYCGE : 46- 52: nlint EnLkei--L feefe DNAA_MYCLE : 385- 390: ernir E-Lega--L irvta DNAA_MYCLE : 467- 473: mylcr E-Ltdls-L pkigq DNAA_MYCMY : 250- 256: mfltk EiLnht--L aqige DNAA_PROMI : 32- 38: rplqa E-Lsdnt-L alyap DNAA_PROMI : 334- 339: rsnvr E-Lega--L nrvia DNAA_PROMI : 360- 366: idfvr EaLrdl--L alqek DNAA_PROMI : 360- 368: idfvr EaLrdllaL qeklv DNAA_PROMI : 415- 421: malak E-Ltnhs-L peigd DNAA_PSEPU : 11- 17: wqqcv ElLrde--L paqqf DNAA_PSEPU : 11- 17: wqqcv E-Llrde-L paqqf DNAA_PSEPU : 315- 321: ypkei EgLeer--L ksrfg DNAA_PSEPU : 374- 379: rsnvr E-Lega--L krvia DNAA_PSEPU : 396- 402: rditi E-Lires-L kdlla DNAA_PSEPU : 400- 406: ielir EsLkdl--L alqdk DNAA_PSEPU : 400- 408: ielir EsLkdllaL qdklv DNAA_PSEPU : 455- 461: malsk E-Ltnhs-L peigd DNAA_RHIME : 98- 105: qqeds EiLkvei-L vrtat DNAA_RHIME : 260- 267: alslk EsLrnid-L liidd DNAA_RHIME : 260- 268: alslk EsLrnidlL iiddm DNAA_RHIME : 339- 345: yemrl EmLkrr--L eaarq DNAA_RHIME : 400- 405: iervd E-Llgh--L vnage DNAA_RHIME : 499- 504: lshei E-Llkr--L ine DNAA_SALTY : 32- 38: rplqa E-Lsdnt-L alyap DNAA_SALTY : 334- 339: rsnvr E-Lega--L nrvia DNAA_SALTY : 360- 366: idfvr EaLrdl--L alqek DNAA_SALTY : 360- 368: idfvr EaLrdllaL qeklv DNAA_SALTY : 415- 421: malak E-Ltnhs-L peigd DNAA_SERMA : 32- 38: rplqa E-Lsdnt-L alyap DNAA_SERMA : 332- 337: rsnvr E-Lega--L nrvia DNAA_SERMA : 358- 364: ixfvr EaLrdl--L alqek DNAA_SERMA : 358- 366: ixfvr EaLrdllaL qeklv DNAA_SERMA : 413- 419: malak E-Ltnhs-L peigd DNAA_SPIAP : 54- 62: iestk EkLskidvL liddi DNAA_SPICI : 299- 306: glfse EsLefia-L nfnsd DNAA_STRCO : 520- 525: srnir E-Lega--L irvta DNAA_STRCO : 604- 610: mylcr E-Ltdls-L pkiga DNAA_THEMA : 282- 288: eiehg E-Lpeev-L nfvae DNAA_WOLSP : 52- 58: nettf E-Lrlgi-L qakve DNAA_WOLSP : 87- 92: ksnir E-Lega--L nkvth DNAA_WOLSP : 112- 118: vesas EtLidl--L rsnhr M 13: 11.0102 42( 21) I-x(0,2)-E-x(3,4)-E Occurences: 42(21) DNAA_BACSU : 66- 72: liadt Iy-Eltg-E elsik DNAA_BACSU : 66- 73: liadt Iy-EltgeE lsikf DNAA_BORBU : 11- 18: niwsl IltEikk-E lseee DNAA_BORBU : 15- 22: lilte IkkElse-E efyvw DNAA_BORBU : 15- 23: lilte IkkElseeE fyvwf DNAA_BORBU : 316- 322: elraa Iv-Ekka-E edgin DNAA_BORBU : 316- 323: elraa Iv-EkkaeE dginv DNAA_BORBU : 363- 368: idldn I--Eidi-E iveki DNAA_BORBU : 369- 376: eidie Iv-EkiikE iiiye DNAA_BORBU : 373- 381: eivek IikEiiiyE kettn DNAA_BORBU : 374- 381: iveki Ik-EiiiyE