INF381 - Analyse av postgenomiske data

Vårsemesteret 2005

[ Ukeplan ] [ Pensum ] [ CBU-kurs ]

Kurset omfatter forskjellige emner innenfor analyse av data fra stor-skala eksperimentelle metoder i molekylærbiologi. Hovedtemaer vil være mikromatrisedata, proteomikk og genprediksjon.

Offisiell kursbeskrivelse

Foreleser og emneansvarlig

Eivind Coward
Kontor 5109, Datablokken, Høyteknologisenteret, 5. etg.
Tlf: 55584068
E-post: coward@ii.uib.no

Kursopplegg

• Forelesninger

  Forelesningene vil i hovedsak dekke genomikk-delen av pensum (genprediksjon, ontologi, databaser mm.), og det blir forelesninger bare deler av semesteret.

  Forelesningstider:

  • Tirsdager kl. 14:15-16:00, rom 2101
  • Fredager kl. 12:15-14:00, rom 2143

• CBU-kurs i mikromatriser 28/2-4/3 (obligatorisk)

  Kurset vil ta for seg praktiske analysemetoder for mikromatrisedata. En introduksjon til den biologiske og eksperimentelle siden vil bli gitt første dag av kurset.

  Program

• CBU-kurs i proteomikk 11/4-14/4 (obligatorisk)

  Kurset omfatter metoder for analyse av proteomikkdata, f.eks. data fra 2D-gel elektroforese og massespektroskopi-baserte instrumenter.

  Program

• Øvinger

  Det vil bli gitt øvinger til alle deler av pensum. En obligatorisk øving teller 10% av sluttkarakteren.

  Det er satt opp tid til øvinger fredager kl. 14:15-16:00 (ikke noe rom!), men det blir nok mer aktuelt å bruke noen av forelesningene til øvingstimer.

  • Øving 1. Gjennomgang 4/2.
  • Øving 2. Gjennomgang 18/2.
  • Obligatorisk øving. Innleveringsfrist: 28/2.
  • Øving 4. Gjennomgang 8/4.
  • Øving 5 (proteomikk). Ny utgave 22/4! Gjennomgang 26/4.

Eksamen