kettn DNAA_BUCAP : 341- 348: fthrs ItvEfvr-E alrdi DNAA_BUCAP : 431- 437: hacrk I--EqlrkE nhdik DNAA_CAUCR : 467- 473: havrr I--EalraE dsals DNAA_ECOLI : 294- 300: gltva I--EppelE trvai DNAA_ECOLI : 444- 449: hacrk I--Eqlr-E eshdi DNAA_ECOLI : 444- 450: hacrk I--EqlreE shdik DNAA_HAEIN : 263- 268: rypke I--Ekie-E rlksr DNAA_HAEIN : 282- 288: gltta I--EppdlE trvai DNAA_MICLU : 409- 416: vlkdl ItdEtah-E itpel DNAA_MICLU : 487- 493: hadrk Ir-Elma-E rrtiy DNAA_MYCCA : 197- 203: kthke I--EqfknE vcqnd DNAA_MYCCA : 293- 300: iknqn IktEvtn-E ainfi DNAA_MYCCA : 361- 367: lnvkk Ik-Evvs-E kygis DNAA_MYCCA : 420- 427: dhttv InaErki-E mmlkk DNAA_MYCGE : 43- 50: skqnl IntEnlk-E ilfee DNAA_MYCLE : 379- 385: liass I--ErnirE legal DNAA_MYCMY : 49- 55: kthke I--EqfknE vcqnd DNAA_MYCMY : 145- 152: iknqn IksEvts-E ainfi DNAA_MYCMY : 213- 219: lnvkk Ik-Evvs-E kygis DNAA_PROMI : 293- 299: gltva I--EppelE trvai DNAA_PROMI : 443- 448: hacrk I--Eqlr-E eshdi DNAA_PROMI : 443- 449: hacrk I--EqlreE shdik DNAA_PSEPU : 314- 319: rypke I--Egle-E rlksr DNAA_PSEPU : 393- 400: fmgrd ItiElir-E slkdl DNAA_PSEPU : 395- 400: grdit I--Elir-E slkdl DNAA_RHIME : 327- 335: qggva IemEgpdyE mrlem DNAA_RHIME : 395- 400: epqls I--Ervd-E llghl DNAA_SALTY : 293- 299: gltva I--EppelE trvai DNAA_SALTY : 443- 448: hacrk I--Eqlr-E eshdi DNAA_SALTY : 443- 449: hacrk I--EqlreE shdik DNAA_SERMA : 291- 297: gltva I--EppelE trvai DNAA_SERMA : 441- 446: hacrk I--Eqlr-E eshdi DNAA_SERMA : 441- 447: hacrk I--EqlreE shdik DNAA_SPIAP : 49- 54: dgfke I--Estk-E klski DNAA_SPICI : 159- 165: hllha I--EnkvnE iyktn DNAA_STRCO : 69- 77: grlap IvsEtlsrE cgrpi DNAA_THEMA : 426- 432: qlkal Id-Evig-E isrra DNAA_WOLSP : 46- 52: glvad In-Ettf-E lrlgi N 14: 11.0102 43( 21) L-x(0,2)-L-x(1,2)-A Occurences: 43(21) DNAA_BACSU : 59- 63: lesry Lh-Li-A dtiye DNAA_BORBU : 333- 337: vpkni Ln-Lv-A qkvtt DNAA_BUCAP : 168- 171: lgkth L--Lh-A igngi DNAA_CAUCR : 198- 201: fgkth L--Ln-A lawea DNAA_CAUCR : 363- 368: elega LntLs-A rageg DNAA_ECOLI : 38- 42: lsdnt La-Ly-A pnrfv DNAA_ECOLI : 181- 184: lgkth L--Lh-A vgngi DNAA_ECOLI : 363- 368: fvrea LrdLl-A lqekl DNAA_HAEIN : 27- 32: dlstw LrpLq-A dvvad DNAA_HAEIN : 169- 172: lgkth L--Lh-A igngi DNAA_HAEIN : 294- 298: trvai L--LkkA eehnm DNAA_MICLU : 45- 48: lignt L--Ll-A vpnet DNAA_MICLU : 223- 226: lgkth L--Lh-A ighya DNAA_MICLU : 421- 425: eitpe Li-Lh-A tgeyf DNAA_MYCCA : 12- 16: lkelk Ls-Li-A nknid DNAA_MYCCA : 157- 160: mgkth L--Lk-A aknyi DNAA_MYCCA : 157- 161: mgkth L--LkaA knyie DNAA_MYCGE : 31- 35: giatk L--LffA ktskq DNAA_MYCLE : 231- 234: lgkth L--Lh-A agnya DNAA_MYCLE : 231- 235: lgkth L--LhaA gnyaq DNAA_MYCLE : 372- 376: vpgdv Le-Li-A ssier DNAA_MYCLE : 413- 418: laeiv LrdLi-A dastm DNAA_MYCMY : 9- 12: mgkth L--Lk-A aknyi DNAA_MYCMY : 9- 13: mgkth L--LkaA knyie DNAA_PROMI : 38- 42: lsdnt La-Ly-A pnrfv DNAA_PROMI : 180- 183: lgkth L--Lh-A vgnsi DNAA_PROMI : 362- 367: fvrea LrdLl-A lqekl DNAA_PSEPU : 253- 257: dmvka Lq-Ln-A inefk DNAA_PSEPU : 402- 407: lires LkdLl-A lqdkl DNAA_RHIME : 217- 220: lgkth L--Lq-A ialaa DNAA_RHIME : 223- 229: lqaia LaaLqsA raprv DNAA_RHIME : 292- 296: hllnm L--LdsA kqvvv DNAA_RHIME : 402- 408: rvdel LghLvnA geprr DNAA_SALTY : 38- 42: lsdnt La-Ly-A pnrfv DNAA_SALTY : 180- 183: lgkth L--Lh-A vgngi DNAA_SALTY : 362- 367: fvrea LrdLl-A lqekl DNAA_SERMA : 38- 42: lsdnt La-Ly-A pnrfv DNAA_SERMA : 178- 181: lgkth L--Lh-A vgngi DNAA_SERMA : 360- 365: fvrea LrdLl-A lqekl DNAA_SPIAP : 9- 12: lgkth L--Lk-A iahei DNAA_SPICI : 155- 158: lgkth L--Lh-A ienkv DNAA_SPICI : 322- 326: gaikr L--LflA vmnkk DNAA_STRCO : 42- 46: rrcqp La-Lv-A dtall DNAA_STRCO : 366- 369: lgkth L--Lh-A ighya DNAA_THEMA : 299- 305: nvddn LrrLrgA iikll DNAA_WOLSP : 55- 60: tfelr LgiLq-A kveqm O 15: 11.0102 43( 21) K-x(0,2)-L-x(2,3)-A Occurences: 43(21) DNAA_BACSU : 157- 163: gvglg KthLmh-A ighyv DNAA_BORBU : 159- 164: igpnn K--LaynA slsis DNAA_BORBU : 208- 214: lhhnl Ki-LyvtA enfln DNAA_BORBU : 330- 337: ginvp KniLnlvA qkvtt DNAA_BUCAP : 165- 171: gtglg KthLlh-A igngi DNAA_BUCAP : 199- 205: vqdmv Ka-LqnnA iekfk DNAA_BUCAP : 359- 364: lalqe K--LvtiA niqkt DNAA_CAUCR : 35- 41: vcval KreLgd-A afgsw DNAA_CAUCR : 35- 42: vcval KreLgdaA fgswi DNAA_CAUCR : 98- 105: rridl KsrLefeA aagay DNAA_CAUCR : 195- 201: pygfg KthLln-A lawea DNAA_CAUCR : 240- 246: qtaaf KeeLra-A dllii DNAA_ECOLI : 178- 184: gtglg KthLlh-A vgngi DNAA_ECOLI : 212- 218: vqdmv Ka-LqnnA ieefk DNAA_HAEIN : 143- 147: ravgq K--Laq-A pgeps DNAA_HAEIN : 166- 172: gtglg KthLlh-A igngi DNAA_MICLU : 220- 226: esglg KthLlh-A ighya DNAA_MYCCA : 11- 16: ilkel K--LsliA nknid DNAA_MYCCA : 154- 160: esgmg KthLlk-A aknyi DNAA_MYCCA : 154- 161: esgmg KthLlkaA knyie DNAA_MYCGE : 30- 35: ngiat Kl-Lff-A ktskq DNAA_MYCGE : 30- 35: ngiat K--LlffA ktskq DNAA_MYCLE : 228- 234: esglg KthLlh-A agnya DNAA_MYCLE : 228- 235: esglg KthLlhaA gnyaq DNAA_MYCLE : 493- 499: myaqr Ki-LsemA errev DNAA_MYCMY : 6- 12: esgmg KthLlk-A aknyi DNAA_MYCMY : 6- 13: esgmg KthLlkaA knyie DNAA_PROMI : 177- 183: gtglg KthLlh-A vgnsi DNAA_PROMI : 211- 217: vqdmv Ka-LqnnA iedfk DNAA_PSEPU : 217- 223: gvglg KthLmh-A vgnhl DNAA_PSEPU : 251- 257: vadmv Ka-LqlnA inefk DNAA_PSEPU : 353- 360: kadqa KveLphdA affia DNAA_RHIME : 214- 220: svglg KthLlq-A ialaa DNAA_RHIME : 342- 348: rleml KrrLea-A rqdda DNAA_SALTY : 177- 183: gtglg KthLlh-A vgngi DNAA_SALTY : 211- 217: vqdmv Ka-LqnnA ieefk DNAA_SERMA : 175- 181: gtglg KthLlh-A vgngi DNAA_SERMA : 209- 215: vqdmv Ka-LqnnA ieefk DNAA_SPIAP : 6- 12: dsglg KthLlk-A iahei DNAA_SPICI : 152- 158: dsglg KthLlh-A ienkv DNAA_SPICI : 314- 318: nsdvr K--Leg-A ikrll DNAA_SPICI : 320- 326: legai KrlLfl-A vmnkk DNAA_SPICI : 320- 326: legai Kr-LlflA vmnkk DNAA_SPICI : 437- 442: tnkef Kh-Lvn-A irrki DNAA_STRCO : 363- 369: esglg KthLlh-A ighya DNAA_THEMA : 61- 68: lskav KvvLgndA tfeit DNAA_THEMA : 387- 394: aknyl KssLrtiA ekfnr DNAA_WOLSP : 14- 20: lidqn Kq-LvisA drsps DNAA_WOLSP : 71- 78: nmyvp KdvLeflA rniks P 16: 11.0102 39( 21) L-x(2,3)-I-x(2,4)-K Occurences: 39(21) DNAA_BACSU : 12- 18: lwnqa Laq-Iek--K lskps DNAA_BACSU : 278- 287: itppd LetrIailrK kakae DNAA_BACSU : 342- 350: laaea LkdiIpss-K pkvit DNAA_BACSU : 342- 350: laaea Lkd-IipssK pkvit DNAA_BORBU : 34- 42: enlcf Les-IgdniK istpn DNAA_BORBU : 192- 199: lgkth LlqsIgn--K teelh DNAA_BORBU : 193- 199: gkthl Lqs-Ign--K teelh DNAA_BORBU : 244- 253: yldml LiddIhdlqK kegiq DNAA_BORBU : 312- 319: kpnfe LraaIve--K kaeed DNAA_BORBU : 312- 320: kpnfe LraaIvek-K aeedg DNAA_BUCAP : 360- 368: alqek Lvt-IaniqK tvaey DNAA_CAUCR : 318- 326: padrn LrlgIler-K iqtlg DNAA_ECOLI : 373- 381: alqek Lvt-IdniqK tvaey DNAA_HAEIN : 361- 369: alqer Lvt-IeniqK vvaey DNAA_MICLU : 341- 350: iqppd LetrIailrK kaeae DNAA_MICLU : 504- 511: nqvte LtneIkr--K qrga DNAA_MYCCA : 3- 11: mn Lnd-IlkelK lslia DNAA_MYCCA : 12- 18: lkelk Lsl-Ian--K nides DNAA_MYCCA : 344- 352: eiisd LfrdIpts-K lgiln DNAA_MYCCA : 443- 450: ktvdi LknkIlt--K DNAA_MYCGE : 24- 30: ndvra Lng-Iat--K llffa DNAA_MYCLE : 349- 358: vqppe LetrIailrK kaqme DNAA_MYCLE : 511- 520: dhvke LttrIrqrsK r DNAA_MYCMY : 196- 204: eiisd LfrdIpts-K lgiln DNAA_PROMI : 372- 380: alqek Lvt-IdniqK tvaey DNAA_PSEPU : 255- 262: vkalq Lna-Inef-K rfyrs DNAA_RHIME : 494- 502: sadtk LsheIell-K rline DNAA_SALTY : 372- 380: alqek Lvt-IdniqK tvaey DNAA_SERMA : 370- 378: alqek Lvt-IdniqK tvaey DNAA_SPIAP : 247- 254: hvamf LtgeIlk--K nysei DNAA_SPICI : 59- 68: vfeag LnekIknilK kltgi DNAA_SPICI : 155- 162: lgkth LlhaIen--K vneiy DNAA_SPICI : 156- 162: gkthl Lha-Ien--K vneiy DNAA_SPICI : 210- 219: iydcl LiddIqllaK rnktn DNAA_SPICI : 439- 446: kefkh LvnaIrr--K iegr DNAA_STRCO : 484- 493: vqppe LetrIailrK kavqe DNAA_STRCO : 543- 549: pvdlg Lte-Ivl--K dlipg DNAA_THEMA : 322- 330: gkevd LkeaIlll-K dfikp DNAA_THEMA : 347- 353: dpide Lie-Iva--K vtgvp DNAA_THEMA : 390- 396: ylkss Lrt-Iae--K fnrsh DNAA_WOLSP : 53- 61: ettfe LrlgIlqa-K veqmn Q 17: 11.0102 28( 21) V-x(1,3)-A-x(3,4)-I Occurences: 28(21) DNAA_BACSU : 322- 329: galir Vv--AysslI nkdin DNAA_BACSU : 417- 424: rdhtt Vih-Ahek-I sklla DNAA_BORBU : 317- 326: lraai VekkAeedgI nvpkn DNAA_BUCAP : 346- 353: itvef Vre-Alrd-I lalqe DNAA_BUCAP : 424- 431: rdhtt Vlh-Acrk-I eqlrk DNAA_CAUCR : 118- 125: atpka Va--AepieI vlpvs DNAA_CAUCR : 460- 467: rdhtt Vlh-Avrr-I ealra DNAA_ECOLI : 437- 444: rdhtt Vlh-Acrk-I eqlre DNAA_HAEIN : 34- 40: plqad Vv--Adnh-I vlyas DNAA_HAEIN : 370- 377: eniqk Vv--AeyyrI kvsdl DNAA_MICLU : 480- 487: rdhtt Vih-Adrk-I relma DNAA_MYCCA : 297- 305: nikte VtneAinf-I snyys DNAA_MYCCA : 419- 426: rdhtt Vin-Aerk-I emmlk DNAA_MYCGE : 21- 27: isgnd Vr--Alng-I atkll DNAA_MYCLE : 3- 11: mf Vph-AkkpeI yenqr DNAA_MYCLE : 487- 494: rdhtt Vmy-Aqrk-I lsema DNAA_MYCMY : 149- 157: nikse VtseAinf-I snyys DNAA_PROMI : 436- 443: rdhtt Vlh-Acrk-I eqlre DNAA_PSEPU : 476- 483: rdhtt Vlh-Acrk-I nelke DNAA_RHIME : 183- 191: gssnr ValaAart-I aeaga DNAA_RHIME : 183- 191: gssnr Val-AaartI aeaga DNAA_RHIME : 477- 484: rdhtt Vlh-Avrk-I eelis DNAA_SALTY : 436- 443: rdhtt Vlh-Acrk-I eqlre DNAA_SERMA : 434- 441: rdhtt Vlh-Acrk-I eqlre DNAA_SPIAP : 216- 223: qkikn Vv--AqnygI svksi DNAA_SPICI : 440- 447: efkhl Vn--AirrkI egr DNAA_STRCO : 625- 632: rdhtt Vmh-Adrk-I rnlma DNAA_THEMA : 338- 344: ikpnr Vk--Amdp-I delie DNAA_WOLSP : 107- 115: grsmt Ves-AsetlI dllrs R 18: 10.5102 28( 21) L-x(2,4)-K-x(1,3)-Q Occurences: 28(21) DNAA_BACSU : 219- 224: ddiqf Lag--Ke--Q tqeef DNAA_BACSU : 219- 226: ddiqf Lag--KeqtQ eeffh DNAA_BORBU : 48- 53: istpn Lfh--Kn--Q iekrf DNAA_BORBU : 251- 258: ddihd Lqk--KegiQ eelfh DNAA_BUCAP : 56- 64: vkdky LihfkKil-Q dfcgs DNAA_BUCAP : 56- 64: vkdky Lihf-KkilQ dfcgs DNAA_BUCAP : 425- 433: dhttv LhacrKie-Q lrken DNAA_CAUCR : 323- 328: lrlgi Ler--Ki--Q tlgaa DNAA_ECOLI : 438- 446: dhttv LhacrKie-Q lrees DNAA_HAEIN : 328- 335: elega Lnrv-Kam-Q dfkgg DNAA_MICLU : 504- 512: nqvte LtneiKrk-Q rga DNAA_MYCCA : 190- 199: kavdi LqkthKeieQ fknev DNAA_MYCGE : 31- 40: giatk LlffaKtskQ nlint DNAA_MYCGE : 32- 40: iatkl Lffa-KtskQ nlint DNAA_MYCGE : 103- 111: dvcny Llrq-KynmQ fqqig DNAA_MYCGE : 104- 111: vcnyl Lrq--KynmQ fqqig DNAA_MYCLE : 356- 361: triai Lrk--Ka--Q merla DNAA_MYCLE : 471- 478: reltd Lslp-Kig-Q afgrd DNAA_MYCMY : 42- 51: kavdi LqkthKeieQ fknev DNAA_PROMI : 437- 445: dhttv LhacrKie-Q lrees DNAA_PSEPU : 345- 351: trvai Lmk--Kad-Q akvel DNAA_RHIME : 276- 282: ddmqf Lqg--Ksi-Q hefch DNAA_SALTY : 437- 445: dhttv LhacrKie-Q lrees DNAA_SERMA : 435- 443: dhttv LhacrKie-Q lrees DNAA_SPIAP : 96- 104: nkqiv Ltsd-KfpeQ lngfd DNAA_SPICI : 283- 290: talki LeqklKh--Q nnlgl DNAA_SPICI : 283- 290: talki Leq--KlkhQ nnlgl DNAA_STRCO : 425- 432: ddiqf Lad--KestQ eeffh DNAA_STRCO : 491- 497: triai Lrk--Kav-Q eqlna DNAA_THEMA : 206- 213: ddvqf Lig--KtgvQ telfh DNAA_WOLSP : 58- 64: lrlgi Lqa--Kve-Q mnmyv S 19: 10.5102 41( 21) N-x(1,3)-L-x(3,5)-K Occurences: 41(21) DNAA_BACSU : 9- 17: ildlw Nqa-Laqie-K klskp DNAA_BACSU : 9- 18: ildlw Nqa-LaqiekK lskps DNAA_BACSU : 234- 241: ffhtf Nt--Lhees-K qivis DNAA_BACSU : 334- 343: inkdi Nad-LaaealK diips DNAA_BACSU : 368- 375: vgqqf Nik-Ledf--K akkrt DNAA_BACSU : 368- 377: vgqqf Nik-LedfkaK krtks DNAA_BORBU : 6- 16: meksk NiwsLilteiK kelse DNAA_BORBU : 94- 103: kqetk Npa-LnetfsK fdklk DNAA_BORBU : 163- 170: nklay Nas-Lsis--K npgkk DNAA_BORBU : 266- 273: lfhtf Na--Lyedn-K qlvft DNAA_BORBU : 331- 339: invpk NilnLvaq--K vttnv DNAA_BORBU : 331- 339: invpk Ni--LnlvaqK vttnv DNAA_BORBU : 343- 353: qkvtt NvrdLeaavtK lkayi DNAA_BUCAP : 44- 52: eiyap NqfiLdwv--K dkyli DNAA_BUCAP : 44- 54: eiyap NqfiLdwvkdK ylihf DNAA_CAUCR : 317- 326: epadr Nlr-LgilerK iqtlg DNAA_ECOLI : 44- 54: alyap NrfvLdwvrdK ylnni DNAA_HAEIN : 71- 79: qtlaq Npe-Lrisl-K egvkp DNAA_MICLU : 297- 304: ffhtf Nt--Lynnn-K qvvit DNAA_MICLU : 431- 440: tgeyf Nlt-LeeltsK srtrt DNAA_MYCCA : 4- 11: mnl Ndi-Lkel--K lslia DNAA_MYCCA : 238- 248: nnfie NdkqLffssdK spell DNAA_MYCCA : 265- 274: litrf Nmg-LsiaiqK ldnkt DNAA_MYCGE : 101- 107: vrdvc Ny--Llrq--K ynmqf DNAA_MYCLE : 262- 269: tndfi Ns--Lrddr-K vafkr DNAA_MYCLE : 305- 312: ffhtf Nt--Lhnan-K qivis DNAA_MYCMY : 90- 100: nnfie NdkqLffssdK spell DNAA_MYCMY : 117- 126: litrf Nmg-LsiaiqK ldnkt DNAA_PROMI : 44- 54: alyap NrfvLdwvreK yinni DNAA_PSEPU : 44- 54: rvyap NrfvLdwvneK ylgrl DNAA_PSEPU : 371- 380: qrirs NvreLegal-K rviah DNAA_RHIME : 290- 297: fchll Nml-Ldsa--K qvvva DNAA_RHIME : 290- 297: fchll Nm--Lldsa-K qvvva DNAA_SALTY : 44- 54: alyap NrfvLdwvrdK ylnni DNAA_SERMA : 44- 54: alyap NrfvLdwvrdK ylnni DNAA_SPIAP : 144- 152: kakiv Nln-Lsees-K kyias DNAA_SPIAP : 144- 153: kakiv Nln-LseeskK yiasf DNAA_SPICI : 2- 11: m NtkeLwiev-K eilsr DNAA_SPICI : 40- 47: ytvsd Nnc-Litt--K seiai DNAA_SPICI : 41- 47: tvsdn Nc--Litt--K seiai DNAA_SPICI : 347- 355: ekafk Nap-Lqnne-K itpkk DNAA_STRCO : 440- 447: ffhtf Nt--Lhnan-K qivls DNAA_THEMA : 173- 180: sekfl Nd--Lvdsm-K egkln DNAA_THEMA : 221- 228: lfhtf Ne--Lhdsg-K qivic DNAA_THEMA : 298- 308: envdd NlrrLrgaiiK llvyk DNAA_WOLSP : 7- 14: ffktf Na--Lidqn-K qlvis DNAA_WOLSP : 84- 94: rniks NireLegalnK vthts T 20: 10.5102 52( 21) E-x(2,4)-K-x(2,4)-L Occurences: 52(21) DNAA_BACSU : 138- 147: slava Eapa-KaynpL fiygg DNAA_BORBU : 2- 10: m Eks--KniwsL iltei DNAA_BORBU : 99- 107: npaln Etfs-Kfdk-L kektt DNAA_BORBU : 134- 143: kkeee EptnfKnpf-L kkryt DNAA_BORBU : 395- 401: nkini Eni--Kki--L lrelk DNAA_BORBU : 395- 402: nkini Enik-Kil--L relki DNAA_BORBU : 395- 402: nkini Eni--Kkil-L relki DNAA_BUCAP : 84- 92: yqtsk EkkfkKni--L qkiqn DNAA_BUCAP : 84- 92: yqtsk Ekkf-Kkni-L qkiqn DNAA_BUCAP : 372- 381: qktva EyykiKvad-L lsrrr DNAA_BUCAP : 372- 382: qktva EyykiKvadlL srrrs DNAA_CAUCR : 408- 417: qkata EhygmKqad-L lserr DNAA_CAUCR : 408- 418: qkata EhygmKqadlL serrn DNAA_ECOLI : 385- 394: qktva EyykiKvad-L lskrr DNAA_ECOLI : 385- 395: qktva EyykiKvadlL skrrs DNAA_HAEIN : 262- 270: drypk Eie--KieerL ksrfg DNAA_HAEIN : 373- 382: qkvva EyyriKvsd-L ksksr DNAA_MICLU : 201- 210: anava Eapa-KaynpL fiyge DNAA_MICLU : 215- 223: lfiyg EsglgKth--L lhaig DNAA_MICLU : 215- 224: lfiyg EsglgKthl-L haigh DNAA_MICLU : 462- 472: lrelt EmslpKigqvL ggrdh DNAA_MYCCA : 63- 70: frpti Enei-Kki--L kqpvn DNAA_MYCCA : 149- 157: lfiyg EsgmgKth--L lkaak DNAA_MYCCA : 149- 158: lfiyg EsgmgKthl-L kaakn DNAA_MYCCA : 181- 190: ymsgd Efar-KavdiL qkthk DNAA_MYCCA : 427- 436: aerki EmmlkKdkq-L kktvd DNAA_MYCCA : 427- 436: aerki Emml-KkdkqL kktvd DNAA_MYCGE : 46- 52: nlint Enl--Kei--L feefe DNAA_MYCGE : 87- 93: dsvls Enr--Kae--L vrvrd DNAA_MYCLE : 223- 231: lfiwg EsglgKth--L lhaag DNAA_MYCLE : 223- 232: lfiwg EsglgKthl-L haagn DNAA_MYCMY : 1- 9: EsgmgKth--L lkaak DNAA_MYCMY : 1- 10: EsgmgKthl-L kaakn DNAA_MYCMY : 33- 42: ymsgd Efar-KavdiL qkthk DNAA_PROMI : 384- 393: qktva EyykiKvad-L lskrr DNAA_PROMI : 384- 394: qktva EyykiKvadlL skrrs DNAA_PSEPU : 162- 171: rtvqv Egal-KhtsyL nrtft DNAA_PSEPU : 400- 406: ielir Esl--Kdl--L alqdk DNAA_PSEPU : 400- 408: ielir Esl--KdllaL qdklv DNAA_PSEPU : 424- 433: qrtva EyykiKisd-L lskrr DNAA_PSEPU : 424- 434: qrtva EyykiKisdlL skrrs DNAA_PSEPU : 495- 501: dadir Edy--Knl--L rtltt DNAA_RHIME : 98- 105: qqeds Eil--Kvei-L vrtat DNAA_RHIME : 339- 345: yemrl Eml--Krr--L eaarq DNAA_SALTY : 384- 393: qktva EyykiKiad-L lskrr DNAA_SALTY : 384- 394: qktva EyykiKiadlL skrrs DNAA_SERMA : 382- 391: qktva EyykiKvad-L lskrr DNAA_SERMA : 382- 392: qktva EyykiKvadlL skrrs DNAA_SPIAP : 16- 24: kaiah EigntKnk--L vvkyy DNAA_SPIAP : 48- 56: qdgfk EiestKek--L skidv DNAA_SPIAP : 50- 56: gfkei Est--Kek--L skidv DNAA_SPIAP : 54- 62: iestk Ekls-Kidv-L liddi DNAA_SPIAP : 54- 63: iestk Ekls-KidvlL iddiq DNAA_SPIAP : 89- 96: fnffi Enn--Kqiv-L tsdkf DNAA_SPICI : 61- 67: eagln Eki--Kni--L kkltg DNAA_SPICI : 284- 293: alkil Eqkl-KhqnnL glfse DNAA_SPICI : 316- 323: dvrkl Egai-Krl--L flavm DNAA_SPICI : 316- 325: dvrkl Egai-KrllfL avmnk DNAA_SPICI : 342- 350: tladv Ekaf-Knap-L qnnek DNAA_STRCO : 56- 62: lavpn Efa--Kgv--L egrla DNAA_STRCO : 344- 353: avava Eapa-KaynpL fiyge DNAA_STRCO : 358- 366: lfiyg EsglgKth--L lhaig DNAA_STRCO : 358- 367: lfiyg EsglgKthl-L haigh DNAA_THEMA : 46- 56: nlfik EwlekKyysvL skavk DNAA_THEMA : 85- 94: hssys EplvkKrav-L ltpln DNAA_THEMA : 85- 94: hssys Eplv-KkravL ltpln DNAA_THEMA : 85- 95: hssys EplvkKravlL tplnp DNAA_THEMA : 189- 198: lnefr EkyrkKvdi-L liddv DNAA_THEMA : 189- 198: lnefr Ekyr-KkvdiL liddv DNAA_THEMA : 189- 199: lnefr EkyrkKvdilL iddvq DNAA_THEMA : 314- 322: llvyk Ettg-Kevd-L keail DNAA_THEMA : 319- 327: ettgk Evdl-Keai-L llkdf DNAA_THEMA : 319- 328: ettgk Evdl-KeailL lkdfi DNAA_WOLSP : 1- 9: Eff--KtfnaL idqnk DNAA_WOLSP : 31- 38: dldgv Eeri-Ksr--L gwglv DNAA_WOLSP : 32- 38: ldgve Eri--Ksr--L gwglv Number of patterns evaluated by Pratt:1028 Total running time: 3 seconds